Highly selective extermination of diatom blooms causing labor-discoloration by using habitual viruses.

使用习惯性病毒高选择性消灭导致劳动变色的硅藻华。

基本信息

批准号：
16208019
负责人：
NAGASAKI Keizo
金额：
$ 29.87万
依托单位：
Fisheries Research Agency
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

Within the four years research project, six novel diatom viruses(RsRNAV, CsNIV, CtenRNAV, CdebDNAV, CsfrRNAV, CcflDNAV) were successfully isolated and characterized. All are icosahedral viruses<40nm in diameter ; their genomes are either single-stranded DNA(ssDNA) or ssRNA. The genomes of the ssRNA viruses are linear and 3'-polyadenylated ; they have two open reading frames- a replicase polyprotein gene and a structural polyprotein gene. They showed considerable similarities to plant- or insect-infecting picomaviruses. On the other hand, CsNIV and CcflDNAV genomes are assumed to consist of a single molecule of covalently closed circular ssDNA as well as a segment of linear ssDNA. It is noticeable that the unknown genome structure was discovered in diatom-infecting viruses. Based on BLAST search results and phylogenetic analyses of RdRp domain(RNA-dependent RNA polymerase domain), both the diatom-infecting ssRNA and ssDNA viruses were shown to be novel virus groups that were only very distantly related with known viruses ; besides, significant similarities among viruses were observed within each virus group. Some of the viruses were shown to exist in natural environments at a detectable level(>3.01 infectious units/ml) ; the highest record was 3.1×10^4 infectious units/ml. These data suggest viruses have a certain impact on natural diatom populations. Furthermore, through a laboratory culture experiment, growth of laver was improved by virally inhibiting coexisting diatom proliferation. This result will provide basic data for developing a new method to prevent laver from discoloration. Further study on practical use of these diatom-infecting viruses will be eagerly expected. Due to this research project, encounter between diatomology and virology was successfully realized. We believe that the resultant data are of great value not only from the viewpoint of pure science but also practical applied science.

在四年的研究项目中，成功地隔离并表征了六种新型硅藻病毒（RSRNAV，CSNIV，CTENRNAV，CDEBDNAV，CSFRRNAV，CCFLDNAV）。所有的都是直径<40nm的二十面体病毒；它们的基因组是单链DNA（ssDNA）或ssRNA。 ssRNA病毒的基因组是线性和3'-聚乙酰化的。他们有两个开放式读取帧 - 复制酶多蛋白基因和一个结构多蛋白基因。他们表现出与植物或昆虫感染的picomaviuses相似的相似之处。另一方面，假定CSNIV和CCFLDNAV基因组由共价闭合圆形ssDNA的单个分子以及线性ssDNA的段组成。值得注意的是，未知的基因组结构是在硅藻感染病毒中发现的。基于RDRP结构域（RNA依赖性RNA聚合酶结构域）的爆炸搜索结果和系统发育分析，硅藻感染的ssRNA和ssDNA病毒均显示为与已知病毒相关的新型病毒组。此外，在每个病毒组中都观察到病毒之间的显着相似性。某些病毒被证明在自然环境中存在于可检测水平（> 3.01传染性单位/mL）；最高记录是3.1×10^4传染性单位/ml。这些数据表明病毒对自然硅藻种群有一定的影响。此外，通过实验室培养实验，通过病毒抑制共存的硅藻增殖来改善Laver的生长。该结果将为开发一种新方法提供基本数据，以防止Laver变色。对这些硅藻感染病毒的实际使用的进一步研究将是急切的预期。由于这一研究项目，辅助论与病毒学之间的相遇成功实现了。我们认为，所得数据不仅从纯科学的角度，而且还具有实用的应用科学，具有巨大的价值。

项目成果

期刊论文数量（92）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

珪藻感染性ウイルス研究の現状と今後の展望.

硅藻感染病毒研究现状及未来展望.

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Aizaki;Hideo;外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈・水本祐之・藤井直幹・尾田成幸・鈴木秀和・南雲保・長崎慶三.
通讯作者：
外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈・水本祐之・藤井直幹・尾田成幸・鈴木秀和・南雲保・長崎慶三.

赤潮原因感染性ウイルス研究からみえてきたもの -現象論・機構論から応用科学まで-.

对引起赤潮的传染性病毒的研究得出了什么——从现象学和机制理论到应用科学。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ito;D.ら9名;中静透;長崎慶三.
通讯作者：
長崎慶三.

海水中のもっとも小さな生物因子 -水圏ウイルスの生態学-.

海水中最小的生物制剂-水生病毒生态学-。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
日本海水学会誌 61
影响因子：
0
作者：
Yamada;A;Kobayashi;H;Tokumsu;S;Kakishima;M;外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈・長崎慶三.
通讯作者：
外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈・長崎慶三.

Algal viruses.

DOI：
10.1016/s0065-3527(08)60752-6
发表时间：
1972-01-01
期刊：
Advances in virus research
影响因子：
0
作者：
Brown, R M Jr
通讯作者：
Brown, R M Jr

海産ケイ藻類に感染するDNAウイルスおよびRNAウイルス.

感染海洋硅藻的 DNA 和 RNA 病毒。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Inoue;K.;Tabata;M.;Kawabata;T.;Uchida;K.;Tanaka;T;白井葉子・外丸裕司・水本祐之・高尾祥丈・鈴木秀和・南雲保・長崎慶三.
通讯作者：
白井葉子・外丸裕司・水本祐之・高尾祥丈・鈴木秀和・南雲保・長崎慶三.