共優性多型マーカー「複合マイクロサテライトアンカーマーカー」作製法の確立

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平成19年度は主に以下のような結果が得られた。1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。樹木:カワクルミ動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ草本:レンゲショウマ、フジアザミクワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の研究グループにもこの方法を利用して短時間で多型性の高い複合SSRマーカー作製に成功した。2)複合SSRマーカーが得るために、更に簡便な作製方法:inter-compound-SSR(ICSSR)法を考案した。この方法では、ゲノムDNAからICSSR領域を1回PCRで増幅し、sub-cloning後塩基配列を1回決定するだけて共優性多型マーカーを作製できる。この方法を用いて、アジアザミ、マテバシイ、ヌルデから多型性のあるSSRマーカをそれぞれ10、7、9座作製した。