ゲルマイクロドロップレットによる難培養微生物の培養と抗がん化合物の探索

利用凝胶微滴培养难以培养的微生物并寻找抗癌化合物

• 批准号: 21K14953
• 负责人: 市川 俊輔
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14953/
• 关键词: 土壌微生物; Water in oil ドロップレット; ゲルマイクロドロップレット; 難培養微生物; 二次代謝産物

土壌中には多様な細菌が存在しているが、大部分の微生物は未探索な状況であり、これら微生物の培養方法の確立と生理活性探索の方法を確立することが求められている。 多くの細菌は増殖が遅く、また他の微生物由来の化合物を要求するために、培養することが難しい。ドロップレットへの微生物包埋と複合培養は、微生物間の化合物相互作用を維持しながら、液体培地中で多種の細菌を分離培養できるために、難培養微生物を培養するための方法として期待されている。本研究ではまず、Water in oil (W/O)ドロップレットおよびGel microdroplet (GMD)中に土壌微生物を包埋し、25℃で複合培養した。培養前および培養７日目での各培養液中の細菌叢を比較した。単純に土壌微生物を複合培養するとその多様性は失われてしまうことが、一方でW/OドロップレットおよびGMD包埋により、複合培養時の細菌叢の多様性は保持されることがわかった。もちいた土壌はAcidiferrimicrobium, Janthinobacterium, Flavobacteriumを含む多様な細菌で構成されていた。ドロップレット包埋をせず複合培養した場合、Rahnella, Bacillus, Pseudomonasが優占した。W/Oドロップレット包埋して複合培養した場合、Pseudomonas, Acinetobacter, Arthrobacter, Brevibacterium, Delftiaなどが、GMD包埋して複合培養した場合、Bradyrhizobium, Agrobacterium, Terracoccus, Arthrobacter, Rhizobiumなどが多く検出された。以上の通り、W/OドロップレットまたはGMDを用いることで、異なる菌叢で構成された複合微生物培養液を調製できる可能性が示された。

Bacteria in the soil 壌 に は many others な が exist し て い る が, most の microbial は unexplored な condition で あ り, こ れ ら microbial の cultivation method と の established physiologically active exploration の を establish す る こ と が o め ら れ て い る. Many く <s:1> bacteria <s:1> multiply が遅く, また other <s:1> microorganisms originate from <s:1> compounds を requirements するために, and the cultivation of する する とが is difficult to <s:1>. ド ロ ッ プ レ ッ ト へ の microbial embedding と の compound interaction between composite は, microbial を maintain し な が ら, liquid separation in the petty で multiple を の bacteria cultivation で き る た め に, difficult cultivation microbial を す る た め の way と し て expect さ れ て い る. This study で は ま ず, Water in oil (W/O) ド ロ ッ プ レ ッ ト お よ び Gel microdroplet (GMD) 壌 に in soil microbial を embedding し, 25 ℃ で compound cultivation し た. Before culture, および culture for 7 days で comparison of the <s:1> bacterial flora in each culture medium を た 単 pure 壌 に soil microbial を compound cultivation す る と そ の multiple others lost は わ れ て し ま う こ と が, one party で W/O ド ロ ッ プ レ ッ ト お よ び GMD embedding に よ り, compound cultivation の bacterial flora の multiple others は keep さ れ る こ と が わ か っ た. Youdaoplaceholder0 ち た soil ち Acidiferrimicrobium, Janthinobacterium, Flavobacteriumを contains む multiple な bacteria で and is composed of されて た た た た. Youdaoplaceholder0 embedding をせず co-culture <s:1> た, Rahnella, Bacillus, Pseudomonasが dominance た た. W/Oドロップレット embedding て co-culture <s:1> た occasion, Pseudomonas, Acinetobacter, Arthrobacter, Brevibacterium Delftiaな が が が, GMD embedded て compound culture <s:1> た, Bradyrhizobium, Agrobacterium, Terracoccus, Arthrobacter, Rhizobiumな が が mostly く検. Youdaoplaceholder7. Above の り, W/O ド ロ ッ プ レ ッ ト ま た は GMD を with い る こ と で, different な る flora で constitute さ れ た を compound microbial cultures of modulation で き が る possibility in さ れ た.

项目成果

Cellulose degradation mechanism of a cellulolytic bacterium Clostridium thermocellum

纤维素分解菌热纤梭菌的纤维素降解机制

• 发表时间: 2021
• 作者: 宋 閻徳嘉・細谷忠嗣・安田章人・芦塚由紀・小林孝行・西村直人・錦谷まりこ;Shunsuke Ichikawa
• 通讯作者: Shunsuke Ichikawa

三重県土壌由来Bacillus属細菌の抗がん活性とそのゲノム解析

三重县土壤中芽孢杆菌的抗癌活性和基因组分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 市川 俊輔;勝尾 徳斗;岡﨑 文美;中山 寛子;西村 訓弘;島田 康人
• 通讯作者: 島田 康人

マイクロドロップレットを用いた土壌微生物複合培養とその菌叢解析

土壤微生物复合体微滴培养及其菌群分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 市川 俊輔;本間 宣行;勝尾 徳斗;石毛 真行
• 通讯作者: 石毛 真行

The expression of alternative sigma-I7 factor induces the transcription of cellulosomal genes in the cellulolytic bacterium Clostridium thermocellum

替代 sigma-I7 因子的表达诱导纤维素分解细菌热纤梭菌中纤维素体基因的转录

• DOI: 10.1016/j.enzmictec.2022.110002
• 发表时间: 2022
• 期刊: Enzyme and Microbial Technology
• 影响因子: 3.4
• 作者: Ichikawa Shunsuke;Ito Daisuke;Asaoka Sayuri;Abe Reimi;Katsuo Norito;Ito Toshiyuki;Ito Daichi;Karita Shuichi
• 通讯作者: Karita Shuichi

UV-LED光処理後に生存する環境水中の細菌PriestiaのUV耐性発現

UV-LED 光处理后存活的环境水中细菌 Priestia 的抗紫外线表达

• 发表时间: 2023
• 作者: 市川俊輔;岡﨑美香;藤本晴香;アヴシャル恵利子;西村訓弘;三宅秀人
• 通讯作者: 三宅秀人