微小管の翻訳後修飾による軸糸内輸送網の制御方法に関する分子シミュレーション研究
微小管の翻訳後修飾による軸糸内輸送網の制御方法に関する分子シミュレーション研究
批准号:
22K15070
负责人:
久保 進太郎
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2027-03-31
中文摘要
軸糸内輸送はdynein-2とkinesin-2が集合体を成したIFT-trainと呼ばれるものによって行われる。kinesin-2が細胞質側から鞭毛・繊毛の先端方向への輸送を担い、dynein-2が逆方向の輸送を担う。この時、軸糸内部の微小管骨格はそれぞれがA管とB管からなるダブレット微小管を形成している。これまでの研究から、kinesin-2がB管上、dynein-2がA管上を運動することが知られていた。だが、この微小管選択機構については明らかにされてこなかった。私は、B管がA管に比べて、微小管の翻訳後修飾が多いことに注目した。つまり、微小管の翻訳語修飾がkinesin-2の運動を促進、または、dynein-2の運動を阻害することによって、dynein-2とkinesin-2の微小管選択が行われているのではないかと考えた。そこで、まずはdynein-2と微小管翻訳後修飾の関係性について調べることとした。理論的に微小管表面に翻訳語修飾を施し、その表面上でdynein-2の挙動を確認した。具体的にはデチロシン化・ポリグルタミン酸化・ポリグリシン化をそれぞれ、または混ぜた状態で付与した系を作成した。その結果、特にポリグルタミン酸化がdynein-2の歩行運動を著しく阻害している様子が確認された。これらの結果はScientific Reportsに掲載された。Kubo, S., Bui, K.H. Regulatory mechanisms of the dynein-2 motility by post-translational modification revealed by MD simulation. Sci Rep 13, 1477 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-28026-z
英文摘要
軸糸内輸送はdynein-2とkinesin-2が集合体を成したIFT-trainと呼ばれるものによって行われる。kinesin-2が細胞質側から鞭毛・繊毛の先端方向への輸送を担い、dynein-2が逆方向の輸送を担う。この時、軸糸内部の微小管骨格はそれぞれがA管とB管からなるダブレット微小管を形成している。これまでの研究から、kinesin-2がB管上、dynein-2がA管上を運動することが知られていた。だが、この微小管選択機構については明らかにされてこなかった。私は、B管がA管に比べて、微小管の翻訳後修飾が多いことに注目した。つまり、微小管の翻訳語修飾がkinesin-2の運動を促進、または、dynein-2の運動を阻害することによって、dynein-2とkinesin-2の微小管選択が行われているのではないかと考えた。そこで、まずはdynein-2と微小管翻訳後修飾の関係性について調べることとした。理論的に微小管表面に翻訳語修飾を施し、その表面上でdynein-2の挙動を確認した。具体的にはデチロシン化・ポリグルタミン酸化・ポリグリシン化をそれぞれ、または混ぜた状態で付与した系を作成した。その結果、特にポリグルタミン酸化がdynein-2の歩行運動を著しく阻害している様子が確認された。これらの結果はScientific Reportsに掲載された。Kubo, S., Bui, K.H. Regulatory mechanisms of the dynein-2 motility by post-translational modification revealed by MD simulation. Sci Rep 13, 1477 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-28026-z
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McGill University(カナダ)
麦吉尔大学(加拿大)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
THE THEORETICAL STUDY OF DYNEIN MOTILITY REGULATED BY TUBULIN POST TRANSLATIONAL MODIFICATION
微管蛋白翻译后修饰调控动力蛋白运动的理论研究
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui]
通讯作者:
Khanh Huy Bui
POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION OF MICROTUBULES CAN CONTROL DYNEIN-2'S ABILITY TO WALK ON A-TUBULES
微管的翻译后修饰可以控制 DYNEIN-2 在 A 管上行走的能力
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui]
通讯作者:
Khanh Huy Bui
How post-translational modification of tubulins controlled dynein-2 (IFT train) motility revealed by coarse-grained MD simulation
粗粒度MD模拟揭示微管蛋白的翻译后修饰如何控制dynein-2(IFT序列)运动
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui]
通讯作者:
Khanh Huy Bui
鞭毛内輸送を行うダイニンがどのように歩行する微小管を選択するのかに関する粗視化MD研究
关于执行鞭毛内运输的动力蛋白如何选择微管行走的粗粒度 MD 研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[久保進太郎, カーンフイブイ]
通讯作者:
カーンフイブイ
Theoretical Elucidation of the Adaptation Mechanism in Molecular Motors and Its Application to Advanced Function Design
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批准号:22KJ0505
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.33万
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财政年份:2023
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负责人:久保 進太郎
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依托单位:
海外基金