small RNAを標的とした緑膿菌薬剤耐性機序の解明とその検査・制御方法の開発

针对小RNA的铜绿假单胞菌耐药机制的阐明及其检测和控制方法的开发

• 批准号: 22K15458
• 负责人: 大沼 健一郎
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15458/
• 关键词: small RNA; 緑膿菌; 抗菌薬耐性; Pseudomonas aeruginosa; 多剤耐性緑膿菌; 薬剤耐性; 耐性菌検査

令和4年度は研究に使用する緑膿菌保存菌株から薬剤感受性試験を行い、薬剤耐性プロファイルを最小発育阻止濃度により確認した。当初、令和4年度には各緑膿菌菌株よりsmall RNAを抽出し網羅的解析も行う予定であったが、COVID-19感染拡大に伴う試薬不足、物流遅延によりsmall RNA抽出試薬の納品が大幅に遅延した。2023年1月に試薬供給が再開されたため、現在、抽出条件の最適化を検討中であり、その後網羅的解析を行う予定である。また、網羅的解析に加え、緑膿菌の薬剤耐性に関わる既知のsmall RNAについてRT-PCRにて発現量の解析を行うこととし、プライマー設計を行った。既知のsmall RNAの発現解析ではあるが、本検討から得られる結果は、同一患者から経時的に分離された菌株でのsmall RNAの発現量の変化を初めて確認するものであり、緑膿菌のsmall RNA研究、薬剤耐性メカニズムの解明において、菌株ごとの多様性の有無を確認できるため重要な意義を持つことが期待される。また、当初使用予定の菌株の他に、別の患者から分離された耐性度の異なる菌株を収集することができ、順次網羅的解析およびRT-PCRを行う予定である。

In 2010 and 2014, the use of preserved Pseudomonas aeruginosa strains was tested for susceptibility, and the minimum growth inhibition concentration was confirmed. In 2004, the analysis of small RNA extraction from Pseudomonas aeruginosa strains was determined, and COVID-19 infection was significantly delayed due to insufficient testing and logistics delays. January, 2023: Optimization of test supply conditions for reopening, present and extraction Analysis of RNA, RNA The analysis of small RNA expression is known. The results obtained from this study are preliminary confirmation of the variation of small RNA expression in isolated strains from the same patient. The study of small RNA in Pseudomonas aeruginosa is expected to have important significance in the identification of drug resistance and diversity of strains. For example, the isolation of different strains with different resistance from different patients using the given strains, the analysis of the sequence and the RT-PCR were determined.