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Elucidation of mechanisms of myelodysplastic syndrome progression by RNAi screening.

通过 RNAi 筛查阐明骨髓增生异常综合征进展的机制。

基本信息

批准号：
25670445
负责人：
KUROKAWA Mineo
金额：
$ 2.41万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2013
资助国家：
日本
起止时间：
2013-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

The aim of this study is to elucidate the mechanism of resistance to treatment in myelodysplastic syndrome (MDS) patients by using RNA-interference technologies. We employed the small-hairpin RNA plasmid library from the Decipher (Cellcta, Mountain View, CA, USA) and transduced into MDS-derived human cell lines. Transduced cell lines were treated with azacitidine, a first-line drug for MDS patients, for 30 days. Then, we isolated genomic DNA and detected specific barcode sequences for each shRNA plasmid with next-generation sequencing. By comparing the clonal composition with or without azacitidine treatment, we identified 158 candidate genes that may induce the azacitidine resistance in MDS.

本研究的目的是通过RNA干扰技术阐明骨髓增生异常综合征（MDS）患者耐药的机制。我们使用来自Decipher（Cellcta，山景，CA，USA）的小发夹RNA质粒文库并转导到MDS衍生的人细胞系中。转导的细胞系用阿扎胞苷（MDS患者的一线药物）治疗30天。然后，我们分离基因组DNA，并用下一代测序检测每个shRNA质粒的特异性条形码序列。通过比较有或没有阿扎胞苷治疗的克隆组成，我们确定了158个候选基因，可能会导致阿扎胞苷耐药的MDS。

项目成果

期刊论文数量（43）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The effect of decreased-dose idarubicin for elderly patients with acute myeloid leukemia.

减少剂量伊达比星治疗老年急性髓系白血病的疗效。

DOI：
10.1093/jjco/hyt111
发表时间：
2013
期刊：
Jpn J Clin Oncol
影响因子：
2.4
作者：
Kobayashi T;Ichikawa M;Nannya Y;and Kurokawa M.
通讯作者：
and Kurokawa M.

Simultaneous increase in 1,3-β-D-glucan and procalcitonin levels in Pseudomonas aeruginosa infection.

铜绿假单胞菌感染中 1,3-β-D-葡聚糖和降钙素原水平同时升高。

DOI：
10.1016/j.jinf.2013.03.017
发表时间：
2013
期刊：
J Infect
影响因子：
0
作者：
Koya J;Nannya Y;Kobayashi H;Okugawa S;Moriya K;Kurokawa M.
通讯作者：
Kurokawa M.

Transformation of follicular lymphoma in the retroperitoneal muscles demonstrated by CT-guided needle biopsy of FDG-avid lesions; case series

CT 引导下 FDG 聚集病灶针吸活检证实腹膜后肌肉滤泡性淋巴瘤转化；

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
Int J Clin Exp Pathol
影响因子：
0
作者：
Uni M;Nakamura F;Yoshimi A;Shinozaki-Ushiku A;Hosoi A;Nakazaki K;Nannya Y;Fukayama M;and Kurokawa M.
通讯作者：
and Kurokawa M.

自体造血干细胞移植受者中微球菌引起的导管相关性败血性休克

DOI：
10.1016/j.ajic.2013.07.010
发表时间：
2013
期刊：
Am J Infect Control.
影响因子：
0
作者：
Kogure Y;Nakamura F;Nukina A;Kamikubo Y;Ichikawa M;Kurokawa M;Kamikubo Y;Kurokawa M
通讯作者：
Kurokawa M

Moxifloxacin is more effective than tosufloxacin in reducing chemotherapy-induced febrile neutropneia in patients with hematological malignancies.

莫西沙星在减少血液恶性肿瘤患者化疗引起的发热性中性粒细胞减少方面比托舒沙星更有效。