臍帯血移植後のGVHD発症に関与するmiRNAとその標的遺伝子の同定

脐带血移植后 GVHD 发生过程中相关 miRNA 及其靶基因的鉴定

• 批准号: 19659240
• 负责人: 高橋 直之
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659240/
• 关键词: 造血幹細胞移植; GVHD; miRNA; 遺伝子発現プロファイル

当初の計画では、臍帯血移植に伴うGVHD発症時と治癒時のペアサンプルについて、(1)miRNAの発現プロファイルの解析により、GVHDに伴い発現が変化するmiRNAを同定し、(2)標的遺伝子予測プログラムにより標的転写調節因子候補を絞り込み、(3)同時に行うmRNAの発現プロファイルからモデル計算により得られる転写調節因子の発現・作用プロファイルとの照合により、GVHDの病態形成への関与が大きい転写調節因子およびmiRNA候補を抽出するはずであった。ところが、H20年度となり、サンプルがなかなか集まらなくなった。集まった少数例のサンプルについて、miRNAの発現プロファイルから得られた標的転写調節因子候補群と、mRNAの発現プロファイルから得られた転写調節因子作用プロファイルとの照合を行ったが、やはり統計的に評価しうる結果が得られなかった。そこで、miRNAとmRNAの対数発現強度比データを直接合わせてクラスター分析を行ってみたが、統計的に有意な結果が得られなかった。そのため、in vitroでの実験に変更し、臍帯血と正常人末梢血中の単核球各分画について炎症刺激に伴うmiRNAおよびmRNAの発現プロファイルを比較検討することにした。所内倫理委員会による承認後、サンプルの収集を開始し、平成21年3月末現在、臍帯血については16検体、正常人末梢血については11検体得られ、処理を進めている。これまでにmiRNAのreal time PCRを一部、施工しているが、処理数が非常に多いため、いまだ完了していない。最終的に統計解析を終了した段階で論文投稿する予定である。

The original plan included: (1)miRNA expression analysis;(2) target gene prediction;(3) target gene regulatory factor candidate analysis;(4) target gene prediction;(5) target gene prediction;(6) target gene prediction;(7) target gene prediction;(8) target gene prediction;(9) target gene prediction;(9) target gene prediction;(10) target gene prediction; and (11) target gene prediction.(3) At the same time, the expression of mRNA, the expression of regulatory factors, the expression of regulatory factors and the extraction of miRNA candidates are related to the pathogenesis of GVHD.ところが、H20年度となり、サンプルがなかなか集まらなくなった。A small number of cases of miRNA expression, miRNA expression, target gene expression and regulatory factor candidate groups, mRNA expression, miRNA expression, target gene expression and regulatory factor action, and statistical evaluation results were obtained. The expression intensity ratio of miRNA and miRNA is directly combined with the expression intensity ratio of miRNA and miRNA. The expression of miRNA and mRNA in the peripheral blood of normal people was compared with that of inflammatory stimulation. After the approval of the Ethics Committee in the institute, the collection of samples was started. At the end of March 21, 2011, the umbilical blood samples were collected. The normal peripheral blood samples were collected and processed. The miRNA real time PCR is a part of the construction process, and the number of genes is very high. The final statistical analysis is completed and the paper is submitted.

项目成果

Gene-expression profiles of peripheral blood mononuclear cell subpopulations in acute graft-vs-host disease following cord blood transplantation

• DOI: 10.1016/j.exphem.2008.07.007
• 发表时间: 2008-12-01
• 期刊: EXPERIMENTAL HEMATOLOGY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Takahashi, Naoyuki;Sato, Noriharu;Tojo, Arinobu
• 通讯作者: Tojo, Arinobu