ヒト由来Pseudomonas属菌株の菌種再分類及び臨床細菌学的特性

人源假单胞菌菌株的重新分类和临床细菌学特征

• 批准号: 22K15460
• 负责人: 遠矢 真理
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Juntendo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15460/
• 关键词: Pseudomonas; 全ゲノム解析; 薬剤耐性; 新菌種; 菌種同定; 病原因子

Pseudomonas属菌は、系統分類学的に13のグループに分類され、比較的に大きな属の一つである。また近縁な菌種の場合、菌種間の16S rRNA遺伝子配列の相同性が99%を超える場合があり、正確な菌種同定が難しい属である。研究代表者は、日本の医療施設で分離され自動菌種同定機器Microscan WalkawayでP. putidaもしくはP. fluorescensとして同定された42株を全ゲノム解析し菌種の再同定をした。42株中26株は12の既存菌種に分類されたが、残り16株は既存菌種に分類できない同定不能株であった。この16株の同定不能株は、全ゲノム解析により11種類の新菌種に属していることが明らかとなった。一方、42株中P. putidaもしくはP. fluorescensとして再同定された株は1株のみであった。以上の解析から、緑膿菌以外のヒトから分離されるPseudomonas属菌は菌種同定が不十分であり、多くの場合は誤同定されていることを見出した。さらに、既存菌種であるP. protegensとP. lactisと再同定された株は、多剤耐性グラム陰性菌治療の最後の砦とされるコリスチンに対して高度耐性であることを見出した。上記の研究に加えて、P. alcaligenesと同定されたカルバペネム耐性菌の全ゲノム情報を基にした菌種同定を行った。その結果、新菌種P. paralcaligenesであることを見出し、新菌種として提唱を行った。更に、その菌株のカルバペネム耐性機構についても解析を行い報告した。

Pseudomonas is a genus of bacteria. It is classified into 13 taxonomies. It is a genus of comparison. The identity of 16S rRNA gene sequences between species is 99%. The research representative asked the Japanese medical facility to isolate and identify the automatic strain identification machine Microscan Walkaway. putidaもしくはP. All 42 strains of fluorescens were identified. 26 of the 42 strains are classified as existing strains, and 16 are classified as existing strains. The 16 strains were identified as new strains and 11 species were identified as new strains. P. putidaもしくはP. Fluorogens are the same. The above analysis shows that Pseudomonas species are not identified in many cases except Pseudomonas aeruginosa. P. protegensとP. It has been shown that lactis and re-established strains are highly resistant to the last phase of multi-agent resistant Gram-negative bacterial treatment. In this paper, we introduce the identification of P. alcaligenes and the complete information of P. alcaligenes. P. Paralcaligenes In addition, all strains of the virus are isolated from the host system, and the resistance mechanism is analyzed and reported.

项目成果

Emergence of carbapenem-resistant Pseudomonas alcaligenes and Pseudomonas paralcaligenes clinical isolates with plasmids harbouring blaIMP-1 in Japan

日本出现带有 blaIMP-1 质粒的耐碳青霉烯类产碱假单胞菌和副产碱假单胞菌临床分离株

• DOI: 10.1099/jmm.0.001684
• 发表时间: 2023
• 期刊: Journal of Medical Microbiology
• 影响因子: 3
• 作者: Ono Emi;Tohya Mari;Tada Tatsuya;Hishinuma Tomomi;Watanabe Shin;Kuwahara-Arai Kyoko;Kirikae Teruo
• 通讯作者: Kirikae Teruo

Pseudomonas paralcaligenes sp. nov., isolated from a hospitalized patient

副产碱假单胞菌 sp.

• DOI: 10.1099/ijsem.0.005649
• 发表时间: 2023
• 期刊: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
• 影响因子: 2.8
• 作者: Ono Emi;Tohya Mari;Watanabe Shin;Tada Tatsuya;Kuwahara-Arai Kyoko;Oshiba Akihiro;Izumi Namiki;Kirikae Teruo
• 通讯作者: Kirikae Teruo

ミャンマーの医療施設で分離されたPseudomonas菌株の菌種同定と薬剤感受性

缅甸医疗机构分离的假单胞菌菌株的菌种鉴定和药敏

• 发表时间: 2023
• 作者: 遠矢 真理;菱沼 知美;多田 達哉;Htay Htay Tin;切替 照雄
• 通讯作者: 切替 照雄