浸透圧ストレス応答としての硫酸化糖脂質発現制御機序の解明

阐明硫酸化糖脂表达作为渗透应激反应的调节机制

• 批准号: 11770028
• 负责人: 西澤 和久
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Teikyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-11770028/
• 关键词: 硫酸化糖脂質; 塩基性アミノ酸; 分子進化; コドン反復性; 配列アラインメント; MDCK細胞

MDCK細胞における,硫酸化糖脂質の機能を解析するため,セレブロシドスルホトランスフェラーゼとセラミドガラクトシルトランスフェラーゼのダブルトランスフォーマントを作成し,SM4s(GalCerI3-sulfate)の発現上昇を確認した.この発現株ではプレートに対する接着性の上昇がみられることから,ラミニンなどの基質への接着性の変化を解析中である.また,硫酸化多糖との結合ペプチドモチーフの解析を端緒として,真核生物のタンパクには同一のアミノ酸の繰り返しがみられることを見出し報告した.ショウジョウバエとヒトとの間で保存されているタンパクについても,この反復性がみられることから,遺伝子断片の挿入欠失を伴わずに,こうした反復を生じる機構の存在が示唆された.一方,コドンの第3ポジションの塩基については,(アミノ酸の反復を伴わない)原始的タンパク(大腸菌との相似があるもの)においても,反復性がみられることから,点突然変異そのものにも,例えば周りにCが多いとCに変わりやすいという傾向があることが示唆された.実際,哺乳動物間の多数のアラインメントからもこうした傾向は明らかになった.また,遺伝子配列の反復性と局所的重複の起こりやすさの関連について不明の点が多いため,従来の挿入欠失を扱えなかったモデルと異なり,数値的シミュレーションとマルコフ連鎖モンテカルロ法を利用し一般化した,DNAアラインメント・分子進化解析モデルを作成した.解析の結果,数ntスケールの挿入,欠失の多くのケースで,いわゆるDNAslippageが関与していることが示唆された.

MDCK cells に お け る, function of sulfating sugar lipid の を parsing す る た め, セ レ ブ ロ シ ド ス ル ホ ト ラ ン ス フ ェ ラ ー ゼ と セ ラ ミ ド ガ ラ ク ト シ ル ト ラ ン ス フ ェ ラ ー ゼ の ダ ブ ル ト ラ ン ス フ ォ ー マ ン ト を し consummate, SM4s (GalCerI3 - sulfate) の 発 now rising を confirm し た. こ の 発 now strains で は プ レ ー ト に す seaborne る then rising sex の が み ら れ る こ と か ら, ラ ミ ニ ン な ど の matrix へ の then sex の variations in the を analytic で あ る. ま た, sulfated polysaccharide と の combining ペ プ チ ド モ チ ー フ の parsing を clue と し て, eukaryotes の タ ン パ ク に は same の ア ミ ノ acid の Qiao り return し が み ら れ る こ と を see し report し た. シ ョ ウ ジ ョ ウ バ エ と ヒ ト と の で between save さ れ て い る タ ン パ ク に つ い て も, こ の repetitive が み ら れ る こ と か ら, posthumous son 伝 fragment の scions into owe を loss with わ ず に, こ う し た repeatedly を raw じ る institutions の が in stopping さ れ た. Side, コ ド ン の 3 ポ ジ シ ョ ン の salt base に つ い て は, (ア ミ ノ acid の を repeatedly with わ な い) original タ ン パ ク (coliform と の similar が あ る も の) に お い て も, repetitive が み ら れ る こ と か ら, point - vision suddenly そ の も の に も, example え ば weeks り に C が more い と C に - わ り や す い と い う tendency が あ る こ と が Sot された. Be international, most mammals の between の ア ラ イ ン メ ン ト か ら も こ う し た tendency は Ming ら か に な っ た. ま た, heritage 伝 with sequence の repetitive と bureau of repeat の こ り や す さ の masato even に つ い て unknown の point more than が い た め, 従 to の scions into owe lost を Cha え な か っ た モ デ ル と different な り, several numerical シ ミ ュ レ ー シ ョ ン と マ ル コ フ モ chains ン テ カ ル ロ を using し generalization し た, DNA ア ラ イ ン メ ン ト molecular evolution, parsing モ デ ル を made し た. Parsing の results, several nt ス ケ ー ル の scions, owe の loss く の ケ ー ス で, い わ ゆ る DNAslippage が masato and し て い る こ と が in stopping さ れ た.

项目成果

Manaml Nishizawa,Kazuhisa Nishizawa: "Amino acid and nucleotide recurrence in aligned sequences : Synonymous substitution patterns in association with global and local base."Nucleic Acids Research. 28. 3801-3810 (2000)

Manaml Nishizawa、Kazuhisa Nishizawa：“比对序列中的氨基酸和核苷酸重现：与全局和局部碱基相关的同义替换模式。”核酸研究。

Kazuhisa Nishizawa: "Tendency for local repetitiveness in amino acid usages in modern human proteins"Journal of Molecular Biology. 294. 937-953 (1999)

Kazuhisa Nishizawa：“现代人类蛋白质中氨基酸使用的局部重复倾向”分子生物学杂志。