Overcoming heterogeneity with circulating tumor DNA in urothelial carcinoma and establishing personalized medicine

克服尿路上皮癌循环肿瘤DNA的异质性并建立个性化医疗

• 批准号: 21K16741
• 负责人: 中野 剛佑
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16741/
• 关键词: 循環腫瘍DNA; 上部尿路上皮癌; 尿路上皮癌; 個別化医療; 不均一性

我々は血中循環腫瘍DNA(ctDNA)がUTUCにおいて有用なバイオマーカーとなりうるかを検討するため、限局性及び転移性UTUC患者50例の未治療時点での血液サンプルを採取し、cfDNAと血球DNAを抽出した。また、手術及び生検で採取した癌組織からもDNAを抽出した。ThermoFisher scientificのOncomine Pan-Cancer Cell-Free Assayを用いて、cfDNAのターゲットシークエンスを施行したところ、50例中25例(50%)でcfDNA中に変異を検出した。変異遺伝子はTP53が最多で、次いでPIK3CA、FGFR3等が含まれていた。血球DNAのターゲットシークエンス、癌組織DNAの全エクソームシークエンスの結果と照合した結果、cfDNA中のTP53変異のうち19%はクローン性造血(CH)による偽陽性であった。また、癌組織DNA中の変異と一致したのは29%で、52%はcfDNA中でのみ検出された。CHによる偽陽性を除外した結果、50例中23例(46%)でctDNAを検出した。ctDNA陽性の23例のうち15例ではcfDNA中のctDNA分画が2%を超えていた。UTUCに対して根治手術を施行した43例では、術前のctDNA分画>2%の症例では0-2%の症例と比較して有意に全生存率、無再発生存率が不良であった。さらに、多変量解析の結果、無再発生存率に関する術前リスク因子のうち、ctDNA分画>2%のみが独立した予測因子であった。これまでの研究でctDNAがUTUCにおける術前の予後予測因子として有用であることが明らかになった。今後は術後のctDNAによる微小残存病変の検出や、転移性UTUC患者に対する全身治療のモニタリングマーカーとしての有用性を検討する予定である。

I 々 は blood circulation is swollen sores DNA (ctDNA) が UTUC に お い て useful な バ イ オ マ ー カ ー と な り う る か を beg す 検 る た め, limit board and び 50 patients with planning move sex UTUC の untreated point で の blood サ ン プ ル を し, cfDNA と blood DNA を spare し た. Youdaoplaceholder0, surgery and び life 検で take <s:1> た cancer tissue を ら を DNAを extract た た. ThermoFisher scientific の Oncomine Pan - Cancer Cell - Free Assay を with い て, cfDNA の タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス を imposed し た と こ ろ, 50 cases, 25 cases (50%) で in cfDNA に - different を 検 out し た. The 伝 offspring 伝 TP53が is the most abundant で, followed by 伝 でPIK3CA, FGFR3, etc. Youdaoplaceholder4 contains まれて た た. Blood DNA の タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス, cancerous tissue DNA の エ ク ソ ー ム シ ー ク エ ン ス の result と according し た results, in cfDNA の TP53 - different の う ち 19% は ク ロ ー ン sex hematopoiesis (CH) に よ る false-positive で あ っ た. The <s:1> variations in the DNA of また and cancer tissues are と consistent with each other, and in the <s:1> た <s:1> と 29%で and 52% <s:1> cfDNA, the で み検 み検 are み検 out of された. CHによる false positive を excluded <s:1> た results, 23 out of 50 cases (46%)でctDNAを検 showed た た. There were 23 ctDNA positive <s:1> cases うち and 15 で cases で ctDNA in cfDNA が2%を over えて た た た. Execute し UTUC に し seaborne て radical surgery を た 43 で は, preoperative の ctDNA painting > 2% cases の で は 0-2% cases の と compare し て intentionally に total survival rate, no bad が で 発 survival again あ っ た. さ ら に again, many - analytic の results, no 発 survival に masato す る preoperative リ ス ク factor の う ち, ctDNA painting > 2% の み が independent し た to measure factor で あ っ た. こ れ ま で の research で ctDNA が UTUC に お け る after preoperative の to be factor と し て useful で あ る こ と が Ming ら か に な っ た. Future は postoperative の ctDNA に よ る microscopic residual disease - の 検 や, planning moves UTUC patients に す seaborne る systemic treatment の モ ニ タ リ ン グ マ ー カ ー と し て の usefulness を beg す 検 る designated で あ る.

项目成果

上部尿路上皮癌における周術期循環腫瘍DNAは予後不良群の同定を可能にする

上尿路尿路上皮癌围手术期循环肿瘤 DNA 可识别预后不良组

• 发表时间: 2021
• 作者: 篠原麻由香;秋田泰之;羽田真郎;澁谷忠正;安藤忠助;秦聡孝;三股浩光;中野 剛佑
• 通讯作者: 中野 剛佑