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栄養疫学調査とデータマイニングによる遺伝子-環境相互作用の探索

栄養疫学調査とデータマイニングによる遺伝子-環境相互作用の探索
通过营养流行病学研究和数据挖掘探索基因与环境的相互作用
批准号:
19659159
负责人:
宮木 幸一
金额:
$1.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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昨年度までに取得した健常な日本人成人ボランティアのコホートデータを対象に、ベースライン調査時に取得したデータ項目のうち、主に、eNOS遺伝子、血圧値、Food frequency questionnaire (FFQ)によるナトリウム摂取量を利用した。eNOSをTT群とTC+CC群の2群に分け、ナトリウム摂取量を連続量として扱った際の高血圧(収縮期血圧≧140mmHg or拡張期血圧≧90mmHg)のオッズ比(OR)を検討した。まず広く行われているロジスティック回帰分析を行い、次にOrangeのNaive Bayes機能を用いてORの算出、Odds ratio curve (OR curve)の描画を行った。ロジスティック回帰分析ではオッズが単調に増加することが確認された。Naive Bayseを用いた分析では、両群(TT群、TC+CC群)ともナトリウム摂取量の増加とともに、オッズ比が上昇した。ナトリウム4000mg以下では、両群に大きな差異が見られなかったが、4000mg以上では、TT群に比べ、TC+CC群のオッズ比は急峻に上昇した。Naive Bayseを用いた分析でも、既存研究と同様にTC+CC群の、ナトリウム高摂取群におおいて高血圧のリスクが高いことが示唆された。TT群は塩分感受性が低く、高血圧に対して保護的に働いているのに対し、TC+CC群は感受性が高く、ナトリウム摂取量の増加が高血圧のリスクを線形な傾き以上に急峻に上昇させている可能性が考えられる。従来の候補遺伝子アプローチによる解析から得られた知見と、新たなデータマイニング手法により得られた知見、両者の比較を通じ、新たなデータマイニング手法の有用性や妥当性を検討することができた。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1159/000150006
发表时间: 2008-08
期刊: Lifestyle Genomics
影响因子: 2.6
作者: [Yixuan Song;K. Miyaki;J. Araki;Ling Zhang;Yoshimitsu Takahashi;T. Nakayama;M. Muramatsu]
通讯作者: Yixuan Song;K. Miyaki;J. Araki;Ling Zhang;Yoshimitsu Takahashi;T. Nakayama;M. Muramatsu
DOI: 10.3390/ijerph6030999
发表时间: 2009-03
期刊: International journal of environmental research and public health
影响因子: --
作者: [Miyaki K, Lwin H, Masaki K, Song Y, Takahashi Y, Muramatsu M, Nakayama T]
通讯作者: Nakayama T
Odds ratio curveを用いたデータマイニング : 血管内皮型NO合成酵素遺伝子多型別のナトリウム摂取量と高血圧の関連
使用比值比曲线进行数据挖掘:根据血管内皮NO合酶基因多态性,钠摄入量与高血压之间的关联
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [高橋, 宮木, 宋, テイ, 青木, 中山, 村松, 星野, 鈴木, 新保]
通讯作者: 新保
Increasing the number of SNPs loci does not necessarily improve prediction power at least in the comparison of MTHFRSNP and haplotypes.
至少在 MTHFRSNP 和单倍型的比较中,增加 SNP 位点的数量并不一定会提高预测能力。
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Journal of Epidemiology 18
影响因子: --
作者: [Miyaki K, Takahashi Y, Song Y, Zhang L, Muramatsu M, Nakayama T.]
通讯作者: Nakayama T.
Exploratory analysis of social perception about genome cohort research
  • 批准号:
    20018014
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.69万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    宮木 幸一
  • 依托单位:
Evaluation of effects of salt reduction on blood pressure and behavior with genetic polymorphism information
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