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クロマチン構造変換のナノスケール3次元電子顕微鏡解析

クロマチン構造変換のナノスケール3次元電子顕微鏡解析
纳米级三维电子显微镜分析染色质结构转变
批准号:
18657035
负责人:
森川 耿右
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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昨年度のテトラヌクレオソームの電子顕微鏡観察に引き続き、今年度はヌクレオソームの数を増やして15個、20個連なったオリゴヌクレオソームの、負染色法による電顕観察を行い、新たにクライオ電子顕微鏡観察も試みた。構造解析に適したDNA配列601からなるプラスミドDNAを構築し、大腸菌で発現、精製したコアヒストンを用いてオリゴヌクレオソームを再構成した。2%酢酸ウラニルを用いて負染色した試料を、電子顕微鏡によって観察し、15個、20個のモノヌクレオソームが数珠状に連なったオリゴヌクレオソームの形成が確認できた。また、金属イオンの存在下で、高度にパッキングした30nm fiber様の形態も観察できた。更にクロマチンリモデリング因子であるFACTと、このオリゴヌクレオソームの相互作用を観察するため、FACTのSSRP1とSPT16の二つのサブユニットを共発現させ、複合体の精製を行った。FACT複合体の電子顕微鏡観察を行ったところ、様々なサイズの粒子が観察され、FACTがオリゴマー状態で存在する事が示唆された。一部15nmほどの大きさの分子が検出され、これがFACTモノマーであると推定された。このFACT複合体を上記のオリゴヌクレオソーム溶液に加え、その形態の時間変化を負染色法によって電顕で観察した。しかしながら現在のところ、有意な変化を見いだすには至っていない。現在、溶液中の状態をより正確に反映するクライオ電子顕微鏡観察を開始しており、オリゴヌクレオソームの凍結試料の観察に既に成功し、負染色法と同様の数珠状に連なった形態を観察できた。電子分光法を用いることで無染色であるにも関わらず、良質の画像の記録に成功し、DNAも明確に可視化する事ができた。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1073/pnas.0611577104
发表时间: 2007-03-06
期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子: 11.1
作者: [Muto, Takanori, Tsuchiya, Daisuke, Jingami, Hisato]
通讯作者: Jingami, Hisato
DOI: 10.1016/j.bbrc.2007.11.138
发表时间: 2008-02
期刊: Biochemical and biophysical research communications
影响因子: 3.1
作者: [T. Sugi;T. Oyama;K. Morikawa;H. Jingami]
通讯作者: T. Sugi;T. Oyama;K. Morikawa;H. Jingami
DNA ligase-PCNA-DNA複合体の単粒子解析
DNA 连接酶-PCNA-DNA 复合物的单颗粒分析
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [真柳浩太, 他]
通讯作者:
Structural View of metabotropic glutamate receptor activation.
代谢型谷氨酸受体激活的结构视图。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [井上拓磨, 山下光輝, 清水佑季子, 宮本久一, 御崎洋二, 森川取右.]
通讯作者: 森川取右.
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    タンパク質による5SrRNAの立体構造識別
    • 批准号:
      61580234
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $0.64万
    • 财政年份:
      1986
    • 负责人:
      森川 耿右
    • 依托单位:
    5SrRNA のX線結晶構造解析
    • 批准号:
      59580170
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $1.15万
    • 财政年份:
      1984
    • 负责人:
      森川 耿右
    • 依托单位:
    染色体の超構造形成に関与する蛋白質の結晶化とX線構造解析
    • 批准号:
      57580172
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $1.09万
    • 财政年份:
      1982
    • 负责人:
      森川 耿右
    • 依托单位:
    転移リボ核酸の結晶化とそのX線結晶学的研究
    • 批准号:
      X00210----878090
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • 资助金额:
      $0.19万
    • 财政年份:
      1973
    • 负责人:
      森川 耿右
    • 依托单位:
    海外基金