X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
批准号:
15770067
负责人:
栗栖 源嗣
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
一般にフェレドキシン(Fd)とFd依存性酵素間の電子の授受は電子伝達複合体を形成して行なわれることが知られている。共同研究者の大阪大学長谷教授グループによるFd改変体を用いた相互作用実験から、種々の還元酵素はそれぞれFdの異なったアミノ酸残基を認識しているという興味深い実験結果が報告されている(J.Biol.Chem.274,29399(1999))。電子伝達複合体の形成様式が電子を受け取る側の酵素の種類によって個別的であることは、炭素、窒素、硫黄の各代謝系へ光還元力を分配する位置にあるFdが構造のレベルで電子伝達を制御している可能性を示している。今回、本若手研究において硫黄同化において重要な役割を担う亜硫酸還元酵素とFdとの複合体の結晶構造解析に成功した。構造解析に成功したのは、正方晶系(P4_12_12,a=103.324,b=103.324,c=255.088Å,α,β,γ=90°)の結晶である。X線回折強度データ収集は高エネルギー加速器研究機構、物質構造科学研究所、放射光研究施設において行い、亜硫酸還元酵素とFdに含まれる鉄原子の吸収端近傍に於ける多波長異常分散法により構造解析した。鉄原子の異常分散差を係数とした差フーリエマップ上にシロヘム、4Fe-4Sクラスター、それにフェレドキシンの2Fe-2Sクラスターに含まれる鉄原子12個を確認している。現在、2.2Å分解能で分子モデルを構築中である。まだ分子モデルを構築中なので、現段階では正確な分子構造について考察することは出来ないが、シロヘム、4Fe-4Sクラスター、フェレドキシンの2Fe-2Sクラスターの3つの酸化還元中心間の距離は、それぞれ4.3,13.8Åである。
英文摘要
一般にフェレドキシン(Fd)とFd依存性酵素間の電子の授受は電子伝達複合体を形成して行なわれることが知られている。共同研究者の大阪大学長谷教授グループによるFd改変体を用いた相互作用実験から、種々の還元酵素はそれぞれFdの異なったアミノ酸残基を認識しているという興味深い実験結果が報告されている(J.Biol.Chem.274,29399(1999))。電子伝達複合体の形成様式が電子を受け取る側の酵素の種類によって個別的であることは、炭素、窒素、硫黄の各代謝系へ光還元力を分配する位置にあるFdが構造のレベルで電子伝達を制御している可能性を示している。今回、本若手研究において硫黄同化において重要な役割を担う亜硫酸還元酵素とFdとの複合体の結晶構造解析に成功した。構造解析に成功したのは、正方晶系(P4_12_12,a=103.324,b=103.324,c=255.088Å,α,β,γ=90°)の結晶である。X線回折強度データ収集は高エネルギー加速器研究機構、物質構造科学研究所、放射光研究施設において行い、亜硫酸還元酵素とFdに含まれる鉄原子の吸収端近傍に於ける多波長異常分散法により構造解析した。鉄原子の異常分散差を係数とした差フーリエマップ上にシロヘム、4Fe-4Sクラスター、それにフェレドキシンの2Fe-2Sクラスターに含まれる鉄原子12個を確認している。現在、2.2Å分解能で分子モデルを構築中である。まだ分子モデルを構築中なので、現段階では正確な分子構造について考察することは出来ないが、シロヘム、4Fe-4Sクラスター、フェレドキシンの2Fe-2Sクラスターの3つの酸化還元中心間の距離は、それぞれ4.3,13.8Åである。
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立体構造をもとに考えるシトクロムb_6f複合体の光合成電子伝達
基于3D结构的细胞色素b_6f复合物的光合电子转移
DOI:
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发表时间:
2004
期刊:
生物物理 44
影响因子:
--
作者:
[G.T.Hanke, G.Kurisu, M.Kusunoki, T.Hase, 栗栖源嗣]
通讯作者:
栗栖源嗣
K.Teshima: "A ferredoxin Arg-Glu pair important for efficient electron transfer between ferredoxin and ferredoxin-NADP^+ reductase"FEBS Letters. 546. 189-194 (2003)
K.Teshima:“铁氧还蛋白 Arg-Glu 对对于铁氧还蛋白和铁氧还蛋白-NADP^还原酶之间的有效电子转移非常重要”FEBS Letters。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Miyake: "Crystal Structure of a Catalytic Site Mutant of β-Amylase from Bacillus cereus var.mycoides Cocrystallized with Maltopentaose"Biochemistry. 42. 5574-5581 (2003)
H. Miyake:“与麦芽五糖共结晶的蜡样芽孢杆菌 β-淀粉酶催化位点突变体的晶体结构”生物化学 42. 5574-5581 (2003)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
A Structural basis of Equisetum arvense Ferredoxin isoform II producing an alternative election transfer with Ferredoxin-NADP+ reductase
木贼铁氧还蛋白亚型 II 的结构基础,利用铁氧还蛋白-NADP 还原酶产生替代性选举转移
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Biological Chemistry 280
影响因子:
--
作者:
[G.Kurisu, D.Nishiyama, M.Kusunoki, S.Fujikawa, M.Katoh, G.T.Hanke, T.Hase, K.Teshima]
通讯作者:
K.Teshima
H.Zhang: "A defined protein-detergent-lipid complex for crystallization of integral membrane proteins : The Cytochrome b_6f complex of oxygenic photosyntheisis"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 100. 5160-5163 (2003)
H.Zhang:“用于整合膜蛋白结晶的确定的蛋白质-去污剂-脂质复合物:含氧光合作用的细胞色素b_6f复合物”Proc.Natl.Acad.Sci.USA。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
Structural analysis of the complex between Fd and Fd-dependent proteins considering their redox states strictly
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批准号:21H02417
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2021
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
複合体X線解析で解明する葉緑体内還元力分配システムの構造基盤
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批准号:21687008
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$14.56万
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财政年份:2009
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線構造解析
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批准号:20051006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2008
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
膜面新規ヘム鉄の役割解明を目指す高等植物チトクロムb6f複合体のX線構造解析
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批准号:19036003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.35万
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财政年份:2007
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線による原子レベル構造研究
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批准号:18054008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.67万
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财政年份:2006
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
巨大モーター蛋白質ダイニンのX線結晶構造に基づいた機能解析
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批准号:17053006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
複合体結晶構造解析で明らかにする高等植物に特有な光還元力分配システムの構造基盤
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批准号:17687008
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$19.3万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
光合成循環電子伝達を制御するチトクロム複合体とフェレドキシンとの相互作用解析
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批准号:17048005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2005
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
立体構造から探るフェレドキシン依存性循環電子伝達でのチトクロムb_6f複合体の役割
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批准号:16048217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
X線結晶解析法によるフェレドキシンと亜硫酸還元酵素による電子伝達複合体の構造研究
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批准号:14780474
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2002
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
機能を制御する水素結合を直接見る金属蛋白質の超高分解能X線結晶解析
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批准号:12740365
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
時間分割X線解析法によるUDP-Glcピロホスホリラーゼの反応機構の可視化
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批准号:10780384
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:栗栖 源嗣
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依托单位:
海外基金