Search for new biomarkers of sarcopenia by examination with cell-free circulating DNA.

通过检查无细胞循环 DNA 寻找肌肉减少症的新生物标志物。

• 批准号: 21K17663
• 负责人: 吉田 保子
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Tsukuba International University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K17663/
• 关键词: サルコペニア; セルフリーDNA; リキッドバイオプシー; cfDNA; バイオマーカー

本研究の目的は、サルコペニアに関連するリキッドバイオプシーのひとつであるcell-free circulating DNA(細胞外循環遊離 DNA：cfDNA)の濃度を測定し、サルコペニアとcfDNA関連性を調べ、cfDNAがサルコペニアを診断するためのバイオマーカとなるかを探索することである。さらに、サルコペニア該当者から採取、抽出したcfDNAをNext Generation Sequencer(次世代シーケンサー：NGS)を使用してcfDNA自体が持つ情報の解析である。つまり、サルコペニアに特異的な塩基配列を探索することである。本年度は予定通り、サルコペニア該当者と比較のためのサルコペニア非該当者の検体（血液、尿、唾液）の採取を実施した。さらに各検体からcfDNAを抽出し、バイオアナライザーにて各cfDNAの濃度測定を実施した。結果、尿と唾液については、比較検討に必要な十分な量のcfDNAが採取、抽出ができなかった。尿と唾液検体については採取方法や抽出方法などについて、さらなる検討が必要なことが分かった。一方、血中のcfDNA濃度については、サルコペニア該当者はサルコペニア非該当者と比較して、ピークのある200塩基対（bp）のあたりでの比較では低下傾向にあることがわかった。35bpや10000bpあたりでの濃度比較も実施している。今後は既存のサルコペニア診断基準に関連する握力、歩行速度、骨格筋量指数の各項目とcfDNA濃度との関連探索を行う。また骨格筋の委縮などに関する検査項目としてN-titin fragment（尿）、N-terminal propeptide of type III procollagen（血液）C-terminal agrin fragment（血液）の測定を実施したため、それらの項目とcfDNA濃度の関連についても探索している。

The purpose of this study is to determine the concentration of cell-free circulating DNA(cfDNA), to modulate the correlation between cfDNA and cfDNA, and to explore the relationship between cfDNA and diagnosis. CfDNA Next Generation Sequencer(NGS) uses cfDNA self to analyze information.つまり、サルコペニアに特异的な塩基配列を探索することである。This year, we will continue to improve the quality of our products. In addition, cfDNA was extracted from each sample, and the concentration of cfDNA was determined. Results, urine, saliva, comparison, necessary amount of cfDNA taken, extracted The method used to extract saliva is necessary. The concentration of cfDNA in the blood is lower than that in the control group. 35bp to 10000bp, the concentration comparison was carried out. In the future, we will explore the relationship between grip strength, walking speed, bone mass index and cfDNA concentration among existing diagnostic criteria. The test items of N-titin fragment (urine), N-terminal polypeptide of type III procollagen (blood) and C-terminal agrin fragment (blood) were tested and the correlation between these items and cfDNA concentration was explored.