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構造情報に基づく抗原抗体反応の精密解析と特異性・親和性を決定する因子の抽出

構造情報に基づく抗原抗体反応の精密解析と特異性・親和性を決定する因子の抽出
基于结构信息精确分析抗原抗体反应并提取决定特异性和亲和力的因素
批准号:
12780486
负责人:
津本 浩平
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2001

项目摘要

项目成果

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蛋白質間相互作用をより深く理解するために本研究では、モデルとなる蛋白性抗原と抗体可変領域の相互作用を取り上げ、(1)疎水的相互作用、(2)静電的相互作用(塩橋・水素結合)、(3)局所的構造変化に関与するアミノ酸残基、そして(4)界面に残存する溶媒分子に着目し、変異導入を施した抗原あるいは抗体を用いた相互作用について、構造解析・熱力学的解析を中心とした精密解析を行い、抗原抗体相互作用における特異性・親和性がどのような因子によって創出されているかを明らかにすることを目的としている。今年度の実績は以下の通りである。(1)変異抗体と野生型抗原複合体の結晶構造解析:(1)水素結合を欠損させた軽鎖変異体(L-Asn31Ala, L-Asn31Asp, L-Asn32Ala, L-Asn32Asp,L-Asn92Ala, L-Asn92Asp)、(2)水素結合を欠損した重鎖変異体(H-Ser52Ala、H-Ser54Ala、H-Ser56Ala)、(3)抗原との誘導適合に重要な役割を果たしている重鎖Tyr53の側鎖を欠損させた変異体(H-Tyr53Ala)と野生型抗原との複合体について、熱力学的解析を詳細に行ったほか、構造解析に相応しい結晶を得、これらの結晶構造を精密化し、得られた構造情報を基に、熱力学的パラメーターの変化との関連を議論することができた。(2)三者複合体間の界面における水分子の役割の考察:変異抗体(L-Tyr50Phe、L-Ser91Ala、L-Tyr93Ala)との野生型抗原との相互作用について、熱力学的に解析し、複合体について、構造解析にふさわしい結晶を作製、結晶構造を精密化し、得られた構造情報に基づいて、熱力学的パラメーターとの変化を議論できた。(3)重鎖軽鎖間相互作用の役割:ファージ提示法により機能変換を施した変異抗体について、変異抗原ならびに野生型抗原との複合体の結晶構造を明らかにし、重鎖軽鎖間相互作用の抗原特異性への寄与について深く議論できた。
英文摘要
蛋白質間相互作用をより深く理解するために本研究では、モデルとなる蛋白性抗原と抗体可変領域の相互作用を取り上げ、(1)疎水的相互作用、(2)静電的相互作用(塩橋・水素結合)、(3)局所的構造変化に関与するアミノ酸残基、そして(4)界面に残存する溶媒分子に着目し、変異導入を施した抗原あるいは抗体を用いた相互作用について、構造解析・熱力学的解析を中心とした精密解析を行い、抗原抗体相互作用における特異性・親和性がどのような因子によって創出されているかを明らかにすることを目的としている。今年度の実績は以下の通りである。(1)変異抗体と野生型抗原複合体の結晶構造解析:(1)水素結合を欠損させた軽鎖変異体(L-Asn31Ala, L-Asn31Asp, L-Asn32Ala, L-Asn32Asp,L-Asn92Ala, L-Asn92Asp)、(2)水素結合を欠損した重鎖変異体(H-Ser52Ala、H-Ser54Ala、H-Ser56Ala)、(3)抗原との誘導適合に重要な役割を果たしている重鎖Tyr53の側鎖を欠損させた変異体(H-Tyr53Ala)と野生型抗原との複合体について、熱力学的解析を詳細に行ったほか、構造解析に相応しい結晶を得、これらの結晶構造を精密化し、得られた構造情報を基に、熱力学的パラメーターの変化との関連を議論することができた。(2)三者複合体間の界面における水分子の役割の考察:変異抗体(L-Tyr50Phe、L-Ser91Ala、L-Tyr93Ala)との野生型抗原との相互作用について、熱力学的に解析し、複合体について、構造解析にふさわしい結晶を作製、結晶構造を精密化し、得られた構造情報に基づいて、熱力学的パラメーターとの変化を議論できた。(3)重鎖軽鎖間相互作用の役割:ファージ提示法により機能変換を施した変異抗体について、変異抗原ならびに野生型抗原との複合体の結晶構造を明らかにし、重鎖軽鎖間相互作用の抗原特異性への寄与について深く議論できた。
期刊论文(90)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Ueda et al.: "Cell-growth control by monomeric antigen : the cell surface expression of lysozyme-specific Ig V-domains fused to truncated EPO receptor."Journal of Immunological Methods. 241. 159-170 (2000)
Ueda 等人:“单体抗原控制细胞生长:与截短的 EPO 受体融合的溶菌酶特异性 Ig V 结构域的细胞表面表达。”免疫学方法杂志。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Ueno et al.: "T-cell Immunotherapy for Human MK-1-Expressing Tumors Using a Fusion Protein of the Superantigen SEA and Anti-MK-1 scFv Antibody"Anticancer research. 22 印刷中. (2002)
Ueno 等人:“使用超抗原 SEA 和抗 MK-1 scFv 抗体的融合蛋白对人类 MK-1 表达肿瘤进行 T 细胞免疫治疗”,出版中的抗癌研究 22。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Yoda et al.: "Folding-unfolding of goat aipha-lactalbumin studied by stopped-flow CD and molecular dynamic simulations"Proteins ; Struct. Funct. Genet.. 42. 49-65 (2001)
Yoda 等人:“通过停流 CD 和分子动力学模拟研究山羊 aipha-乳清蛋白的折叠-展开”蛋白质;
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Arai et al.: "Demonstration of a homogeneous noncompetitive immunoassay based on bioluminescence resonance energy transfer"Analytical Biochemistry. 289. 77-81 (2001)
Arai 等人:“基于生物发光共振能量转移的同质非竞争性免疫测定的演示”分析生物化学。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
共 43 条
    蛋白質相互作用における多重特異性の定量的記述と応用
    • 批准号:
      19021011
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.07万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      津本 浩平
    • 依托单位:
    受容体分子認識における多重特異性発現機構の定量的解明
    • 批准号:
      18038007
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.15万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      津本 浩平
    • 依托单位:
    細胞表面抗原特異的ヒト抗体の網羅的選択・調製と応用
    • 批准号:
      14704006
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
    • 资助金额:
      $18.64万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      津本 浩平
    • 依托单位:
    抗体分子の人工設計を目指す抗原抗体相互作用の精密解析
    • 批准号:
      09780592
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • 资助金额:
      $1.54万
    • 财政年份:
      1997
    • 负责人:
      津本 浩平
    • 依托单位:
    海外基金