Discovery of predictive biomarkers for molecular target drug effectiveness of advanced colorectal cancer using phosphoproteomics

使用磷酸蛋白质组学发现晚期结直肠癌分子靶向药物有效性的预测生物标志物

• 批准号: 24659622
• 负责人: TOMONAGA Takeshi
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24659622/
• 关键词: リン酸化プロテオミクス; 分子標的薬; バイオマーカー; 薬効予測; 大腸癌; 大腸がん

For practice of personalized medicine, prediction of molecular target drug effectiveness and selection of sensitive patients to the drug are needed. Effect of drug depends on the activity of growth signals in which the drug is involved. Protein phosphorylation plays a crucial role for the activity of growth signals.We aimed at establishment of comprehensive quantitation method for phosphoproteins and discovery of predictive biomarkers for molecular target drug effectiveness of advanced colorectal cancer using the method. We modified previous phosphoproteomics technologies and succeeded in identification of 30000 phosphopeptides in one experiment. This is the largest study of phosphoproteomics identification to date. We also showed that activity of PDPK1 kinase, a kinase downstream of EGFR signaling pathway, might be involved in sensitivity of an anti-EGFR antibody drug Cetuximab.

个体化用药需要预测分子靶向药物的疗效，筛选对药物敏感的患者。药物的作用取决于药物参与的生长信号的活性。蛋白质磷酸化对生长信号的活性起着至关重要的作用，我们旨在建立磷蛋白的全面定量方法，并利用该方法发现晚期结直肠癌分子靶向药物有效性的预测生物标志物。我们修改了以前的磷酸化蛋白质组学技术，并成功地在一个实验中确定了30000磷酸肽。这是迄今为止最大的磷酸化蛋白质组学鉴定研究。我们还发现，PDPK1激酶（EGFR信号通路下游的激酶）的活性可能与抗EGFR抗体药物西妥昔单抗的敏感性有关。

项目成果

リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索

使用磷酸蛋白质组学寻找新型 DNA 损伤早期反应激酶

• 发表时间: 2011
• 作者: 足立淳;鳴海良平;佐野聖三;久家貴寿;白水崇;松本雅記;中山敬一;井倉正枝;井倉毅;高田穣;朝長毅
• 通讯作者: 朝長毅

質量分析計を用いたバイオマーカー定量法の実用化への挑戦

使用质谱仪的生物标志物定量方法的实际应用面临的挑战

• 发表时间: 2013
• 作者: Liu WC; Wada K;Jarvis ED;Nottebohm F;朝長 毅
• 通讯作者: 朝長 毅

A Novel Mechanism of Keratin Cytoskeleton Organization Through Casein Kinase I Alpha and FAM83H in Colorectal Cancer: Interactome Analysis of FAM83H.

结肠直肠癌中通过酪蛋白激酶 I Alpha 和 FAM83H 形成角蛋白细胞骨架的新机制：FAM83H 的相互作用组分析。

• 发表时间: 2013
• 作者: Kuga T;Kume H;Kawasaki N;Sato M;Adachi J;Shiromizu T;Hoshino I;Matsubara H;Tomonaga T.
• 通讯作者: Tomonaga T.

疾患プロテオミクスの基礎とHuman Proteome Project

疾病蛋白质组学和人类蛋白质组计划基础知识

• 发表时间: 2012
• 作者: Nagano M;Kuga T;Adachi J;Tomonaga T.;朝長毅;朝長毅;朝長毅;朝長毅
• 通讯作者: 朝長毅

ATP Accessibility Screening (AAS), A High-Throughput and High-Resolution Kinase Analysis Platform for Signaling Research.

ATP 可及性筛选 (AAS)，一种用于信号研究的高通量和高分辨率激酶分析平台。

• 发表时间: 2013
• 作者: Adachi J;Higo D;Watanabe S;Kuwano M;Hashimoto Y;Tomonaga T.
• 通讯作者: Tomonaga T.