ウシ肝cDNAマイクロアレイの評価と妊娠ウシ肝の特異発現遺伝子の検索

牛肝cDNA微阵列评价及妊娠牛肝差异表达基因的寻找

• 批准号: 16658105
• 负责人: 橋爪 一善
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Iwate University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16658105/
• 关键词: マイクロアレイ; 肝臓; ウシ; in situ hybridization; オリゴアレイ; 遺伝子; 子宮・胎盤

ウシ肝臓由来cDNAクローンを基に作製したウシ肝cDNAマイクロアレイの有効性を未知クローンの配列、機能、発現動態の解析、検証することから、ウシ肝の生理状態の把握および疾病診断に適用できる汎用的なアレイの開発を目的として、より広範な遺伝子情報を集積した約10,000オリゴ情報からなるアレイを作製した。発現遺伝子動態の解析には体細胞クローンウシと通常の方法で作出したウシ肝臓を用いた。体細胞クローンウシでは病理および組織学的に変異を示す肝臓が認められるが、著しい病理変異を示さない肝臓であっても数%の遺伝子の発現変動を認め、cDNAアレイに含む数多くの遺伝子情報は、現在のところ機能が十分明確でなくとも肝臓の機能診断に有効な情報であることが示唆された。また、機能および遺伝子の全配列が不明であったcDNAクローンからその発現動態およびin silico解析により、2種の新規遺伝子であるプロラクチン関連タンパク質(PRP)遺伝子を同定し、PRP-VIIIおよび-IXと命名するとともに、in situ hybridizationにより主たる発現細胞が胎盤の二核細胞であることを証明した。加えて、これまで開発してきたウシ肝cDNAマイクロアレイおよび子宮・胎盤cDNAマイクロアレイ上の共通する遺伝子の検証およびin silico解析することから、約10,000オリゴを配置したウシオリゴアレイを作製した。このオリゴアレイは約2,620個の肝由来クローン情報および約1,730個の子宮・胎盤由来クローンを軸として、Gene Bank Database情報を基に抽出した約5,600遺伝子の60塩基配列からなる個別遺伝子情報を集積したものである。尚、本アレイの作製は、これまでアレイ開発で連携してきた農業生物資源研究所のグループとの共同成果である。

The gene sequence, function, development dynamics, identification, identification The common methods for analyzing the dynamics of genetic mutations in somatic cells are to make them useful. Somatic cell morphology, pathological and histological changes, liver function, liver function. The complete sequence of the gene is unknown, the cDNA sequence is unknown, and the development dynamics of the gene is demonstrated in silico analysis. Two new gene sequences are identified, PRP-VIII and PRP-IX are named, and the development of the primary cell is demonstrated in situ hybridization. In addition, it is necessary to develop a common gene on the liver cDNA and uterus placenta cDNA and to analyze it in silico. It is necessary to configure it by about 10,000 degrees. About 2,620 pieces of liver origin information were extracted from the Gene Bank Database, and about 1,730 pieces of uterus origin information were collected from the Gene Bank database. The joint efforts of the Institute of Agricultural Bioresources and the Institute of Agricultural Bioresources

项目成果

Biology of the prolactin family in bovine placenta. II. Bovine prolactin-related proteins: Their expression, structure and proposed roles.

牛胎盘催乳素家族的生物学。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Animal Science J 77
• 作者: Ushizawa K ;et. al.;Ushizawa K & Hashizume K
• 通讯作者: Ushizawa K & Hashizume K

Cloning and expression of two new prolactin-related proteins, prolactin-related protein-VIII and-IX, in bovine placenta.

两种新的催乳素相关蛋白（催乳素相关蛋白-VIII 和-IX）在牛胎盘中的克隆和表达。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Reprod Biol Endocrinol. 3
• 作者: Ushizawa K;Takahashi T;Hosoe M;Kaneyama K;Hashizume K
• 通讯作者: Hashizume K

Developmental aberration of liver gene expression in bovine fetuses derived from somatic cell nuclear transplantation.

体细胞核移植牛胎儿肝脏基因表达的发育异常。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Clon.Stem Cells 8(In press)
• 作者: Hearth CB;Ishiwata H;Shiojima S;Kadowaki T;Katsuma S;Ushizawa K;Imai K;Takahashi T;Hirasawa A;Takahashi S;Izaike Y;Tsujimoto G;Hashizume K
• 通讯作者: Hashizume K

Cloning of the bovine antiapoptotic regulator, BCL2-related protein A1, and its expression in trophoblastic binucleate cells of bovine placenta.

牛抗凋亡调节因子 BCL2 相关蛋白 A1 的克隆及其在牛胎盘滋养层双核细胞中的表达。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Biol Reprod 74
• 作者: Ushizawa K ;et. al.
• 通讯作者: et. al.

Gene expression profiles of bovine trophoblastic cell line (BT-1) analyzed by a custom cDNA microarray.

• DOI: 10.1262/jrd.16072
• 发表时间: 2005-04
• 期刊: The Journal of reproduction and development
• 作者: K. Ushizawa;Toru Takahashi;K. Kaneyama;T. Tokunaga;Y. Tsunoda;K. Hashizume