細胞レベルで見る巨大ウイルス感染現象の多様性
细胞水平上巨病毒感染现象的多样性
基本信息
- 批准号:22K15175
- 负责人:
- 金额:$ 3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
2003年に報告された巨大ウイルスは細菌に匹敵する大きさのゲノムと粒子を持ち、ウイルスは微小な存在であるという考え方が支配的だった生物学に大きな衝撃を与えた。以降、多数の巨大ウイルスが様々な環境から単離され、ウイルス粒子の構造やゲノム構成が実に多様であることが明らかになった。一方、巨大ウイルスが感染細胞内で示す挙動に関する理解は大きく遅れている。そこで、本研究では様々な巨大ウイルスを用いて、細胞レベルでの感染現象を解析し、その多様性を明らかにするとともに、ウイルス間相互作用にまで踏み込むことを目指している。本年度は、主に巨大ウイルス感染が細胞内でどのように進行するかをモニターするための実験系の構築に取り組んだ。具体的には各ウイルスのDNA量を分子生物学的に定量する系を確立し、感染進行のモニターを可能とした。また、この系を用いて、一部のウイルスについて、ウイルス間相互作用もモニターできることを示した。さらに、一部のウイルスについては経時的なRNA-seqを行い、より網羅的に感染進行を解析するためのデータを得た。これらと並行して、巨大ウイルスの多様性をより詳細に明らかにするために、新規ウイルスの単離も試みた。その中で、新規ウイルスの単離、およびそれらのゲノムレベルでの多様性解析を効率的に行うためのパイプラインを構築し、その有用性について記した論文をプレプリントサーバーにアップロードした。なお、これらの新規ウイルスの単離は本研究計画を発展させる上で極めて有益であった。
In 2003, a report was issued on the impact of biological factors on the development of large and small organisms. In order to reduce, most of the huge particles are separated from the environment, and the structure of the particles is composed of multiple particles. A large number of infected cells are affected by the infection. This study aims to analyze the diversity of infection phenomena and their interactions. This year, the main reason for the large number of cell infections is that they are carried out in the cell and the construction of the system is organized. The specific DNA quantity of each cell is quantified in molecular biology, and infection is possible. The interaction between them is not only a matter of time, but also a matter of time. A part of the virus is detected by RNA-seq analysis. This is a great opportunity for us to explore new ways of doing things. In addition, the new regulations include the following: the separation of the information, the analysis of the diversity of the information, the construction of the information, the usefulness of the information, the analysis of the diversity of the information. The new regulations are extremely useful for the development of this research project.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Rapid characterization of novel giant viruses using nanopore sequencing
使用纳米孔测序快速表征新型巨型病毒
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hikida H.;Okazaki Y.;Zhang R.;Ogata H
- 通讯作者:Ogata H
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