16SrRNA解析を用いた細菌同定

使用 16S rRNA 分析进行细菌鉴定

• 批准号: 15H00624
• 负责人: 竹森 優喜子
• 金额: $ 0.38万
• 依托单位: Kanazawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15H00624/
• 关键词: 16SrRNA解析; Sphingomonas paucimobilis; カタラーゼ陰性黄色ブドウ球菌

1. 研究目的多くの微生物検査室では、コロニー性状、栄養要求性、生化学的性状により細菌を同定する。しかし、日常検査では変異株や稀な菌などの同定困難な菌に遭遇することが珍しくない。本研究では、①16S rRNA解析を行い、同定困難であった細菌を同定すること、②解析株の表現型および菌株出現の臨床背景を検討することを目的とする。2. 研究方法日常検査において同定困難であった株を対象とした。16S rRNA解析は大楠らの方法に従い、菌株のDNA抽出(煮沸法)⇒16S rRNA領域の増幅(PCR法)⇒増幅産物の精製⇒シーケンス反応⇒DNA配列の解読⇒相同性検索(BLAST, BlBl, EzTaxon-e)により行なった。表現型はコロニー性状、生化学的性状を中心に観察した。菌株の出現背景は診療録を参照した。3. 主な研究成果(1) 16S rRNA解析結果 : Sphingomonas paucimobilisオキシダーゼ弱陽性、黄色色素産生、DNase陽性のグラム陰性桿菌。特に黄色色素産生が特徴的であった。NF18(ニッスイ)で同定可能であった。Walk away (ベックマン・コールター)では同定確率50%で本菌種と同定された。S. paucimobillusの病原性は低く日和見感染症の起因菌とされている。本症例は免疫抑制の患者で、分離材料より起因菌と推測され貴重な症例と思われた。(2) 16SrRNA解析結果 : Staphylococcus aureus本菌は免疫抑制状態である患者の口腔由来検体より検出された。カタラーゼ陰性のグラム陽性球菌で、コロニーはS. aureus様で、PSラテックス栄研、LV反応陽性であった。Walk away (ベックマン・コールター)では99.9%の確率でS. aureusと同定された。以上より、カタラーゼ陰性のS. aureusと同定された。Staphylococcus属は通常カタラーゼ陽性であり、検査ではカタラーゼ陰性株の存在を考慮すべきと思われた。

1. Objective to study the characteristics of microorganisms, microorganisms, biochemistry, biochemistry, biochemistry and biochemistry. Every day, every day, there are rare bacteria, rare bacteria and rare bacteria. In this study, 116s rRNA analysis, 116s rRNA analysis, 116s PCR analysis, 116s DNA analysis, 116s PCR analysis and 116s PCR analysis. two。 The method of research is to determine the same number of plants in the same way. 16s rRNA analysis, 16s rRNA extraction (boiling method), 16s rRNA field extraction (PCR method), 16s DNA extraction (boiling method), 16s DNA extraction ( The center of phenotypic traits and biochemical traits were observed. The background of the strain was detected, and the reference was detected. 3. Main results: (1) 16s rRNA analysis results: Sphingomonas paucimobilis gonadotropin, yellow pigmentation, DNase gonorrhoeae. The yellow pigment has a special color. It is possible to use the same word "NF18" to confirm that it is possible to cause serious problems. Walk away has the same confirmation rate of 50%. This bacteria has the same confirmation rate. S. paucimobillus pathogenicity was low and the pathogenic bacteria were found to be infected. In this case, the patient with immunosuppression, the isolation material, the causative bacteria, the severe case, the patient, the patient and the isolation material. (2) the results of 16SrRNA analysis: Staphylococcus aureus patients with immunosuppressive status were diagnosed as having oral origin and diarrhea. All the patients were infected with gonococci, S. aureus, PS, and LV. The confirmation rate of Walk away is 99.9% and the confirmation rate of S. aureus is the same as that of others. The above information is the same as that of S.aureus. Staphylococcus belongs to the genus that usually has a sexual disorder, and a sexual strain that has been examined and thought about.