尾索動物ミトコンドリアゲノムの転写パターンと遺伝子構造の進化の解析

尾索动物线粒体基因组的转录模式和基因结构进化分析

• 批准号: 12780517
• 负责人: 横堀 伸一
• 金额: $ 0.51万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2001
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-12780517/
• 关键词: 尾索動物; ミトコンドリアゲノム; ミトコンドリアRNA; 遺伝子配置; 遺伝子構造

申請者は、昨年度の尾索動物ユウレイボヤCiona savignyi(海鞘綱腸性目)のミトコンドリアゲノムの全塩基配列の決定に続き、新たに尾索動物亜門のタリア綱に属するアンボイナサルパRitteriella amboinensisとウミタルDoliolum nationalisのミトコンドリアゲノムの全塩基配列の決定を行った。また、C. savignyiと同属種であるカタユウレイボヤのC. intestinalisのミトコンドリアゲノムの約60%の領域の塩基配列を決定した。その結果、C. savignyiとC. intestinalisとの間で、ミトコンドリアゲノムの遺伝子配置の一部が異なっていることが明らかとなった。また、R. amboinensisとD. nationalisのミトコンドリアゲノムの構造が、遺伝子配置のみならず、遺伝子の数や種類も含め、この2者だけではなく尾索動物マボヤHalocynthia roretzi(海鞘綱壁性目)やCiona spp.とも大きく異なっていることが明らかになった。D. nationalisではtRNA遺伝子の一つが欠落しておりtRNA編集やtRNAの細胞質からの移入等の現象の存在が示唆された。またR. amboinensisではlong noncoding regionとそこに隣接する4種のtRNA遺伝子の重複が見られ、ミトコンドリアゲノムの複製とゲノム構造の変化の関連が示唆された。以上のように、申請者の解析により、尾索動物のミトコンドリアゲノムは、多細胞動物の中でも特に多様性を示すことが明らかとなった。また、ホヤ類と同様なミトコンドリア変則暗号をタリア類でも使用していることも明らかとなった。また、ユウレイボヤの5種類のミトコンドリアtRNAのcDNA解析を行い、その遺伝子の5'末端と3'末端のゲノム上の位置を特定した。

Applicants は, yesterday's annual の tail rope animal ユ ウ レ イ ボ ヤ Ciona savignyi (sea squirts, intestinal sexual eyes) の ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム の salt base full column の decided に 続 き, new た に tail rope animal 亜 door の タ リ ア outline に genus す る ア ン ボ イ ナ サ ル パ Ritteriella Amboinensis と ウ ミ タ ル Doliolum nationalis の ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム の salt base full column line の decided を っ た. ま た, c. savignyi と belong to the same kind of で あ る カ タ ユ ウ レ イ ボ ヤ の c. intestinalis の ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム の about 60% の field の salt base with column を decided し た. そ の results, c. savignyi と c. intestinalis と の で, ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム の heritage 伝 child configuration の a が different な っ て い る こ と が Ming ら か と な っ た. ま た, r. amboinensis と d. nationalis の ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム が の structure, but 伝 configuration の み な ら ず, but 伝 の several types of や も め, こ の 2 だ け で は な く tail rope animal マ ボ ヤ Halocynthia roretzi (sea squirts, wall sexual eyes) や Ciona spp. Youdaoplaceholder0 と da と く yi なって る る とが Ming ら になった. D. nationalis で は tRNA posthumous son 伝 の a つ が owe fall し て お り compiling や tRNA tRNA の cytoplasm か ら の move etc. Phenomenon of の is の が in stopping さ れ た. ま た r. amboinensis で は long noncoding region と そ こ に 隣 meet す る four の tRNA heritage 伝 の repeat が son see ら れ, ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム の copy と ゲ ノ の ム structure - the の masato even が in stopping さ れ た. Above の よ う に, applicants の analytic に よ り, tail rope animal の ミ ト コ ン ド リ ア ゲ ノ ム は, multicellular animal の で も, に multiple others を shown す こ と が Ming ら か と な っ た. ま た, ホ ヤ class と with others な ミ ト コ ン ド リ ア - then sign を タ リ ア class で も use し て い る こ と も Ming ら か と な っ た. ま た, ユ ウ レ イ ボ ヤ の 5 kinds の ミ ト コ ン ド リ ア tRNA の cDNA parsing を い, そ の posthumous son 伝 の 5 'end と 3' end の ゲ ノ ム の position を specific し た.

项目成果

Y. Watanabe, S. Yokobori et al.: "Introns in protein-coding genes in Archaea"FEBS letters. 501. 27-30 (2002)

Y. Watanabe、S. Yokobori 等人：“古细菌蛋白质编码基因中的内含子”FEBS 字母。

S. Yokobori, T. Suzuki, K. Watanabe: "Genetic code variations in mitochondria : tRNA as a major determinant of genetic code plasticity"Journal of Molecular Evolution. 53. 314-326 (2001)

S. Yokobori、T. Suzuki、K. Watanabe：“线粒体中的遗传密码变异：tRNA 作为遗传密码可塑性的主要决定因素”分子进化杂志。

K. Tomita, S. Yokobori et al.: "Cephalopod Loligo bleekeri mitochondrial genome : multiplied non-coding regions and transposition of tRNA genes"Journal of Molecular Evolution. (印刷中).

K. Tomita、S. Yokobori 等人：“Cephalopod Loligo bleekeri 线粒体基因组：非编码区的倍增和 tRNA 基因的转座”《分子进化杂志》（出版中）。

横堀伸一, 大島泰郎: "後生動物ミトコンドリアゲノム構造と遺伝暗号の進化"日本臨牀. (印刷中).

Shinichi Yokobori、Yasuro Oshima：“后生动物线粒体基因组结构和遗传密码的进化”Nippon Rinbaku（出版中）。

横堀伸一(共著): "基礎生化学実験法 第4巻 核酸・遺伝子実験 II、応用編(第1章1.1〜1.3,1.5を分担)"東京化学同人. 199(1-20,26-30) (2001)

横堀真一（合著者）：《基础生化实验方法第4卷核酸/基因实验II，应用版（第1章1.1-1.3、1.5共享）》东京化学同人社第199期（1-20、26-30）（ 2001）