NGS - Hochdurchsatz-Sequenziergerät in Kombination mit einem Gerät zur Einzelzellaufarbeitung

NGS - 高通量测序设备与单细胞处理设备相结合

• 批准号: 398813235
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Klinische Chemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Major Research Instrumentation
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2017-12-31 至 无数据
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/398813235?language=en
• 关键词: NGS; Hochdurchsatz; Sequenzierger; Kombination; mit

Im Rahmen der Stärkung der naturwissenschaftlichen und grundlagenorientierten Forschung der Medizinischen Fakultät Mannheim sind aktuell bedeutende infrastrukturelle Maßnahmen geplant, dazu zählt unter anderem der Ausbau von Core Facilities. Außerdem werden durch eine Reihe neuer Professoren verstärkt grundlagenwissenschaftliche Themen der Zell- und Molekularbiologie an der Medizinischen Fakultät Mannheim bearbeitet. Dabei richtet sich das zunehmende Interesse auf die Einzelzellanalytik und damit auf die Nutzung von Techniken, die in zwei Schritten die Einzelzellverarbeitung/Library-Erstellung und die massiv parallele Sequenzierung/quantitative Genexpressionsanalyse verbinden. Entsprechend beantragen wir zur Deckung dieses Bedarfs für die zentrale NGS Core Facility der Fakultät eine Gerätekombination bestehend aus einer Einzelzellanalyseplattform und angeschlossener Next-Generation-Sequencing. Circa 10 Arbeitsgruppen planen umfangreiche Experimente, deren Durchführung teilweise Single Cell Anwendungen benötigen, aber in allen Fällen ein Hochdurchsatz-Sequenziergerät der aktuellen Leistungsklasse. Die Systeme werden für die Untersuchung von Immunrezeptoren auf Einzelzellebene, die Charakterisierung tumor-assoziierter Makrophagen, die Durchführung klinisch-translationaler Studien zur Nutzbarkeit molekularer Biomarker, der funktionellen Charakterisierung zirkulierender Nukleinsäuren, zur Analyse des Einflusses des Virulenzfaktors TcpC des uropathogenen E.coli Stamms CFT073 auf das Transkriptom von Zellen des innaten Immunsytems, der Analyse der Diversität des Darmmikrobioms bei Patienten nach Knochenmarktransplantation sowie seiner Relevanz für septische Komplikationen, Transkriptomanalyse zur Charakterisierung der NK-Zelldiversität bei Leberschaden, Identifikation möglicher Alzheimer-Früherkennungsmarker, Charakterisierung relevanter Gene bei Thrombozytopathien, des ribosomalen Footprintings sowie der Kinetik des mRNA-Abbaus auf Einzelzellebene.

我是曼海姆医疗机构的自然科学和基础方向研究人员，致力于基础设施建设，并致力于核心设施的建设。教授在曼海姆医学学院的泽尔和分子生物学主题方面进行了深入研究。 Dabei richtet sich das zunehmende Interesse auf die inzelzellanalytik and damit auf die Nutzung von Techniken, die in zwei Schritten die Einzelzellverarbeitung/Library-Estellung and die Massiv paralle Sequenzierung/quantitative Genexpressanalysis verbinden.介绍 NGS 核心设施的基础设施，以实现 Einzelzell 分析平台和下一代测序的最佳组合。大约 10 年，Arbeitsgruppen planen umfangreiche Experimente，deren Durchführung teilweise Single Cell Anwendungen Benötigen，在 allen Fällen ein Hochdurchsatz-Sequenziergerät der aktuellen Leistungsklasse 中进行。免疫抑制的系统研究、肿瘤相关巨噬细胞的特性、分子生物学研究的临床翻译研究、生物标志物的功能特性 核分析，尿路病原体大肠杆菌 Stamms CFT073 病毒感染因子 TcpC 分析与先天免疫系统转染，患者与 Knochenmark 移植相关的疾病多样性分析 脓毒症综合分析、NK-Zelldiversität bei Leberschaden 的特征转译分析、阿尔茨海默病标记物的识别、血栓病患者基因的相关特征、核糖体足迹的动力学分析 mRNA-Abbaus auf Einzelzellebene。