臍帯血移植後のGVHD発症に関与するmiRNAとその標的遺伝子の同定

脐带血移植后 GVHD 发生过程中相关 miRNA 及其靶基因的鉴定

• 批准号: 19659240
• 负责人: 高橋 直之
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659240/
• 关键词: 造血幹細胞移植; GVHD; miRNA; 遺伝子発現プロファイル

当初の計画では、臍帯血移植に伴うGVHD発症時と治癒時のペアサンプルについて、(1)miRNAの発現プロファイルの解析により、GVHDに伴い発現が変化するmiRNAを同定し、(2)標的遺伝子予測プログラムにより標的転写調節因子候補を絞り込み、(3)同時に行うmRNAの発現プロファイルからモデル計算により得られる転写調節因子の発現・作用プロファイルとの照合により、GVHDの病態形成への関与が大きい転写調節因子およびmiRNA候補を抽出するはずであった。ところが、H20年度となり、サンプルがなかなか集まらなくなった。集まった少数例のサンプルについて、miRNAの発現プロファイルから得られた標的転写調節因子候補群と、mRNAの発現プロファイルから得られた転写調節因子作用プロファイルとの照合を行ったが、やはり統計的に評価しうる結果が得られなかった。そこで、miRNAとmRNAの対数発現強度比データを直接合わせてクラスター分析を行ってみたが、統計的に有意な結果が得られなかった。そのため、in vitroでの実験に変更し、臍帯血と正常人末梢血中の単核球各分画について炎症刺激に伴うmiRNAおよびmRNAの発現プロファイルを比較検討することにした。所内倫理委員会による承認後、サンプルの収集を開始し、平成21年3月末現在、臍帯血については16検体、正常人末梢血については11検体得られ、処理を進めている。これまでにmiRNAのreal time PCRを一部、施工しているが、処理数が非常に多いため、いまだ完了していない。最終的に統計解析を終了した段階で論文投稿する予定である。

最初的计划是确定miRNA的miRNA，其在GVHD发作时与GVHD的表达变化在GVHD发作时和脐带血液移植后治愈时（1）分析miRNA表达分析（1）分析miRNA表达曲线，以识别MiRNA的表达方式，其表达在GVHD中变化，（2）使用目标传统的范围缩小目标转录量的范围，并使用目标传统范围缩小范围，并使用目标传统范围进行匹配的（3）表达量的（3），并且（3）表达量的（3）表达式（3）表达式（3）范围（3）同时从mRNA表达谱中提取高度参与GVHD发病机理的转录调节因子和miRNA候选因子。但是，在2008年，很难收集样品。在从miRNA表达曲线获得的目标转录调节候选者组和从mRNA表达谱获得的转录调节效应曲线之间匹配了少量的样品，但是无法获得无法从统计学上评估的结果。因此，我们通过直接结合miRNA和mRNA对数表达强度比的数据进行了聚类分析，但没有获得统计学上显着的结果。因此，我们决定更改为体外实验，并比较和检查miRNA和mRNA与炎症刺激相关的miRNA和mRNA的表达谱，每一部分单核细胞在脐带血和正常的人类外周血中。经过机构伦理委员会的批准后，收集了样本，截至2009年3月底，已经获得了16个脐带血和11个标本的标本，并获得了11个正常人类外周血的标本，并且正在处理样品。我们以前曾进行过一些实时PCR miRNA，但由于众多治疗方法尚未完成。当统计分析最终完成时，该论文将提交。

项目成果

Gene-expression profiles of peripheral blood mononuclear cell subpopulations in acute graft-vs-host disease following cord blood transplantation

• DOI: 10.1016/j.exphem.2008.07.007
• 发表时间: 2008-12-01
• 期刊: EXPERIMENTAL HEMATOLOGY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Takahashi, Naoyuki;Sato, Noriharu;Tojo, Arinobu
• 通讯作者: Tojo, Arinobu