ハミルトン力学系を用いたタンパク貭機能発現のモデル作成と動力学的特徴付け

使用哈密顿动力学系统进行蛋白质功能表达的模型创建和动态表征

基本信息

  • 批准号:
    13740231
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.34万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2001
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2001 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

筋肉を構成する基本的な運動タンパク質(分子モーター)を念頭に置き、二種類のタンパク質が相互作用によって自律的に運動する様子を数理モデルで表した。今年度は特に、このモデルの解析を元に、タンパク質が生体内のような大きく揺らぐ環境の下でも頑強に機能を実現する仕組みを、ダイナミクスの立場から堤案することを目指した。実際、タンパク質はいつでも画一的な機能発現をするのではなく、状況に応じて機能発現の度合いを調節しているように見受けられる。このような柔軟な機能発現がタンパク質分子自身によって自己制御される様子は、身近なマクロ機械の動作原理とは大きく異なっているだろう。本研究で用いたモデルは、入力されるエネルギー量や環境の温度変化、与えられる負荷量に対し、柔軟に対応することが可能である。このモデルの解析から得られた柔軟な機能発現を実現する機構は以下のようであった。発現過程を開始するために分子の一部に外部からエネルギーを与えると、エネルギーが他の部分に移っていく過程において、段階に応じて相互作用の変化が促されていることがわかる。これは、システムのダイナミクスによる自律的制御の結果可能になっており、この自律的制御により、エネルギーの無駄な散逸が抑制され、入力エネルギーが確実で効率的に機能に変換されている。特にダイナミクスの中のカオス性の制御は、有効な仕事(機能)の取り出しと発現過程のルース性に重要な位置を占めることが示唆されている。この研究結果は現在投稿準備中である。
The muscles and muscles become the basic mechanism of action, the concept of molecular medicine, the concept of interaction, the regulation of self-discipline, the mathematics and physics of the table. This year, we are going to make an analysis of the financial situation this year, and we will be able to improve the performance of the government and government organizations under the environmental protection environment. In the international market, the machine that is responsible for drawing one is able to see that the machine is in line with the situation and that the machine is in line with the situation. The flexible machine is able to make and control the machine by itself, and the mechanical operation principle of the machine is close to it. In this study, it is possible to increase the temperature of the environment, the temperature of the environment and the temperature of the environment. It is possible to verify that the flexible machine is able to make sure that the following information is available to the operator. At the beginning of the process, we need to introduce an external information management system, some of which are related to the process, and how to improve the interaction between the two parties. The results of the control of self-discipline may be due to the failure of the control system, the control system of self-regulation, the control of self-regulation, the failure of emission suppression, and the ability of the machine to ensure the failure rate. Special attention has been paid to the control of sex in the market, and the important position of the staff (opportunity) in the process of realizing the process has been taken up. The results of the study are now being reviewed in preparation for submission.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Naoko Nakagawa, Kunihiko Kaneko: "Dynamical mechanism for conversion of energy at a molecular scale"Physical Review E. 67(掲載予定). (2003)
Naoko Nakakawa、Kunihiko Kaneko:“分子尺度能量转换的动态机制”Physical Review E. 67(待出版)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Naoko Nakagawa, Kunihiko Kaneko: "Relaxation,the Boltzmann-Jeans Conjectme and Chaos"Physical Review E. 64. 055205-1-055205-4 (2001)
Naoko Nakakawa、Kunihiko Kaneko:“松弛、Boltzmann-Jeans 猜想和混沌”物理评论 E. 64. 055205-1-055205-4 (2001)
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 作者:
    J. Habasaki;K.L. Ngai;中川 尚子
  • 通讯作者:
    中川 尚子
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    J. Habasaki;K. L. Ngai;中川 尚子
  • 通讯作者:
    中川 尚子

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