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爬虫類の温度依存型性決定を制御する生体内シグナル因子の探索

寻找控制爬行动物温度依赖性性别决定的体内信号因子

基本信息

批准号：
16H07423
负责人：
谷津遼平
金额：
$ 1.91万
依托单位：
Wakayama Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-08-26 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は爬虫類の温度依存型性決定(Temperature-dependent sex determination; TSD)に関わる分子機構、特に不透明な初期の外部熱刺激が個体の性分化を制御する分子機構の解明を目的として行われた。本研究はクサガメをTSDモデル生物として新たに開拓し、さらに採択者が過去に研究したアメリカアリゲーターで得られた研究成果との比較解析を行い、新たなTSD分子機構の理解を目指した。各発生ステージ、及び各温度条件で孵化されたクサガメの生殖腺が2016年の夏に採取され、秋には同サンプルを用いて基礎生物学研究所、生理学研究所との共同研究によりトランスクリプトーム、メタボローム解析が開始された。クサガメは公開されているゲノム情報があまり無いため、RNAseqをリード結果からTrinityを用いてde novoアセンブリーの構築が行われた。結果、今まで不明であった様々なクサガメの遺伝子の配列（TRPを含む）が推測され、遺伝子単離など今後の研究に活用できると思われる。また、初期結果であるが遺伝子発現変動の解析を行った結果、今までTSDとの関連が未報告であった数々の遺伝子の発現が温度依存的に変動する傾向が見られ、TSDに関わる新たな候補遺伝子として検出された。今後は、アメリカアリゲーターで行った同様のトランスクリプトーム解析の結果と比較し、種特異的、または温度条件特異的な遺伝子発現を調べる予定である。メタボローム解析に関しては、CE-MSを用いて雌雄差が見られる代謝物質を網羅的に探索している最中である。現在、予備実験は無事に成功し、近々にCE-MSの解析報告が入る見通しである。採択者は残念ながら、海外の研究室への異動により翌年度を辞退せざるを得ない。しかし、今年度のみの研究で十分に成果が得られたので、上記の予定されたデータ解析が終了次第、論文の執筆を予定する。

This study focuses on the molecular structure of Temperature-dependent sex determination (TSD) in reptiles, the specific opacity, the initial stage of external thermal stimulation, the sexual differentiation of individuals, the control of temperature-dependent sex determination (TSD), and the purpose of explaining the molecular structure. This research is based on TSD Biotech's new development and past research on new harvesters. The results of the research conducted by Kareem are based on the comparative analysis of the research results and the understanding of the molecular structure of the new TSD. Each 発生ステージ, and each temperature condition of each hatching されたクサガメのgonads が2016 summer にされ, autumn には Same サンプルをThe Institute of Basic Biology and the Institute of Physiology jointly researched the によりトランスクリプトーム and メタボロームanalysisがされた.クサガメは public information があまり无いため、RNAseqをリード results からTrinityを用いてde novoアセンブリーのconstructingが行われた. Result, today's unknown であった様々なクサガメの伝子の配array (TRPをincluded)む)がspeculationされ, 弝子単里などののutilityできると思われる for future research.また、Initial results であるが缝子発existing 変动のanalytic を行った results までTSD とのrelated がUnreported であったnumber々の伝子の発 appear が Temperature-dependent に変动する tendencies が见られ, TSD に关わる新たな candidate addendum 伝子として検出された. The results of the future analysis of the future analysisとComparison し, species-specific, または temperature condition-specific な伝子発 appear をadjusted べるpredetermined である.メタボロームANALYSIS に关しては, CE-MS いてgender difference が见られる METABOLIC MATTER をExploration している中中である. Now, I have prepared a successful report and a CE-MS analysis report. The person who picked it up has a sad memory, and the overseas research laboratory has changed his mind and resigned in the next year.しかし, this year's 10% research results, がられたので, the above notes, のpredetermined analysis, がfinal order, and the writing of the paper, する.