栄養疫学調査とデータマイニングによる遺伝子-環境相互作用の探索

通过营养流行病学研究和数据挖掘探索基因与环境的相互作用

基本信息

  • 批准号:
    19659159
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2007 至 2008
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

昨年度までに取得した健常な日本人成人ボランティアのコホートデータを対象に、ベースライン調査時に取得したデータ項目のうち、主に、eNOS遺伝子、血圧値、Food frequency questionnaire (FFQ)によるナトリウム摂取量を利用した。eNOSをTT群とTC+CC群の2群に分け、ナトリウム摂取量を連続量として扱った際の高血圧(収縮期血圧≧140mmHg or拡張期血圧≧90mmHg)のオッズ比(OR)を検討した。まず広く行われているロジスティック回帰分析を行い、次にOrangeのNaive Bayes機能を用いてORの算出、Odds ratio curve (OR curve)の描画を行った。ロジスティック回帰分析ではオッズが単調に増加することが確認された。Naive Bayseを用いた分析では、両群(TT群、TC+CC群)ともナトリウム摂取量の増加とともに、オッズ比が上昇した。ナトリウム4000mg以下では、両群に大きな差異が見られなかったが、4000mg以上では、TT群に比べ、TC+CC群のオッズ比は急峻に上昇した。Naive Bayseを用いた分析でも、既存研究と同様にTC+CC群の、ナトリウム高摂取群におおいて高血圧のリスクが高いことが示唆された。TT群は塩分感受性が低く、高血圧に対して保護的に働いているのに対し、TC+CC群は感受性が高く、ナトリウム摂取量の増加が高血圧のリスクを線形な傾き以上に急峻に上昇させている可能性が考えられる。従来の候補遺伝子アプローチによる解析から得られた知見と、新たなデータマイニング手法により得られた知見、両者の比較を通じ、新たなデータマイニング手法の有用性や妥当性を検討することができた。
Yesterday's annual ま で に obtain し た health often な Japanese adult ボ ラ ン テ ィ ア の コ ホ ー ト デ ー タ を に, seaborne ベ ー ス ラ イ ン に survey at し た デ ー タ project の う ち, main に, traces of eNOS 圧 numerical 伝, blood, Food frequency questionnaire (FFQ)によるナトリウム摂 take the quantity を using た. ENOS を TT group と TC + CC group の 2 group に け, ナ ト リ ウ ム, take quantity を amount even 続 と し て Cha っ た interstate の high blood 圧 (収 shrink blood 圧 ≧ 140 MMHG or company, zhang period blood 圧 ≧ 90 MMHG) の オ ッ ズ ratio (or) を beg し 検 た. Line ま ず hiroo く わ れ て い る ロ ジ ス テ ィ ッ ク 帰 back analysis を い, time に Orange の Naive Bayes function を with い て OR の calculate, Odds thewire curve line (OR curve) を の painted っ た. Youdaoplaceholder0 帰 return 帰 analysis で ッズが単 ッズが単 ッズが単 modulation に increase する する とが とが confirmation された. Naive Bayse を with い た analysis で は, struck group (TT group, TC + CC group) と も ナ ト リ ウ ム, take quantity の raised plus と と も に, オ ッ ズ rise than が し た. ナ ト リ ウ ム below 4000 mg で は, struck group に き な differences が see ら れ な か っ た が, more than 4000 mg で は, TT group に than べ, TC + CC group の オ ッ ズ anxious than は topped に rise し た. Naive Bayse を with い た analysis で も, existing research と with others に TC + CC group の, ナ ト リ ウ ム high, take に お お い て high blood 圧 の リ ス ク が high い こ と が in stopping さ れ た. TT group は salt sensitivity low が く, high blood 圧 に し seaborne て protection に 働 い て い る の に し seaborne, TC + CC group は sensitivity high が く, ナ ト リ ウ ム, take quantity の raised が requirement by high blood 圧 の リ ス ク を linear な pour き に urgent strict に can rise above さ せ て い る possibility が exam え ら れ る. 従 to の alternate heritage 伝 son ア プ ロ ー チ に よ る parsing か ら have ら れ た knowledge と, new た な デ ー タ マ イ ニ ン グ gimmick に よ り have ら れ た knowledge, struck の is を じ, new た な デ ー タ マ イ ニ ン グ gimmick の usefulness や justice を beg す 検 る こ と が で き た.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Influence of CYP11B2 Gene Polymorphism on the Prevalence of Hypertension and the Blood Pressure in Japanese Men: Interaction with Dietary Salt Intake
  • DOI:
    10.1159/000150006
  • 发表时间:
    2008-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Yixuan Song;K. Miyaki;J. Araki;Ling Zhang;Yoshimitsu Takahashi;T. Nakayama;M. Muramatsu
  • 通讯作者:
    Yixuan Song;K. Miyaki;J. Araki;Ling Zhang;Yoshimitsu Takahashi;T. Nakayama;M. Muramatsu
Association between a polymorphism of aminolevulinate dehydrogenase (ALAD) gene and blood lead levels in Japanese subjects.
Odds ratio curveを用いたデータマイニング : 血管内皮型NO合成酵素遺伝子多型別のナトリウム摂取量と高血圧の関連
使用比值比曲线进行数据挖掘:根据血管内皮NO合酶基因多态性,钠摄入量与高血压之间的关联
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高橋;宮木;宋;テイ;青木;中山;村松;星野;鈴木;新保
  • 通讯作者:
    新保
Increasing the number of SNPs loci does not necessarily improve prediction power at least in the comparison of MTHFRSNP and haplotypes.
至少在 MTHFRSNP 和单倍型的比较中,增加 SNP 位点的数量并不一定会提高预测能力。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miyaki K;Takahashi Y;Song Y;Zhang L;Muramatsu M;Nakayama T.
  • 通讯作者:
    Nakayama T.
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発達障害を職場でささえる: 全員の本領発揮を目指すプレゼンティーズムという視点
支持工作场所的发育障碍人士:出勤主义的视角,旨在激发每个人的最佳表现
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木知子;宮木幸一;江口 尚;堤 明純;宮木 幸一
  • 通讯作者:
    宮木 幸一
産業保健スタッフ,管理職,従業員への慢性痛教育プログラム
针对工业卫生人员、管理人员和员工的慢性疼痛教育计划
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    舟久保 恵美;福谷 直人;永田 智久;北原 照代;宮木 幸一;青山 朋樹;牛田 享宏;福井 聖
  • 通讯作者:
    福井 聖

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Exploratory analysis of social perception about genome cohort research
关于基因组队列研究的社会认知的探索性分析
  • 批准号:
    20018014
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Evaluation of effects of salt reduction on blood pressure and behavior with genetic polymorphism information
利用遗传多态性信息评价减盐对血压和行为的影响
  • 批准号:
    19390173
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

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多因子遺伝形質の分割と統合:2型糖尿病における遺伝子・環境相互作用の解明
分割和整合多因素遗传特征:阐明 2 型糖尿病中基因与环境的相互作用
  • 批准号:
    24K11732
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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