臨床応用に向けたクロマチン免疫沈降PCR法を用いたp53機能解析法の開発

染色质免疫沉淀PCR法p53功能分析方法的开发及临床应用

• 批准号: 15659130
• 负责人: 加藤 俊介
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15659130/
• 关键词: ChIPアッセイ; p53; 96穴プレート; 培養細胞; SaOS2,SF126

まず、酵母を用いたp53機能解析法(FASAY法)にて確認した内因性に正常型p53を有する2種類の培養細胞(A549:肺癌細胞(嚢胞腺癌)、C32TG:悪性黒色腫細胞)、内因性に機能変異型p53を有する3種類の培養細胞(HSC-4:頭頸部腫瘍細胞(扁平上皮癌):R248Q、T.Tn:食道癌細胞(扁平上皮癌):V272M、Mewo:悪性黒色腫細胞:E258K)を用いて、前年度の研究で設定したクロマチン免疫沈降とPCR条件を用いて、p53の下流遺伝子とされる36遺伝子(40 PCR fragment)のプロモーター領域へのp53蛋白質の結合能について網羅的な解析を行なった。その結果、過去に報告されたp53蛋白質の標的配列を有する下流遺伝子であっても、細胞によってはDNAとの結合が観察されない遺伝子も認められた一方、変異型p53蛋白質であっても、HDM2によるネガティブフィードバックを受けないために過剰発現を起こしている細胞では、部分的にDNA結合能力を回復する可能性が示された。また、p53のstatusあるいは由来組織のどちらかが同一であっても、p53に対する免疫沈降法で共沈するDNA配列が異なることが観察された。これらの結果は既知の下流遺伝子が単離された過程が過剰発現系を用いていたため内因性のp53の本来の標的ではなかった可能性もあるが、もう一つの可能性としてp53は変異特異的、組織特異的な修飾因子により下流標的配列の使い分けを行っている可能性も示唆するものであった。今後、様々な培養細胞を用いて、p53蛋白質に対するクロマチン免疫沈降と網羅的なPCR法から得られたp53標的下流遺伝子群のプロファイルを作成し、組織型や抗がん剤感受性情報を含んだデータベースと組み合わせることで、p53蛋白質の転写活性化に関与する種々の因子や治療標的分子のスクリーニングに応用できるものと考えられた。

Analysis of p53 function in yeast and yeast (FASAY method) to confirm the presence of endogenous p53 in two types of cultured cells (A549: lung cancer cells (adenocarcinoma cells), C32TG: malignant melanoma cells), endogenous functional variant p53, three types of cultured cells (HSC-4: head and neck tumor cells (squamous cell carcinoma): R248Q, T.Tn: esophageal carcinoma cells)(squamous cell carcinoma): V272M, Mewo: black cells: E258K) was used in the previous year's study. p53 protein binding energy analysis of p53 protein binding energy analysis of p53 protein binding energy analysis. The results of previous reports indicate that there is a possibility that DNA binding to p53 protein in cells can be restored to normal. DNA alignment by immunoprecipitation with p53 and p53 was detected. The result is that the known downstream modifier is separated from the process, and the occurrence system is used. The intrinsic target of p53 is used. The probability of occurrence is used. The probability of occurrence is used. The p53 is used. The probability of occurrence is used. In the future, the use of cultured cells, p53 protein, immunosedimentation and network PCR method to obtain p53 target downstream gene subgroup, tissue type, anti-susceptibility information, including the composition of the gene, p53 protein activity related to the gene factor and therapeutic target molecule, the use of the gene.