海洋に分布する第三の微粒子群?-高度光学手法を用いた萌芽的究明
海洋に分布する第三の微粒子群?-高度光学手法を用いた萌芽的究明
批准号:
18651007
负责人:
永田 俊
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
フローサイトメトリーを用いた微粒子検出における重要な検討課題はノイズの削減である。本年度の研究では、前年度に引き続き、海水中に分布する微粒子のモデルとしてウィルス粒子を考え、そのシグナルを明瞭に分離することを目標として、機器と分析方法の最適化を進めた。なお、ウィルス粒子は直径が20-50nmであり、本研究が目標とする微粒子の粒径とほぼ等しい範囲にある。ノイズは電気的ノイズ、シース溶液に由来するノイズ、光学的ノイズ、各種試薬に由来するノイズに分類することができる。これらのノイズに関する検討を進め、シースや試薬に由来するノイズに関しては、試料の取り扱い方法や試薬の製造元や調整方法を大幅に改良することができた。しかし、DNAの検出に用いられるSYBR GREEN I以外の試薬(ナイルレッド、アクリジンオレンジなど)に関しては、試薬自体のノイズが高く、また、シグナルが十分に強くないことから、本研究がターゲットとする微粒子の検出には適さないことが明らかになった。そこで、SYBR GREEN Iを用いて、外洋域で採取された試料について、微粒子解析を進めたところ、ウィルス様粒子については、これをを2つないしは3つのクラスターに明瞭に分離することができた。この方法を用いて、学術調査船白鳳丸の中部太平洋南北断面観測航海などで採取されたサンプルの解析を進めた。その結果、広範な海域において、ウィルスと同様なサイズの非生物粒子が存在することが確認された。ただし、シグナルの強度が不安定であるため、その粒子数の確定や、出現パターンの解析を行うためには、染色条件や測定条件についてのより詳細な検討が必要であることが明らかになった。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Distribution patterns of viruses and their subclusters in the upper water columns of the Pacific and Southern Oceans
太平洋和南大洋上层水体中病毒及其亚群的分布模式
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yang, Y., Yokokawa, T., Motegi, C., Nagata, T]
通讯作者:
T
Microbial Ecology of the Oceans (2nd edition)
海洋微生物生态学(第二版)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
John Wiley & Sons (in press)
影响因子:
--
作者:
[Nagata, T]
通讯作者:
T
生物の多様性って何だろう
什么是生物多样性?
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[永田 俊, 茂手木千晶(京都大学総合博物館・京都大学生態学研究センター編)]
通讯作者:
茂手木千晶(京都大学総合博物館・京都大学生態学研究センター編)
Tungstate compounds as an alternative to uranyl acetate for enumerating viral-infected prokaryote cells in aquatic systems.
钨酸盐化合物作为乙酸双氧铀的替代品,用于计数水生系统中病毒感染的原核细胞。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Aquatic Microbial Ecology 47
影响因子:
--
作者:
[A. S. Pradeep Ram, T. Nagata, Y. Tomaru, K. Nagasaki]
通讯作者:
K. Nagasaki
Tungstate compounds as an alternative to uranyl acetate for enumerating viral infected prokaryote cells in aquatic systems
钨酸盐化合物作为醋酸双氧铀的替代品,用于计数水生系统中病毒感染的原核细胞
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Aquatic Microbial Ecology 47
影响因子:
--
作者:
[Ram, A.S.P., Nagata, T., Tomaru, Y., Nagasaki, K]
通讯作者:
K
Aggregate-biosphere: Unveiling hidden regulatory processes in the oceanic carbon cycle
-
批准号:19H05667
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
-
资助金额:$128.38万
-
财政年份:2019
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
新規同位体手法を用いた開放系としてのサンゴ礁生態系の環境動態に関する研究
-
批准号:15F15904
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.92万
-
财政年份:2015
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
先端バイオマーカー技術を用いたサンゴ礁における粒子状物質の動態解析
-
批准号:11F01075
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.6万
-
财政年份:2011
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
サンゴ礁に対する大気由来窒素負荷の生物地球化学的影響
-
批准号:10F00767
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.28万
-
财政年份:2010
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
琵琶湖深層における骨格的な栄養循環を支配する新しい生態系メカニズムの解明
-
批准号:06F06179
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$0.96万
-
财政年份:2006
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
海洋生態系における細菌群集の多様性と活性の支配要因としてのウィルス感染の役割
-
批准号:04F04175
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.92万
-
财政年份:2004
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
水圏生態系における細菌増殖効率の生態学的支配機構:新仮説の検証
-
批准号:04F04444
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:2004
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
海洋における微生物群衆の動態を計測する新手法の開発
-
批准号:11874112
-
项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
-
资助金额:$1.28万
-
财政年份:1999
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
微生物食物連鎖による溶存有機物の生成と消費ー海洋フラックスにおける意義ー
-
批准号:04232212
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$0.64万
-
财政年份:1992
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
湖の浮遊性細菌の生産過程と動態-とくに捕食者との相互作用を中心として-
-
批准号:61790227
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$1.31万
-
财政年份:1986
-
负责人:永田 俊
-
依托单位:
海外基金