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一細胞観測系による多細胞性シアノバクテリアの時空間パターン形成の解析

一細胞観測系による多細胞性シアノバクテリアの時空間パターン形成の解析
使用单细胞观察系统分析多细胞蓝藻的时空模式形成
批准号:
19657019
负责人:
岩崎 秀雄
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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本研究は,多細胞性シアノバクテリアAnabaena sp.PCC7120の窒素欠乏下における細胞分化(ヘテロシスト分化)・パターン形成のダイナミクスを明らかにするための観測操作系の確立を目指すものであった。その前提として,まず顕微鏡下で培養しつつ,分化誘導を行い,その様子(明視野像,光合成活性,遺伝子発現パターン)をタイムラプス観測するための同時多点同時モニタリング系をほぼ確立し,ヘテロシスト分化に関わる細胞系譜解析を行った。その結果,窒素欠乏処理直後の光合成活性,細胞分化の中枢遺伝子であるhetR遺伝子の初期のばらつきと,最初にヘテロシストを生み出すことになる細胞の位置には相関はなく,窒素欠乏処理直後の細胞のばらつきが後々直接の影響を及ぼしているわけではないことが示唆された。実際,hetR発現パターンの推移を詳しく観察することで,hetR発現強度には一過的な増減が多く観察されること,細胞分裂が揺らぎの一端を担っていることなどが確認された。さらに一細胞レベルで分化誘導実験を行うことで,パターン形成ダイナミクスの摂動実験を行うことが本研究計画の主要なテーマであった。そこで,MEMS(micro-electro mechanical system)技術を用い,複雑な流路を備えたPDMS-ガラスを素材とするマイクロデバイスを何パターンか作製した。とくに空気バルブを多用し,流路の切り替えを実現したPDMS-ガラスデバイスを作製した。かなり複雑な構成にしてしまったために,デバイスに脆弱な点もあり改善の余地が残ったが,従来にない微小空間流路培養系が確立し,デバイス内での通常の細胞分化を確認することが出来た。今後は,今回作製したデバイスを用い,分化誘導をきたす2-oxoglutarateを局所的に投与する実験を開始する予定である。
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会议论文
An attempt to reveal a role of a transoription/transIation feedback loop in the cyanobacterial KaiC protein-based circadian system by using a semi-synthetic method
尝试使用半合成方法揭示基于蓝藻 KaiC 蛋白的昼夜节律系统中转录/翻译反馈回路的作用
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Int. J. Bioinform. Res. Appl. 4
影响因子: --
作者: [H. Tozaki, T. Kobe, K. Aihara, H. Iwasaki]
通讯作者: H. Iwasaki
An attempt to reveal a role of a transcription/translation feedback loop in the cyanobacterial KaiC protein-based circadian system by using a semi-synthetic method.
尝试使用半合成方法揭示转录/翻译反馈环路在蓝藻基于 KaiC 蛋白的昼夜节律系统中的作用。
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Int.J.Bioinf.Res.Appl. (印刷中)
影响因子: --
作者: [Tozaki, H., Kobe, T., Aihara, K., and Iwasaki, H.]
通讯作者: H.
Induction of a group 2 sigma factor, RpoD3, by high light and the underlying mechanism in Synechococces elongates PCC 7942
高光诱导 2 组 sigma 因子 RpoD3 以及聚球藻中延长 PCC 7942 的潜在机制
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: J.Biol.Chem. 282
影响因子: --
作者: [A.Seki, M.Hanaoka, Y.Akimoto, S.Masuda, H.Iwasaki, K.Tanaka]
通讯作者: K.Tanaka
Systems Biology : The Challenge of Complexity
系统生物学:复杂性的挑战
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [Hideo Iwasaki, et al.]
通讯作者: et al.
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    生化学振動子に基づく概日転写制御を介した日周環境適応機構
    • 批准号:
      23K27174
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $7.74万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      岩崎 秀雄
    • 依托单位:
    Diurnal environmental adaptation via circadian transcriptional control based on a biochemical oscillator
    • 批准号:
      23H02481
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      岩崎 秀雄
    • 依托单位:
    ポストゲノム時代におけるバイオメディア芸術の調査研究
    • 批准号:
      11F01002
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.02万
    • 财政年份:
      2011
    • 负责人:
      岩崎 秀雄
    • 依托单位:
    時計遺伝子発現を伴わない原核生物の概日転写制御と光周的遺伝子発現
    • 批准号:
      22657043
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.05万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      岩崎 秀雄
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    异形胞发育因子HetF在蓝细菌Anabaena sp. PCC 7120细胞分裂中的功能研究
    • 批准号:
      32200028
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      邢伟越
    • 依托单位:
    第二信使c-di-GMP介导的光调控蓝细菌Anabaena sp. PCC 7120细胞尺寸的分子机制研究
    蓝细菌Anabaena PCC 7120中RNA酶复合体RNase E-PNPase-RNase II调控胞内RNA代谢的机制
    c-di-GMP调控蓝细菌Anabaena sp. PCC7120异形胞发育的分子机制研究
    • 批准号:
      31800033
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      25.0万元
    • 批准年份:
      2018
    • 负责人:
      曾晓丽
    • 依托单位: