先天異常とダイオキシン受容体関連蛋白の多型との相関:性腺機能障害と口蓋裂

先天性异常与二恶英受体相关蛋白多态性的相关性：性腺功能障碍与腭裂

• 批准号: 13877122
• 负责人: 小崎 健次郎
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-13877122/
• 关键词: ダイオキシン; ゲノム; 連関解析; ダイオキシン受容体; ミクロペニス; 内分泌撹乱物質; 環境ホルモン; バイオインフォマティクス; 多型; 先天異常; 奇形; 催奇形因子; 環境因子; 内分泌撹乱因子

平成15年度はヒトゲノムドラフト配列データベースを用いてマウスダイオキシン受容体抑制因子AHRRのヒト相同遺伝子を同定した。ヒトとマウスのAHRRアミノ酸配列は81%の相同性を認めた。ラジエーションハイブリッドマッピングにより、AHRRは5pterにマップした。AHRR蛋白の多型Pro185AlaをPAS-A領域と高度に保存されたアルギニン・システインの豊富なRCFRCRL/VRC領域との間に同定した。さらに矮小陰茎(<-2.5SD)の患者群とコントロール群の検体を用いて、Pro185Ala多型と矮小陰茎の有無との関連を検討した。185Proホモ接合体の割合は、矮小陰茎患者群で46%(27/59)、コントロール群で27%(22/80)と著明な差を認めた(p=0.03)。185Proホモ接合体が矮小陰茎傾向を増すとすると、AHRを介するシグナル伝達経路におけるAHRRのネガティヴな役割を考えると、AHRR-185Proアレルは、AHRR-185Alaアレルよりも、ARNTに対してより弱い抑制作用を呈すると予測される。ダイオキシンの作用が、ダイオキシン受容体を介することは明らかにされているものの、ダイオキシン受容体の下流標的遺伝子は大部分不明である。そこで平成14年度はゲノム配列の網羅的なコンピューター解析を行い、XREが転写開始点の近傍に比較的密度濃く存在している遺伝子を探素した。遺伝子の転写開始点より10kb上流の配列をデータベース化し、その配列上において特定の塩基配列の位置を同定するためのLinuxプログラムを開発しXREのcore sequenceであるGCGTG配列の位置データのパラメーターを作成し、それをもとに主成分分析を行った。XREを介して転写活性が上昇することが証明されている遺伝子は、第1主成分・第2主成分を2軸とする平面上においてやや外側に位置していることを明らかにした。

Pp.47-53 15 year は ヒ ト ゲ ノ ム ド ラ フ ト match column デ ー タ ベ ー ス を with い て マ ウ ス ダ イ オ キ シ ン inhibitory factor by let body AHRR の ヒ ト same heritage 伝 son を be し た. Youdaoplaceholder0 ヒトと ウス ウス <s:1> AHRRア ノ ノ acid configuration ウス 81% <s:1> homogeneity を recognition めた. ラ ジ エ ー シ ョ ン ハ イ ブ リ ッ ド マ ッ ピ ン グ に よ り, AHRR は 5 pter に マ ッ プ し た. の AHRR protein polymorphism Pro185Ala を と PAS - A field highly に save さ れ た ア ル ギ ニ ン · シ ス テ イ ン の aboundant な RCFRCRL と / VRC field between の に be し た. さ ら に short penis (< 2.5 SD) の group of patients with と コ ン ト ロ ー ル group の を 検 body with い て type, Pro185Ala と short penis の presence of と の masato even を beg し 検 た. 185 pro ホ モ gametes の cut は, short penis で patients group 46% (27/59), コ ン ト ロ ー で ル group 27% (22/80) poor と zhao Ming な を recognize め た (p = 0.03). 185 pro ホ モ gametes が short penis tendency を raised す と す る と, AHR を interface す る シ グ ナ ル 伝 da 経 road に お け る AHRR の ネ ガ テ ィ ヴ cut を な service exam え る と, AHRR - 185 pro ア レ ル は, AHRR - 185 ala ア レ ル よ り も, ARNT に し seaborne て よ り weak い inhibition を show す る と to Measure される. ダ イ オ キ シ ン の が, ダ イ オ キ シ ン を interface by let body す る こ と は Ming ら か に さ れ て い る も の の, ダ イ オ キ シ ン heritage by let body の low bid 伝 son は most unknown で あ る. そ こ で pp.47-53 14 year は ゲ ノ ム match column の snare な コ ン ピ ュ ー タ ー parsing を い, XRE が planning write の close to the starting point exist alongside に compare the density of the concentrated く し て い る heritage 伝 son を agent element し た. Posthumous son 伝 の planning write starting point よ り 10 KB high の match column を デ ー タ ベ ー ス し, そ の column deserve に お い て specific の salt base with fixed position with column の を す る た め の Linux プ ロ グ ラ ム を open 発 し XRE の core Column sequence で あ る GCGTG match の location デ ー タ の パ ラ メ ー タ ー を し, consummate そ れ を も と に pca を line っ た. XRE を interface し て planning write activity が rise す る こ と が prove さ れ て い る heritage 伝 は, principal components, principal component を 2 1 2 axis と す る plane に お い て や や lateral position に し て い る こ と を Ming ら か に し た.

项目成果

Fujita H, Kosaki R, Yoshihashi H, Ogata T, Tomita M, Hasegawa T, Takahashi T, Matsuo N, Kosaki K.: "Characterization of the aryl hydrocarbon receptor repressor gene and association of its Pro185Ala polymorphism with micropenis"Teratology 2002. 65(1). 10-1

Fujita H、Kosaki R、Yoshihashi H、Ogata T、Tomita M、Hasekawa T、Takahashi T、Matsuo N、Kosaki K.：“芳烃受体阻遏基因的特征及其 Pro185Ala 多态性与小阴茎的关联”Teratology 2002. 65

Hideki Fujita: "Characterization of the aryl hydrocarbon receptor repressor gene and association of its Pro185Ala polymorphism with micropenis"Teratology. 65(1). 10-18 (2002)

Hideki Fujita：“芳基碳氢化合物受体阻遏基因的特征及其 Pro185Ala 多态性与小阴茎的关联”畸胎学。

Tomohiro Ishii: "Micropenis and the AR Gene : mutation and CAG repeat-length analysis"Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 86(11). 5372-5378 (2001)

Tomohiro Ishii：“小阴茎和 AR 基因：突变和 CAG 重复长度分析”临床内分泌与代谢杂志。