免疫受容体ネットワークの遺伝子発現を制御する転写因子の同定

免疫受体网络中控制基因表达的转录因子的鉴定

• 批准号: 22K14893
• 负责人: 安達 広明
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K14893/
• 关键词: 植物免疫; 免疫受容体; NLRタンパク質; 転写制御; 転写因子; NLR

植物細胞には、細胞内免疫受容体（NLR：Nucleotide binding-leucine rich repeat protein）があり、病原体が分泌するエフェクター分子を認識し免疫システムを活性化させる。近年、植物のNLR免疫機構の新しい概念として、機能分化した複数のNLRタンパク質が協調してはたらき、免疫応答を誘導するNLRネットワークモデルが提唱されている。それら機能分化型NLRは、エフェクター認識に特化した“センサーNLR”と、免疫シグナル誘導に関わる“ヘルパーNLR”に大別される。ナス科植物において、センサーNLRとヘルパーNLRをコードする遺伝子は、異なる染色体に座上しているにも関わらず、共に機能するという特徴があるが、それら受容体遺伝子が転写レベルでどのように制御されているかは未解明である。本研究では、ナス科モデル植物であるベンサミアナタバコを用いて、NLR遺伝子群の組織特異的発現制御に関わる転写因子を探索することを目的とした。今年度は、ベンサミアナタバコの葉および根組織におけるトランスクリプトームデータと、ベンサミアナタバコゲノムから抽出したNLR遺伝子上流プロモーター配列を比較し、葉および根で発現するNLR遺伝子のプロモーター領域に保存されたシス配列候補を同定した。免疫受容体ネットワークを構成するNLR遺伝子の転写制御機構を明らかにできれば、植物の免疫受容体機構の分子進化の理解に繋がる。

Plant cells に に, intracellular immune receptors (NLR: Nucleotide binding-leucine rich repeat protein) があ があ, pathogens が secrete するエフェ <s:1> タ を molecules を to recognize <s:1> immune システムを activation させる. In recent years, plant の NLR immune institutions の new し い concept と し て, functional differentiation し た plural の NLR タ ン パ ク qualitative が coordination し て は た ら き, induced immune 応 answer を す る NLR ネ ッ ト ワ ー ク モ デ ル が mention sing さ れ て い る. そ れ ら functional differentiated NLR は, エ フ ェ ク タ ー know に specialized し た "セ ン サ ー NLR" と, immune シ グ ナ ル induced に masato わ る "ヘ ル パ ー NLR" に comparing さ れ る. ナ ス plants に お い て, セ ン サ ー NLR と ヘ ル パ ー NLR を コ ー ド す る heritage 伝 は, different な る chromosome に seat し て い る に も masato わ ら ず, total に functional す る と い う, 徴 が あ る が, そ れ ら by let body heritage 伝 son が planning write レ ベ ル で ど の よ う に suppression さ れ て い る か は not interpret で あ る. This study で は, ナ ス secco モ デ ル plant で あ る ベ ン サ ミ ア ナ タ バ コ を with い て, NLR heritage 伝 subgroup の tissue specific 発 now suppression に masato わ る planning write factor を explore す る こ と を purpose と し た. Our は, ベ ン サ ミ ア ナ タ バ コ の leaf お よ び root tissue に お け る ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム デ ー タ と, ベ ン サ ミ ア ナ タ バ コ ゲ ノ ム か ら spare し た NLR heritage 伝 child upper プ ロ モ ー タ ー match column を compare し, leaf お よ び root で 発 now す る NLR posthumous son 伝 の プ ロ モ ー タ ー field に save さ れ た シ ス match column alternate を with Youdaoplaceholder0 た. Immune from let body ネ ッ ト ワ ー ク を constitute す る NLR heritage 伝 son の planning system of writing imperial institutions を Ming ら か に で き れ ば, plant の immune to allow institutions の molecular evolution の understand に 繋 が る.