NGS - Hochdurchsatz-Sequenziergerät in Kombination mit einem Gerät zur Einzelzellaufarbeitung

NGS - 高通量测序设备与单细胞处理设备相结合

• 批准号: 398813235
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Klinische Chemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Major Research Instrumentation
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2017-12-31 至 无数据
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/398813235?language=en
• 关键词: NGS; Hochdurchsatz; Sequenzierger; Kombination; mit

Im Rahmen der Stärkung der naturwissenschaftlichen und grundlagenorientierten Forschung der Medizinischen Fakultät Mannheim sind aktuell bedeutende infrastrukturelle Maßnahmen geplant, dazu zählt unter anderem der Ausbau von Core Facilities. Außerdem werden durch eine Reihe neuer Professoren verstärkt grundlagenwissenschaftliche Themen der Zell- und Molekularbiologie an der Medizinischen Fakultät Mannheim bearbeitet. Dabei richtet sich das zunehmende Interesse auf die Einzelzellanalytik und damit auf die Nutzung von Techniken, die in zwei Schritten die Einzelzellverarbeitung/Library-Erstellung und die massiv parallele Sequenzierung/quantitative Genexpressionsanalyse verbinden. Entsprechend beantragen wir zur Deckung dieses Bedarfs für die zentrale NGS Core Facility der Fakultät eine Gerätekombination bestehend aus einer Einzelzellanalyseplattform und angeschlossener Next-Generation-Sequencing. Circa 10 Arbeitsgruppen planen umfangreiche Experimente, deren Durchführung teilweise Single Cell Anwendungen benötigen, aber in allen Fällen ein Hochdurchsatz-Sequenziergerät der aktuellen Leistungsklasse. Die Systeme werden für die Untersuchung von Immunrezeptoren auf Einzelzellebene, die Charakterisierung tumor-assoziierter Makrophagen, die Durchführung klinisch-translationaler Studien zur Nutzbarkeit molekularer Biomarker, der funktionellen Charakterisierung zirkulierender Nukleinsäuren, zur Analyse des Einflusses des Virulenzfaktors TcpC des uropathogenen E.coli Stamms CFT073 auf das Transkriptom von Zellen des innaten Immunsytems, der Analyse der Diversität des Darmmikrobioms bei Patienten nach Knochenmarktransplantation sowie seiner Relevanz für septische Komplikationen, Transkriptomanalyse zur Charakterisierung der NK-Zelldiversität bei Leberschaden, Identifikation möglicher Alzheimer-Früherkennungsmarker, Charakterisierung relevanter Gene bei Thrombozytopathien, des ribosomalen Footprintings sowie der Kinetik des mRNA-Abbaus auf Einzelzellebene.

我是Rahmen der Stärkung der naturwissenschaftlichen和grundlagenorientierten Forschung der Medizinischen Fakultät曼海姆（Mannheim）和aktuell bedeutende infrastrukturelle Maßnahmen geplant， dazu zählt under anderem der Ausbau von Core Facilities。auß ßerdem werden durch eine Reihe neer教授verstärkt grundlagenwissenschaftliche教授与分子生物学和医学博士Fakultät Mannheim bearbeitet。Dabei richtet sich das zunehmende Interesse auf die Einzelzellanalytik and damit auf die Nutzung von Techniken, die in zwei Schritten die Einzelzellverarbeitung/Library-Erstellung and die massiv parallel Sequenzierung/quantitative Genexpressionsanalyse verbinden。ensprechend beantragen wir zur Deckung - dieses Bedarfs f<e:1> r die zentrale NGS Core Facility der Fakultät eine Gerätekombination bestehend for einzelzellanalyseplatform and angeschlorssener next - generation sequencing。Circa 10 Arbeitsgruppen planen unfangreiche Experimente， deren durchfhrung teilweise单细胞Anwendungen benötigen， aber in allen Fällen ein Hochdurchsatz-Sequenziergerät der aktuellen Leistungsklasse。Die Systeme werden f<e:1>, Die Charakterisierung tumor- assozierter Makrophagen, Die Charakterisierung klinisch-translationaler studen zur Nutzbarkeit molecular Biomarker, der funktionellen Charakterisierung zirkulierender Nukleinsäuren， zur Analyse des Einflusses des Virulenzfaktors TcpC des uro病原菌E.coli Stamms CFT073 auf das Transkriptom von Zellen des innate immunns，der分析der Diversität des darmmicrobioms bei Patienten nach Knochenmarktransplantation sowie seiner Relevanz fr septische Komplikationen，转录组分析zur Charakterisierung der NK-Zelldiversität bei Leberschaden，鉴定möglicher阿尔茨海默病<s:2> herkennngsmarker， Charakterisierung相关基因bethrombozytopathien，核糖体蛋白足迹sowie der Kinetik des mRNA-Abbaus auf Einzelzellebene。