細菌による花形態遠隔操作メカニズムの解明と汎用的な花形態制御技術開発への応用
細菌による花形態遠隔操作メカニズムの解明と汎用的な花形態制御技術開発への応用
批准号:
21K14847
负责人:
北沢 優悟
金额:
$3.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
本研究では、植物病原細菌ファイトプラズマが篩部に分泌するタンパク質ファイロジェンが、花の形態を「遠隔制御」する機構を解析するとともに、ファイロジェンの標的認識部位を解明・改変し、花形態の自在な制御を可能とすることを目指す。本年度は主に、ファイロジェンの標的認識部位の解明とその改変に取り組んだ。ファイロジェンにランダムにアミノ酸変異を導入し、標的であるMADS転写因子との結合が強まる変異を選抜し、目的のアミノ酸変異を複数得ることに成功した。これらのアミノ酸はファイロジェンの立体構造上の特定の領域に集中して存在しており、当該領域がMADS転写因子との結合に働く標的認識領域であると考えられた。また、同様の手法を用いて、本来標的ではないMADS転写因子に対しての結合を強めるアミノ酸変異も選抜することができた。さらに、AIによる高精度なタンパク質構造および複合体予測プログラムであるColabFoldを用いて、ファイロジェンとMADS転写因子からなる複合体の構造予測を実施した。その結果、実験で絞り込まれた領域が、MADS転写因子側で既に明らかとなっているファイロジェンとの結合に重要な領域と、相互作用面を形成することが予測された。以上より、ファイロジェンにおけるMADS転写因子との結合に働く領域が特定され、ファイロジェンとMADS転写因子の結合モデルを構築できた。これはファイロジェンの標的認識部位の改変に向けた基盤的知見と考えられる。
英文摘要
本研究では、植物病原細菌ファイトプラズマが篩部に分泌するタンパク質ファイロジェンが、花の形態を「遠隔制御」する機構を解析するとともに、ファイロジェンの標的認識部位を解明・改変し、花形態の自在な制御を可能とすることを目指す。本年度は主に、ファイロジェンの標的認識部位の解明とその改変に取り組んだ。ファイロジェンにランダムにアミノ酸変異を導入し、標的であるMADS転写因子との結合が強まる変異を選抜し、目的のアミノ酸変異を複数得ることに成功した。これらのアミノ酸はファイロジェンの立体構造上の特定の領域に集中して存在しており、当該領域がMADS転写因子との結合に働く標的認識領域であると考えられた。また、同様の手法を用いて、本来標的ではないMADS転写因子に対しての結合を強めるアミノ酸変異も選抜することができた。さらに、AIによる高精度なタンパク質構造および複合体予測プログラムであるColabFoldを用いて、ファイロジェンとMADS転写因子からなる複合体の構造予測を実施した。その結果、実験で絞り込まれた領域が、MADS転写因子側で既に明らかとなっているファイロジェンとの結合に重要な領域と、相互作用面を形成することが予測された。以上より、ファイロジェンにおけるMADS転写因子との結合に働く領域が特定され、ファイロジェンとMADS転写因子の結合モデルを構築できた。これはファイロジェンの標的認識部位の改変に向けた基盤的知見と考えられる。
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タンパク質の新たな分解システム ―ファイロジェンによる葉化誘導メカニズム解明で発見!
一种新的蛋白质降解系统 - 通过阐明叶序诱导叶子形成的机制而发现!
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
ファイロジェンとMADSドメイン転写因子の結合に影響するアミノ酸残基はひとつの相互作用面を形成する
影响系统发育因子和 MADS 结构域转录因子结合的氨基酸残基形成相互作用表面
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[北沢 優悟, 松山 樹立, 岩渕 望, 前島 健作, 松本 旺樹, 鈴木 誠人, 鯉沼 宏章, 大島 研郎, 難波 成任, 山次 康幸]
通讯作者:
山次 康幸
プロテインノックダウン技術の確立に一歩近づく
距离建立蛋白质敲除技术又近了一步
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
ファイロジェンは宿主因子の保存領域を相互作用の標的とする
系统原针对宿主因子的保守区域进行相互作用
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Harada Ken-ichi, Furuita Kyoko, Yamashita Eiki, Taoka Ken-ichiro, Tsuji Hiroyuki, Fujiwara Toshimichi, Nakagawa Atsushi, Kojima Chojiro, 鈴木誠人・北沢優悟・岩淵 望・ 松本旺樹・山本桐也・前島健作・ 大島研郎・難波成任・山次康幸]
通讯作者:
鈴木誠人・北沢優悟・岩淵 望・ 松本旺樹・山本桐也・前島健作・ 大島研郎・難波成任・山次康幸
DOI:
10.1093/plcell/koac062
发表时间:
2022-03-02
期刊:
PLANT CELL
影响因子:
11.6
作者:
[Kitazawa, Yugo, Iwabuchi, Nozomu, Yamaji, Yasuyuki]
通讯作者:
Yamaji, Yasuyuki
共 8 条
篩部局在性細菌のコアエフェクターを介した感染機構の解明と防除戦略構築への応用
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批准号:24K08908
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:北沢 優悟
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依托单位:
ファイトプラズマの病原性因子機能阻害ペプチド開発による防除戦略構築
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批准号:15J11207
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:北沢 優悟
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依托单位:
海外基金