クロロフィルをもたない"藍藻"の実体解明

阐明不含叶绿素的“蓝绿藻”的真实本质

• 批准号: 18657010
• 负责人: 宮下 英明
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18657010/
• 关键词: 微生物; 土壌; 微生物生態学; 分子微生物生態学

本研究は、複数の"藍藻"によって形成されている日本固有の特殊な微生物塊の群集構造およびその成因を明らかにすることを目的として行われた。19年度はPCR-DGGE法を用いて微生物塊を構成する微生物の多様性を解析することを主目的とした。18年度の研究から、サンプルとする微生物塊において細胞外多糖が多いためDNA抽出効率が悪く、DNAの抽出・精製法を検討することが不可欠であることがわかった。そこでまず、DNA抽出法の検討を行った。市販のキットの利用を含め、破砕法、DNAの抽出・精製法等について、12通りの方法を検討した。PCR-DGGEにおいて出現するバンド数を指標として抽出精製法の評価をおこなったところ、電子レンジを用いる細胞破砕方法によって、最も多くのバンドが検出された。そこで、このDNA抽出・精製法によって得られたトータルDNAを用いた。まず、シアノバクテリア特異的プライマーを利用して検出を試みたところ、シアノバクテリアは全く検出されなかった。このことからも本微生物塊が"藍藻"群集でないことが裏付けられた。また、真正細菌・古細菌・真核生物それぞれのSSU rDNAをマーカーとしてPCR-DGGE解析をおこなったところ、十数種類の塩基配列が明らかになった。これらの配列解析から、微生物塊には、アシドバクテリア,クテドバクテリア,γプロテオバクテリアなどに属するバクテリアが優占的に存在することがわかった。これらの結果は、この微生物塊がきわめて特別な環境に、特異なエネルギーおよび物質循環を形成して成立する特殊な微生物塊であることを示唆する結果であった。

は this study, the plural の "cyanobacteria に よ っ て form さ れ て い る Japan's inherent の special な microbial blocks の cluster structure お よ び そ の causes を Ming ら か に す る こ と を purpose と し て line わ れ た. を 19th annual は PCR - DGGE method with い て microbial block を constitute す る microbial の multiple others を parsing す る こ と を main purpose と し た. 18 year の research か ら, サ ン プ ル と す る microbial block に お い て extracellular polysaccharide が much い た め DNA extraction rate of unseen が 悪 の く, DNA extraction, refining process を beg す 検 る こ と が not owe で あ る こ と が わ か っ た. Youdaoplaceholder0 でまず でまず, DNA extraction method 検 検 discuss を line った. The market vendor キット キット uses を containing め, breaking 砕 method, DNA sample extraction and refinement method, etc. Youdaoplaceholder4 を検 て て, 12-channel <s:1> を検 method を検 to collect た. PCR - DGGE に お い て in す る バ ン ド number を index と し て extraction refining method の review 価 を お こ な っ た と こ ろ, electronic レ ン ジ を with い る cells broken 砕 method に よ っ て, most も く の バ ン ド が 検 out さ れ た. Youdaoplaceholder0 で で, で <s:1> DNA extraction and refinement method によって obtain られたト タ タ タ を DNAを を use た た. ま ず, シ ア ノ バ ク テ リ ア specific プ ラ イ マ ー を using し て 検 try out を み た と こ ろ, シ ア ノ バ ク テ リ ア は full く 検 out さ れ な か っ た. The microbial block が" cyanobacteria "cluster でな でな とが とが とが けられた けられた. ま た, real bacteria, archaea, and eukaryotes そ れ ぞ れ の SSU rDNA を マ ー カ ー と し て PCR - DGGE parsing を お こ な っ た と こ ろ, dozen の salt base with column が Ming ら か に な っ た. こ れ ら の match column analysis か ら, microbial block に は, ア シ ド バ ク テ リ ア, ク テ ド バ ク テ リ ア, gamma プ ロ テ オ バ ク テ リ ア な ど に genus す る バ ク テ リ ア が に existence of optimal す る こ と が わ か っ た. こ れ ら の results は, こ の microbial block が き わ め に て な special environment, specific な エ ネ ル ギ ー お よ び matter circulation を し て established す る special な microbial block で あ る こ と を in stopping す る results で あ っ た.

项目成果

「天狗の麦飯」はシアノバクテリア群集ではない

“天狗大麦米”并非蓝藻群落

• 发表时间: 2007
• 作者: 宮下英明;田中樹;幡野恭子;大久保智司;坂本皆子;近藤洋一
• 通讯作者: 近藤洋一

シアノバクテリア群集といわれてきた微生物塊「天狗の麦飯」の群集構造解析

被称为蓝藻群落的微生物群“天狗的麦片”的群落结构分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 坂本皆子、田中樹、幡野恭子、大久保智司、近藤洋一;宮下英明
• 通讯作者: 宮下英明