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ランダム突然変異体集団淘汰法による塩基配列空間上の生体高分子機能曲面の形状の研究

利用随机突变群体选择方法研究碱基序列空间中生物聚合物功能表面的形状

基本信息

批准号：
04680266
负责人：
伏見譲
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Saitama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1992
资助国家：
日本
起止时间：
1992 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

生体高分子は、ダーウィンの自然淘汰の原理によって自己の機能を漸進的に最適化させ得るような物性を持つと予想される、いいかえると、生体高分子の機能を塩基配列空間上にプロットした場合、その曲面の形状が富士山型に近いものが多いと予想される。本研究の目的は、進化分子工学の手法を用いて、すなわち、莫大な種類のランダム点突然変異体から成る特定遺伝子の集団を淘汰させるという手法を用いて、この予想をチェックする事にあった。最終的な結論までには至らなかったが、次のような要素技術の開発と理論整備が行われた。1。進化分子工学に適したランダム突然変異導入法を開発した。本方法は塩基置換領域の限定性、ランダム性、変異率の制御可能性に優れている。これを用いて、バクテリオファージFfの主コート蛋白のみに大きな突然変異率でin vitroランダム突然変異をかけたファージ集団を作成した。2。セルスタットにおける、突然変異体集団の淘汰のモードが、初期の淘汰係数の分布に敏感であるという理論を整備した。特に、isopopulation pointの存在がウイルスライフサイクルの単純化モデルで証明できた。ランダム突然変異導入の場合、この初期分布は、適応度の地形の知見を与える。3。バクテリオファージM13mp11を作業レプリコンとする人為淘汰型進化リアクターの再開発を進めた。従来、βガラクトシダーゼのフルオロジェニックな基質は、細胞外に漏れやすいという重大な欠点があった。今回、親水性のフルオレセイン誘導体で漏れにくいものを発見した。4。進化分子工学におけるウイルス型戦略の一つとして、無細胞翻訳系の応用を検討した。すなわち、mRNAの3'末端に合成された蛋白分子のC末端を結合する方法の開発にめどがついた。

Bio-polymers are designed to optimize their functions in a gradual manner based on the principle of natural elimination, to maintain their physical properties, to coordinate their functions in space, and to shape their curved surfaces in close proximity to Mount Fuji. The purpose of this study is to apply evolutionary molecular engineering techniques to the development of specific genetic groups. The final conclusion is that the development theory of the key technology is carried out. 1。Evolutionary molecular engineering has been developed in the field of molecular engineering. The method has the advantages of limitation, diversity, variable rate and control possibility of base substitution field. This is the first time that a group of people has been created. 2。In the early stage of the elimination of the selection coefficient distribution, the theory of the selection coefficient is prepared. In particular, the existence of isolation point is proved by the purification of the sample. The situation of sudden change in the introduction of the system, the initial distribution of the system, and the knowledge of the terrain of the appropriate degree. 3。M13mp11 job selection and re-development of artificial elimination type evolution In the past, there have been significant defects in the βNow, the hydrophilic and hydrophobic inducer is missing. 4。Evolutionary molecular engineering is an important part of the research on cell-free transformation systems. Development of a method for the synthesis of protein molecules at the 3'terminus of mRNA and binding at the C terminus