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エピゲノム解析によるMRSAのアウトブレイク株解析と予防法の樹立

利用表观基因组分析MRSA暴发菌株分析并建立预防方法

基本信息

批准号：
22K16278
负责人：
山崎由里子
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16278/
关键词：
MRSA アウトブレイク多剤耐性菌 NICU エピゲノム院内感染

项目摘要

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)は皮膚の重症感染症の原因となる他、アトピー性皮膚炎の病状を悪化させるなど、皮膚に悪影響を及ぼす細菌の代表であり、院内アウトブレイクがしばしば問題となっている。代表者は最近、単施設内で1つのMRSA株がエピゲノム進化によって抗生剤寛容性、外来遺伝子取り込み能、バイオフィルム産生能を獲得しつつアウトブレイクを引き起こしたことを世界で初めて突き止めた。しかしどのような環境・ホスト要因がMRSAのエピゲノム進化を引き起こすかは依然不明である。本研究ではアウトブレイク株に特有のエピゲノム変化パターンを同定し、細菌学的根拠のある予防法や治療法の確立に繋げることを目指して、MRSA臨床株に対してエピゲノム解析を行っている。本年度はまず、単一施設でアウトブレイクを起こしたMRSAの複数の臨床株に対してエピゲノム解析を行なった。細菌のとりうるメチル化形式を網羅するため、複数のエピゲノム解析手法を組み合わせて検討を行った。その結果、転写効率に関わる特定の遺伝子に変化が集中して見られることがわかった。同遺伝子の欠損株を共同研究者と作成し、欠損株の表現型をin vitroで解析することで、アウトブレイク株の臨床的特徴を引き起こした遺伝子発現やエピゲノム進化を突き止めることができている。エピゲノム解析に加えて、動物実験モデルを用いた感染実験やin vitroの細胞感染実験を行い、MRSAのアウトブレイク株が臨床的にもホスト体内で生存し病院内に蔓延りやすい性質となっていることを確認した。

Causes and symptoms of severe skin infections caused by MRSA resistant bacteria The representative of 悪化させるなど, skin に悪effect を and ぼすbacteria, and hospital アウトブレイクがしばしば problem となっている. The representative is the recent one, the MRSA strain in the single facility, the evolution of antibiotics and the tolerance of antibiotics, and the introduction of foreign heritageみ能, バイオフィルムgenerate energy をget しつつアウトブレイクをinducing きこしたことを世界で初めて出きstopめた. The cause of the environment and environment of MRSA is still unclear. This study focuses on the prevention and control of the unique のエピゲノム変化パターンを同定し and bacteriology of the ではアウトブレイク strain. The method of treatment is established and the clinical strain of MRSA is analyzed and analyzed. This year, we have established a single clinical facility, MRSA, which is a clinical strain of MRSA. Bacterial のとりうるメチル化 form をnetting するため, plural のエピゲノムanalytical technique を组み合わせて検question を行った.そのRESULTS, 転WRITING EFFICIENCY に关わるspecific の缝子に変化が综合して见られることがわかった. The co-researcher of the same の杝子の毇loss strainを was created, and the phenotype of the KOKO strain was created. In vitro analysis of the clinical characteristics and clinical characteristics of Ayatoba and Ayatoba The rise and fall of the remaining 伝子発 appear in the evolution of the をききめることができている.エピゲノムanalyticsに加えて、animal 実験モデルを用いた infection実験やin In vitro cell infection, MRSA clinical infection The nature of the disease that has spread inside the hospital has been confirmed.