1番染色体短腕に座位する新規造血器腫瘍疾患関連遺伝子の単離
1号染色体短臂上新型造血肿瘤疾病相关基因的分离
基本信息
- 批准号:08770870
- 负责人:
- 金额:$ 0.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:1996
- 资助国家:日本
- 起止时间:1996 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1995年,研究者らはヒト1番染色体短腕に特異的な411個のDNAマーカーを単離し,これらを用いた蛍光in situハイブリダイゼーション(fluorescence in situ hybridization;FISH)法で,平均マップ距離が約0.3Mbの高精度・高密度なヒト1番染色体短腕物理地図と1p36.1領域の配列地図を作製している(Genomics Vol.25:114-123,1995).この染色体物理地図と配列地図をもとに,1番染色体短腕に転座切断点を有する造血器腫瘍症例での解析を行い新規造血器腫瘍疾患関連遺伝子を単離することを目的に本研究を開始した.まず,1p36.1領域の配列地図(tel(cCI)163-41-11-1-226-586-568-614-631-665-451-199-190-561-241-74-176-652-cen)をもとに,近年開発したprophase FISH ordering systemとstretched DNA FISH法で1p36.1領域のさらに高精度・高密度な配列地図を作製した.次に,この配列地図を用い,t(1;17)(p36.1;q21.3)と1p36.1領域に転座切断点を認めた骨髄増殖性疾患症例の転座切断点の解析を行った.しかし,1p36.1領域内には転座切断点を認めなかったため,1p36.1からセントロメア側へ配列地図を延長し解析を進めた.結果,tel-(cCI)652-484-67-670-16-break point-440-21-cenと転座切断点の座位を同定することができた.このことは,従来のG-バンド分染法による染色体分析では1番染色体の転座切断点は1p36.1としか同定し得なかったが,今回の解析ではDNAマーカーcCI-16とcCI-440の間,つまり,転座切断点が1p34.2-p33であることを確認することが可能であった.したがって,このヒト1番染色体短腕物理地図と1p36.1領域の配列地図の有用性が示された.現在は得られた転座切断点近傍のDNAマーカーcCI-16とcCI-440を用い,転座切断点そのものを含むYACクローンを単離している.今後そのYACクローンを用い転座切断点の遺伝子を同定する予定である.
In 1995, researchers isolated 411 DNA fragments specific to the short arm of chromosome 1, using fluorescence in situ hybridization (FISH) method. The average DNA fragment distance was about 0.3 Mb with high precision and high density (Genomics Vol.25:114- 123, 1995). This study is aimed at the analysis of hematopoietic tumor cases based on the analysis of chromosome physical location, chromosome alignment, chromosome 1 short arm locus cleavage point, and new rules for the analysis of hematopoietic tumor disease-related genes. In recent years, a phase FISH ordering system and stretched DNA FISH method have been developed for the preparation of high precision and high density DNA FISH sequences in the 1p36.1 domain. In the second place,t(1;17)(p36.1;q21.3) and 1p36.1 domain, the locus cut point is identified and analyzed in cases of reproductive disease. 1p36.1-- As a result,tel-(cCI)652-484-67-670-16-break point-440-21-cen. The chromosome analysis of chromosome 1 showed that the locus cleavage point of chromosome 1 was 1p36.1, and the locus cleavage point of chromosome 1 was 1p34.2-p33. The usefulness of the alignment of the domain 1p36.1 was demonstrated. Now we have the DNA sequence near the point of cleavage, cCI-16 and cCI-440, and the DNA sequence near the point of cleavage contains YAC. In the future, the YAC will be used to cut off the transmission point.
项目成果
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