菌血症診断における次世代シーケンサーを用いた複数セット検査の意義の解明

阐明使用下一代测序仪进行多组测试在菌血症诊断中的意义

• 批准号: 22K15666
• 负责人: 北浦 剛
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Tottori University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15666/
• 关键词: 血液培養; NGS; 次世代シーケンサー; 菌血症; セット数

従来菌血症診断のために血液培養検査が行われているが、血液培養で陽性となった細菌が必ずしも起炎菌とは限らない。検体採取時の汚染による偽陽性も生じうることから、複数セットの検体の採取が推奨されている。近年次世代シーケンサー(next generation sequencer：NGS) を用いた菌血症起炎菌の同定が試みられており、血液培養と比較し検出感度が高いが、皮膚常在菌等による汚染の頻度も増加する点が課題である。検出された細菌が真の起炎菌であるかについては血液培養以上に慎重に判断する必要があるが、菌血症・汚染の判断を行うための手法については十分な検討がなされていない。本研究では、採取された複数セットの血液検体に対してNGSと通常の血液培養検査を行い、患者の臨床経過から真の菌血症・汚染を判定し、NGSにおける陽性セット数ごとの臨床的意義を明らかにする。当初は菌血症が疑われる患者について、血液培養検査施行時に得られた検体より直接DNA抽出を行うことを検討していたが、直近の血液培養陽性検体数、NGSにおける検出感度及び解析可能な検体数等を考慮し、通常診療で行われた血液培養検査後のボトル中の残余血液を用いた解析についても行う方針とした。当院の倫理審査を控えており、承認をもって検体の収集を開始する。本研究の成果は、菌血症の新たな診断法の開発につながり、患者の予後改善に寄与することが期待される。

The diagnosis of bacteremia requires blood culture tests to be performed, and blood culture tests to be positive for inflammatory bacteria. When the sample is taken, the false positive signal is generated, and the sample is taken. In recent years, the next generation sequencer (NGS) has been used to test the identification of bacteria-causing inflammatory bacteria, blood culture and comparison, and the frequency of contamination has increased. The detection of bacteria and inflammatory bacteria is necessary for careful judgment of blood culture and contamination. This study aims to investigate the clinical significance of NGS and common blood culture tests, to determine the true bacteremia and contamination of patients, and to determine the positive number of NGS. The number of positive blood culture samples, the sensitivity of NGS, and the number of possible samples to be analyzed should be considered. The residual blood after blood culture test should be analyzed. When the ethics review of the hospital begins, the collection of the body is acknowledged. The results of this study are expected for the development of new diagnostic methods for bacteremia and for the future improvement of patients.