スプライシング抑制を介した遺伝子発現キャンセル機構の解明
スプライシング抑制を介した遺伝子発現キャンセル機構の解明
批准号:
22K15034
负责人:
幡野 敦
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
これまでの研究からインスリン刺激によりスプライセオソームがクロマチンから離脱する現象を見出した。このスプライセオソームの離脱はスプライシング効率の低下を引き起こすことが想定され、mRNAの成熟抑制を介した遺伝子発現制御を行っている可能性が考えられる。そこで本研究ではインスリン刺激によるスプライシングの離脱が遺伝子発現に与える影響を評価し、その分子基盤の解明を目指す。まずスプライシングの離脱が遺伝子発現に与える影響を評価するためにスプライセオソームに含まれるSRSF1が実際に遺伝子のゲノム領域に結合するかをChIPを用いて検討した。intron-exon junctionを含む複数の領域に関してPrimerを設計してインスリン刺激による結合の変化を定量的に計測した。またインスリン応答遺伝子の成熟mRNAの安定性およびスプライシング速度を調べるため、スプライシング阻害剤や転写阻害剤を組み合わせた実験系を用いて検討した。成熟mRNAの安定性に関してはより生理的条件での検討を行うため、RNAにBrUを取り込ませる実験によりスプライシング前のRNAと成熟RNAの分解速度を比較した。さらにスプライシングに着目した理由となったクロマチンプロテオミクス(ChEP-DIA法)に関しても実験系を見直し再解析を行った。この方法の開発によりより網羅的に転写因子を含むクロマチン関連分子およびスプライシング関連分子の動態解析が可能となった。これらのデータをもとに遺伝子発現キャンセリングの制御分子機構の解明が進むことが期待できる。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
定量プロテオミクスによるERK活性化不均一性の解析
通过定量蛋白质组学分析 ERK 激活异质性
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[田邊ひかる, 幡野敦, 松本 雅記]
通讯作者:
松本 雅記
Transomic analysis of insulin-dependent transcriptional regulation using chromatin proteomics
使用染色质蛋白质组学对胰岛素依赖性转录调控进行转染色体分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[幡野敦, 松本 雅記]
通讯作者:
松本 雅記
細胞溶解が不要なトリプシン消化法の開発
开发不需要细胞裂解的胰蛋白酶消化方法
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[幡野敦, 松本 雅記]
通讯作者:
松本 雅記
リン酸化定量プロテオミクスによるTGF-βシグナル伝達機構の解明
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批准号:11J02739
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2011
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负责人:幡野 敦
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依托单位:
海外基金