Carcinogenesis of oropharyngeal cancer correlated with HPV infection and DNA methylation

口咽癌的发生与HPV感染和DNA甲基化相关

• 批准号: 18K16831
• 负责人: 中川 拓也
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-12-19 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K16831/
• 关键词: DNAメチル化; HPV; 中咽頭癌; エピゲノム; 層別化マーカー

HPVという革新的な予後予測因子の背景に存在する新たな発癌分子機構を探索し、リスク層別化による治療の最適化を行うため、申請者らはHPV感染とDNAメチル 化の関係に着目した。170例の中咽頭癌に対して網羅的DNAメチル化解析の後にクラスター解析を行ったところ、中咽頭癌は4群に分類され、HPV関連中咽頭癌、 HPV陰性中咽頭癌それぞれにおいて異なる2つのエピジェノタイプが存在することが明らかとなった。特にHPV(+)高メチル化群は予後良好と、HPV(-)中メチル化群 は予後不良と有意に相関し、HPV(+)群のみならずHPV(-)群においても中等度リスクを反映するサブタイプが存在した。同検体に対して施行したターゲットエクソンシークエンスでは、HPV(+)群、HPV(-)群それぞれの2群間に有意な遺伝子変異の違いは存在しなかった。すなわち、これまで困難であった中咽頭癌 の予後層別化が、エピゲノム情報により初めて詳細に予後層別化されることが明らかとなった。 さらに、これらの各群を層別化する代表的マーカー遺伝子の探索とその妥当性を検証するために、パイロシークエンス法による解析を行った。高メチル化マー カーの感度は79%、特異度100%で、中メチル化マーカーでは感度88%、特異度100%であった。ROC曲線のAUC値はそれぞれ0.969、0.952と高精度のマーカーであるこ とが確認された。これらのマーカー遺伝子を用いることで比較的簡便に層別化を行うことが可能となり、治療層別化の一助となる。これらの結果から、これまで に解明された分子経路に加え、独自の新規治療戦略の基盤が構築され、より明瞭な治療層別化の足掛かりとなることが期待される。これらの成果はInt. J. Cancer誌に掲載予定である。

The background of HPV infection prediction factors, the exploration of new molecular mechanisms for cancer detection, the optimization of treatment, and the relationship between HPV infection and DNA detection by applicants 170 cases of pharyngeal cancer were analyzed by DNA sequencing, and four groups of pharyngeal cancer were classified. HPV associated pharyngeal cancer and HPV negative pharyngeal cancer were classified by DNA sequencing. In particular, HPV(+) high level of HPV(-) high level HPV(-) high level There are two groups of HPV, HPV(+) group and HPV(-) group. There are two groups of HPV, HPV(+) group and HPV(-) group. For example, if you want to know more about cancer, please contact us. The analysis of the validity of the classification of each group is carried out High sensitivity 79%, specificity 100%, medium sensitivity 88%, specificity 100%. ROC curve AUC value is 0.969, 0.952 and high precision is confirmed. This is a simple way to differentiate between treatment and treatment. The results show that the molecular pathway is enhanced, the new treatment strategy is constructed, and the treatment stratification is expected. Int. J. Cancer Annals are published in a fixed way.

项目成果

Classification of HPV-associated oropharyngeal cancer by definition of DNA methylation epigenotypes

根据 DNA 甲基化表观基因型的定义对 HPV 相关口咽癌进行分类

• 发表时间: 2018
• 作者: Nakagawa T;Matsusaka K;Misawa K;Takane K;Fukuyo M;Rahmutulla B;Shinohara K;Ota S;Kunii N;Sakurai D;Hanazawa T;Okamoto Y;Kaneda A.
• 通讯作者: Kaneda A.

遺伝子医学

基因医学

• 发表时间: 2022
• 作者: 宮本 潤基;木村 郁夫
• 通讯作者: 木村 郁夫

Stratification of HPV-associated and HPV-negative oropharyngeal squamous cell carcinomas based on DNA methylation epigenotypes

• DOI: 10.1002/ijc.32890
• 发表时间: 2020-02-11
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
• 影响因子: 6.4
• 作者: Nakagawa, Takuya;Matsusaka, Keisuke;Kaneda, Atsushi
• 通讯作者: Kaneda, Atsushi

ChIP-seqを用いたレチノイン酸の抗腫瘍効果の解明

使用 ChIP-seq 阐明视黄酸的抗肿瘤作用

• 发表时间: 2019
• 作者: 中川拓也;松坂恵介;福世真樹;美馬勝人;黒川友哉;國井直樹;櫻井大樹;三澤清,花澤豊行;岡本美孝;金田篤志
• 通讯作者: 金田篤志

Elucidation of antitumor effect of retinoic acid using ChIP-seq.

使用 ChIP-seq 阐明视黄酸的抗肿瘤作用。

• 发表时间: 2019
• 作者: Takuya Nakagawa;Yasunobu Mano;Masaki Fukuyo;Masato Mima;Tomoya Kurokawa;Daiju Sakurai;Toyoyuki Hanazawa;Atsushi Kaneda
• 通讯作者: Atsushi Kaneda