祖先的な亜硫酸生成反応の起源に迫る酵素の探索
祖先的な亜硫酸生成反応の起源に迫る酵素の探索
批准号:
21K14025
负责人:
渡邉 友浩
金额:
$3.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
初期の地球生命のエネルギー代謝は、亜硫酸によって支えられていた可能性がある。このため、亜硫酸の還元あるいは合成反応を推進するシロヘム含有酵素は、生命進化の指標として研究されてきた。ところが近年、シロヘム含有酵素とは全く異なる酵素が亜硫酸の合成反応を推進する可能性が提案された。この亜硫酸合成反応は、現存する一部の硫黄酸化菌のエネルギー代謝から予想されており、ヘテロジスルフィド還元酵素様の酵素複合体(以下、sHdr)と未知の酵素の共役反応によって推進されると考えられている。本研究では、この未知酵素の正体を比較ゲノムおよび比較トランスクリプトーム解析で検討した。sHdrをコードする5種の硫黄酸化菌と、コードしない2種の硫黄酸化菌を含むSulfuricellaceae科のゲノムを比較した。この結果、sHdrをコードするゲノムにユニークな約200の遺伝子を同定した。約200遺伝子のうち、亜硫酸を生じる際にその発現量を増加する遺伝子をトランスクリプトーム解析によって探索した。この結果、亜硫酸を生じる際に発現量を増加する遺伝子は50/200であり、そのうち48遺伝子の推定機能は亜硫酸とは関係のないものであった。残り2遺伝子の機能は未知であったが、これらはsHdrをコードする他の硫黄酸化菌には保存されていなかった。以上の結果より、亜硫酸合成を推進する未知酵素の存在は否定された。一方で、亜硫酸を生じる条件で培養した5種の硫黄酸化菌のトランスクリプトームにおいて、sHdr遺伝子群の発現量はその全てにおいて極めて高いレベルであった。以上の結果より、sHdrは単独で亜硫酸合成反応を推進すると考えられる。
英文摘要
初期の地球生命のエネルギー代謝は、亜硫酸によって支えられていた可能性がある。このため、亜硫酸の還元あるいは合成反応を推進するシロヘム含有酵素は、生命進化の指標として研究されてきた。ところが近年、シロヘム含有酵素とは全く異なる酵素が亜硫酸の合成反応を推進する可能性が提案された。この亜硫酸合成反応は、現存する一部の硫黄酸化菌のエネルギー代謝から予想されており、ヘテロジスルフィド還元酵素様の酵素複合体(以下、sHdr)と未知の酵素の共役反応によって推進されると考えられている。本研究では、この未知酵素の正体を比較ゲノムおよび比較トランスクリプトーム解析で検討した。sHdrをコードする5種の硫黄酸化菌と、コードしない2種の硫黄酸化菌を含むSulfuricellaceae科のゲノムを比較した。この結果、sHdrをコードするゲノムにユニークな約200の遺伝子を同定した。約200遺伝子のうち、亜硫酸を生じる際にその発現量を増加する遺伝子をトランスクリプトーム解析によって探索した。この結果、亜硫酸を生じる際に発現量を増加する遺伝子は50/200であり、そのうち48遺伝子の推定機能は亜硫酸とは関係のないものであった。残り2遺伝子の機能は未知であったが、これらはsHdrをコードする他の硫黄酸化菌には保存されていなかった。以上の結果より、亜硫酸合成を推進する未知酵素の存在は否定された。一方で、亜硫酸を生じる条件で培養した5種の硫黄酸化菌のトランスクリプトームにおいて、sHdr遺伝子群の発現量はその全てにおいて極めて高いレベルであった。以上の結果より、sHdrは単独で亜硫酸合成反応を推進すると考えられる。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Three-megadalton complex of methanogenic electron-bifurcating and CO2-fixing enzymes
产甲烷电子分叉和二氧化碳固定酶的三兆道尔顿复合物
DOI:
10.1126/science.abg5550
发表时间:
2021
期刊:
Science
影响因子:
56.9
作者:
[Watanabe Tomohiro, Pfeil-Gardiner Olivia, Kahnt Joerg, Koch Juergen, Shima Seigo, Murphy Bonnie J.]
通讯作者:
Murphy Bonnie J.
メタン菌の電子管理術:エネルギーに乏しい環境に特化した酵素機構
甲烷细菌的电子管理:专门针对能源匮乏环境的酶机制
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[渡邉友浩,Olivia Pfeil-Gardiner, Joerg Kahnt, Juergen Koch, 嶋盛吾, Bonnie J. Murphy]
通讯作者:
Bonnie J. Murphy
Transcriptomic analysis of tetrathionate oxidation by freshwater sulfur-oxidizing bacteria in the family Sulfuricellaceae
硫酸菌科淡水硫氧化细菌连四硫酸盐氧化的转录组分析
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tomohiro Watanabe, Tomofumi Nomura, Jackson Tsuji, Manabu Fukui]
通讯作者:
Manabu Fukui
硫黄酸化細菌におけるテトラチオン酸酸化経路の検討
硫氧化细菌中连四硫酸盐氧化途径的检查
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[野村朋史, 渡邉友浩, 福井学]
通讯作者:
福井学
硫黄温泉周辺の沼に発達する微生物マットの特徴づけ
硫磺温泉周围沼泽中发育的微生物垫的特征
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[林沙弥香, 渡邉友浩, 福井学]
通讯作者:
福井学
亜硫酸を使うエネルギー代謝の起源に迫る酵素反応の検証
-
批准号:23K25979
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$5.82万
-
财政年份:2024
-
负责人:渡邉 友浩
-
依托单位:
Testing the key enzyme reaction for an ancient energy metabolism involving sulfite
-
批准号:23H01283
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$12.15万
-
财政年份:2023
-
负责人:渡邉 友浩
-
依托单位:
海外基金