海洋に分布する第三の微粒子群?-高度光学手法を用いた萌芽的究明

海洋中分布的第三组粒子？ - 使用先进光学方法进行探索性调查

• 批准号: 18651007
• 负责人: 永田 俊
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18651007/
• 关键词: 海洋; 物質循環; 微粒子; コロイド; 微生物; フローサイトメトリー; 有機物; ウィルス

フローサイトメトリーを用いた微粒子検出における重要な検討課題はノイズの削減である。本年度の研究では、前年度に引き続き、海水中に分布する微粒子のモデルとしてウィルス粒子を考え、そのシグナルを明瞭に分離することを目標として、機器と分析方法の最適化を進めた。なお、ウィルス粒子は直径が20-50nmであり、本研究が目標とする微粒子の粒径とほぼ等しい範囲にある。ノイズは電気的ノイズ、シース溶液に由来するノイズ、光学的ノイズ、各種試薬に由来するノイズに分類することができる。これらのノイズに関する検討を進め、シースや試薬に由来するノイズに関しては、試料の取り扱い方法や試薬の製造元や調整方法を大幅に改良することができた。しかし、DNAの検出に用いられるSYBR GREEN I以外の試薬(ナイルレッド、アクリジンオレンジなど)に関しては、試薬自体のノイズが高く、また、シグナルが十分に強くないことから、本研究がターゲットとする微粒子の検出には適さないことが明らかになった。そこで、SYBR GREEN Iを用いて、外洋域で採取された試料について、微粒子解析を進めたところ、ウィルス様粒子については、これをを2つないしは3つのクラスターに明瞭に分離することができた。この方法を用いて、学術調査船白鳳丸の中部太平洋南北断面観測航海などで採取されたサンプルの解析を進めた。その結果、広範な海域において、ウィルスと同様なサイズの非生物粒子が存在することが確認された。ただし、シグナルの強度が不安定であるため、その粒子数の確定や、出現パターンの解析を行うためには、染色条件や測定条件についてのより詳細な検討が必要であることが明らかになった。

The main purpose of this study is to reduce the number of particles detected. This year's research is based on the previous year's introduction of micro-particles, distribution of micro-particles in seawater, investigation of micro-particles, identification of micro-particles, optimization of analytical methods, and so on. The diameter of particles ranges from 20 nm to 50nm, and the particle size of particles ranges from 20 nm to 50 nm. The origin of electrical, optical, and other materials This article discusses the improvement of the method of sample selection and production element adjustment. The results of this study show that the detection of DNA in the absence of SYBR GREEN I is very important for the detection of micro-particles. For example, SYBR GREEN I is used in the field, the sample is taken in the field, the micro-particle analysis is carried out, the particle is taken in the field, and the separation is carried out. This method is applied to the analysis of the north-south section of the central Pacific Ocean by the academic research ship Baifeng Maru. As a result, the presence of non-biological particles in the sea is confirmed. The intensity of the dye is unstable, the number of particles is determined, the analysis of the dye is performed, the dyeing conditions are determined, and the detailed investigation is necessary.

项目成果

Distribution patterns of viruses and their subclusters in the upper water columns of the Pacific and Southern Oceans

太平洋和南大洋上层水体中病毒及其亚群的分布模式

• 发表时间: 2007
• 作者: Yang;Y.;Yokokawa;T.;Motegi;C.;Nagata;T
• 通讯作者: T

生物の多様性って何だろう

什么是生物多样性？

• 发表时间: 2007
• 作者: 永田 俊;茂手木千晶(京都大学総合博物館・京都大学生態学研究センター編)
• 通讯作者: 茂手木千晶(京都大学総合博物館・京都大学生態学研究センター編)

Microbial Ecology of the Oceans (2nd edition)

海洋微生物生态学（第二版）

• 期刊: John Wiley & Sons (in press)
• 作者: Nagata;T
• 通讯作者: T

Tungstate compounds as an alternative to uranyl acetate for enumerating viral-infected prokaryote cells in aquatic systems.

钨酸盐化合物作为乙酸双氧铀的替代品，用于计数水生系统中病毒感染的原核细胞。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Aquatic Microbial Ecology 47
• 作者: A. S. Pradeep Ram;T. Nagata;Y. Tomaru;K. Nagasaki
• 通讯作者: K. Nagasaki

Tungstate compounds as an alternative to uranyl acetate for enumerating viral infected prokaryote cells in aquatic systems

钨酸盐化合物作为醋酸双氧铀的替代品，用于计数水生系统中病毒感染的原核细胞

• 发表时间: 2007
• 期刊: Aquatic Microbial Ecology 47
• 作者: Ram;A.S.P.;Nagata;T.;Tomaru;Y.;Nagasaki;K
• 通讯作者: K