地域特化型魚卵ＤＮＡ種判別マーカーの開発と検証

区域特异性鱼卵DNA物种识别标记的开发和验证

• 批准号: 26924004
• 负责人: 川口 亮
• 金额: $ 0.38万
• 依托单位: University of the Ryukyus
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26924004/
• 关键词: 沖縄県中城湾; 魚卵; 分子マーカー

本研究では、沖縄県中城村浜漁港周辺海域を調査対象とし、マルチネットを用いた魚卵採集を夏期、秋期、冬期に行った。得られた魚卵は実体顕微鏡下で形態によりグルーピングし、デジタルカメラで形質を記録しDNA分析に供した。187試料を分析した結果、149試料でmtDNA 16SrRNA遺伝子の約550塩基対を決定した。種判別用分子マーカー作成に必要なDNAデータベースを構築するため、中城湾に隣接する漁港で水産魚種を中心に17科43属54種を採集した。さらに以前に構築した沖縄産魚類データベースと統合することで、本海域に出現する分類群を広くカバーするデータベースを構築出来た(51科118属198種)。DNA分析の結果、魚卵は32ハプロタイプに大別され、これらは形態によるグループ分けとほぼ一致した。これらのうち19タイプでは種同定が、4タイプで近縁種の同定が行え、各時期における産卵魚種の種構成が明らかとなった。今回採取された魚卵にはシロクラベラやスジブダイ、タイワンダイ、オキナワキチヌなど中城湾において水産上重要であり、市場価値の高い種も含まれていた。本研究の結果から、中城湾の水産上の重要性が示唆された。本研究では19種の魚卵の形態を記載することが出来たが、今後より多くの種で卵形態の記載が進めば、これまで卵の同定が不可能であった従来の環境調査法に新たな可能性を与えると考える。また、分子マーカーの安価かつ簡便な検出法を開発することで分析精度が飛躍的に高まると期待する。本研究で作成した分子マーカーは調査海域の魚類を広くカバーしており、分子マーカーを使用した魚類研究の土台を作成したと考える。本研究に供した成魚標本は美ら海水族館および琉球大学医学部で管理している。分子マーカーに紐付けされた標本が容易に参照可能な本研究のデータベースは、沖縄県の魚類研究の発展に極めて有用である。

This study investigated the fish eggs collected in summer, autumn and winter. The fish eggs were collected under microscope, and their morphology and quality were recorded for DNA analysis. 187 samples were analyzed and 149 samples were determined by about 550 bp of mtDNA 16S rRNA gene. Species identification molecules necessary for the construction of fish species in the vicinity of the Central City Bay, 54 species belonging to 43 genera The taxonomic groups (51 families, 118 genera, 198 species) of fish species in this area were constructed. The results of DNA analysis are consistent with those of fish eggs. The species composition of spawning species in each period is clear. This time, we will take the fish eggs and fish eggs, and the fish eggs and fish eggs will be sold in the market. The results of this study demonstrate the importance of aquatic products in the Central City Bay. In this study, the morphology of 19 species of fish eggs was recorded, and the morphology of many species of fish eggs was recorded. A simple method of detection is developed to improve the accuracy of analysis. This study was conducted on the basis of molecular data. This study was conducted by the Department of Health, University of the Ryukyus. The molecular structure of the fish can be easily referred to in this study.