タンパク質の機能発現に関するダイナミクス的解釈

蛋白质功能表达的动态解释

• 批准号: 11740218
• 负责人: 中川 尚子
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Ibaraki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-11740218/
• 关键词: タンパク質; エネルギー蓄積; カオス; エントロピー; 部分熱浴系; エネルギーの遅い緩和; タンパク質のエネルギー蓄積

タンパク質における励起エネルギーの長時間蓄積のメカニズムを探り、励起後の非平衡状態とその後の変化の方向性を力学的立場から特徴付けるため、励起エネルギーが大きくなればなるほど、系の他の部分との相互作用が弱くなるという性質を持つハミルトン力学系を用いて研究を行ない、以下の結果を得た。(1)励起エネルギーの大きさにたいし指数関数的に緩和時間が長くなる系が存在する。(2)緩和はもともと系のダイナミクスがカオス的でないと起こり得ない。(3)緩和はカオス的性質を持つ部分系同士の相互作用が、各部分系のダイナミクスのカオス性を増長することにより起こる。(4)特徴的緩和時間はカオスの増長分によって決まっている。(5)非平衡状態での熱力学エントロピーの時間変化はカオスの増長分のKSエントロピーに比例する。この研究で得た関係式は、このモデル系だけでなくより一般的に成立する可能性がある。もしそうだとすると、非平衡状態での遷移過程でも計算できる量(KSエントロピー)によって熱力学的エントロピーの変化にてらしあわせることができ、今扱っているような緩和の問題だけでなく、もっと複雑なタンパク質の機能発現の諸相に関しても、有用な情報をもたら

タ ン パ ク qualitative に お け る wound up エ ネ ル ギ ー の long time accumulation の メ カ ニ ズ ム を agent り non-equilibrium state, after wound up の と そ の after の - の を mechanics direction of position か ら 徴 pay especially け る た め, excitation エ ネ ル ギ ー が big き く な れ ば な る ほ ど, part is の he の と の weak interaction が く な る と い う nature を hold つ ハ ミ ル ト ン department of force Youdaoplaceholder0 by using the て て to study the を line な な, the following <s:1> results を give た. (1) The に relaxation time が of the エネ, エネ, ギ, エネ, large さにた, さにた, が of the <s:1> exponential number が is long. The くなる system が exists する. (2) ease は も と も と is の ダ イ ナ ミ ク ス が カ オ ス of で な い と up こ り must な い. (3) ease は カ オ ス を hold つ part is the nature of interaction with people の が, each part is の ダ イ ナ ミ ク ス の カ オ ス sex を raised long す る こ と に よ り up こ る. (4) The relaxation time of the characteristics is カ カ ス ス <s:1>, and the increase is によって determined by まって る る. (5) the non-equilibrium state で の thermodynamics エ ン ト ロ ピ ー の time variations change は カ オ ス の raised long points の KS エ ン ト ロ ピ ー に proportion す る. The <s:1> <s:1> study で obtained the た relation formula た, the <s:1> モデ モデ で system だけでなくよ general に holding する possibility がある. も し そ う だ と す る と and non-equilibrium state で の migration process で も computing で き る quantity (KS エ ン ト ロ ピ ー) に よ っ て thermodynamic エ ン ト ロ ピ ー の variations change に て ら し あ わ せ る こ と が で き, today Cha っ て い る よ う の な eased だ け で な く, も っ と complex 雑 な タ ン パ ク qualitative の function 発 の now the phase に masato し て な も and useful information Youdaoplaceholder0 を たら

项目成果

小松輝久,稲垣紫緒,中川尚子,那須野君: "Creep Motion in a Granular Pile Exhibiting Steady Surface Flow "Physical Review Letters. 86. 1757-1760 (2001)

Teruhisa Komatsu、Sio Inagaki、Naoko Nakakawa 和 K. Nasuno：“表现出稳定表面流动的颗粒堆中的蠕变运动”物理评论快报 86。1757-1760 (2001)

中川尚子,金子邦彦,小松輝久: "Long-term Relaxation of a Composite System in Partial contant with a HeaT Bath"Journal of Physical Society Japan. 69. 3214-3222 (2000)

Naoko Nakakawa、Kunihiko Kaneko、Teruhisa Komatsu：“部分含有热浴的复合系统的长期松弛”日本物理学会杂志 69. 3214-3222 (2000)。

中川 尚子、金子 邦彦: "Energy storage in a Hamiltonian System in Partial contact with a heat bath"Journal of Physical Society Japan. (in press).

Naoko Nakakawa、Kunihiko Kaneko：“与热浴部分接触的哈密顿系统中的能量存储”日本物理学会杂志（正在出版）。