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無脊椎動物ミトコンドリアmRNAにおけるRNA編集の探索と5'末端領域の解析

无脊椎动物线粒体 mRNA 的 RNA 编辑探索及 5 末端区域分析

基本信息

批准号：
09780641
负责人：
横堀伸一
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Tokyo University of Pharmacy and Life Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至 1998
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09780641/
关键词：
ミトコンドリアRNA tRNA リボソームRNA 無脊椎動物ミトコンドリア RNA編集

项目摘要

尾索動物マボヤ(Halocynthia roretzi)ミトコンドリアDNAの解析の過程で、NADHデヒドロゲナーゼサブユニット4L(ND4L)遺伝子が、その下流のtRNA^<Cys>遺伝子と、同一転写方向で10塩基重なっていることが推測された。後生動物ミトコンドリアtRNAの遺伝子が下流遺伝子と同一転写方向で重なっている場合、そのtRNAがRNA編集の対象であることが知られている。遺伝子の重複の組み合わせはそれとは異なるが、このtRNA^<Cys>とND4LmRNAでもRNA編集がないかを検証した。tRNA^<Cys>と、その遺伝子の下流に配置しいかなる遺伝子とも重複していないtRNA^<Lys>遺伝子の産物であるtRNAとを、環状化して、そのcDNAを合成し、PCRで増幅後、クローニングし、その塩基配列の解析を行った。その結果、tRNA^<Cys>では5'-末端に4塩基の伸長が見られるた。また、ND4L mRNAの3'-末端領域は、oligo dTプライマーを用いてcDNAを合成し、そのプライマーとND4L mRNA特異的プライマーを用いたPCRによってcDNAを増幅し、クローニング後、塩基配列の解析を行った。ND4LmRNAでは塩基配列を解析したcDNAの大部分で、終止コドンが見られない、と言う結果が得られた。さらに、ND4L mRNAでは、遺伝子の塩基配列とは異なる塩基が一部見られるので、これがRNA編集に関係ないかどうかを検証中である。また、マボヤミトコンドリアの小サブユニットリポソームRNAの5'-末端及び、3'-末端のRNAレベルの配列を、cDNAの塩基配列を解析することによって明らかにすることを試みた。その結果、この小サブユニットリポソームRNAは、現在知られているものの中で最も短いものの一つであることが推定された。

Halocynthia roretzi) DNA analysis process, NADH DNA analysis process 4L (ND4L) ) 伝子が, その流のtRNA^<Cys> 伝子と, the same writing direction で10婩婷ていることが speculated された. Metazoa ミトコンドリアtRNA の缝子が indecent legacy 伝子と Same 転 Direction で重なっている occasion, そのtRNAがRNA compiled by の対相であることが知られている.このtRNA^<Cys>とND4LmRNAでもRNAassembledがないかを検证した. tRNA^<Cys>と、その缝子のdegradable configurationしいかなる伝子とも Repeat していないtRNA^<Lys>缝子のproductであるtRNAとを, circularization して, そのcDNA をsynthesis し, PCR amplicon, クローニングし, その塩array のanalytic を行った.そのRESULTS, tRNA^<Cys>では5'-terminal に4塩baseのelongationが见られるた.また、ND4L mRNAの3'-terminal domainは、oligo dTプライマーをSynthesized with いてcDNAをし、そのプライマーとND4L The mRNA-specific DNA was analyzed using PCR, cDNA amplification, and base alignment analysis. ND4LmRNA has been analyzed for most of the cDNA base alignment, terminated and analyzed, and the results have been analyzed for ND4LmRNA.さらに、ND4Lでは, 缝子の塩综合とは二伝子の塩综合とは同なる塩基が一见られるので, これがRNA compiled にrelations ないかどうかを検证中である.また、マボヤミトコンドリアの小サブユニットリポソームRNA 5'-end and び, 3'-end RNA レベルのalignment を, cDNA の塩娩とによって明らかにすることをtest みた.そのRESULT, この小サブユニットリポソームRNAは, now know られているものの中で最も小いものの一つであることが presumed された.