Development of New Chemistry-based Methods for Protein Modification and Engineering That can be Applied under Crude Cellular Conditions

开发可在原始细胞条件下应用的基于化学的蛋白质修饰和工程新方法

• 批准号: 18205020
• 负责人: HAMACHI Itaru
• 金额: $ 32.12万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18205020/
• 关键词: 細目表・生物有機化学; 細目表以外・ケミカルパイオロジー; 細胞系; 有機化学; タンパク質; ラベル化反応; 分子認識; ラベル化学反応

Chemistry-based selective labeling of an intended target protein under very complicated crude systems like cell, tissues or in vivo is an important and challenging project in chemical biology for understanding and controlling the protein functions under such really working conditions. However, it is absolutely difficult because of many obstacles. My group in this research grant successful developed three distinct and new methods to label and modify a protein of interest under crude conditions like cell lysates, live cell or in vivo by elaborately combining the sophisticated molecular recognition events with orthogonal and selective organic reactions applicable even in aqueous medium.

在细胞、组织或体内等非常复杂的原始系统中，基于化学的目标蛋白的选择性标记是化学生物学中理解和控制蛋白质在这种真实工作条件下的功能的重要和具有挑战性的项目。然而，这是绝对困难的，因为有许多障碍。在这项研究中，我的小组成功地开发了三种不同的新方法，通过精心结合复杂的分子识别事件与正交和选择性有机反应，在细胞裂解物，活细胞或体内等粗条件下标记和修饰感兴趣的蛋白质，即使在水介质中也适用。

项目成果

人工小分子によるタンパク質認識と反応

人工小分子的蛋白质识别和反应

• 发表时间: 2007
• 作者: 斉藤知来;藤木道也;大和健太郎;澤田成敏;浜地 格
• 通讯作者: 浜地 格

Effective disruption of phosphoprotein-protein surface interaction using Zn(II) dipicolylamine-based artificial receptors via two-point interaction

• DOI: 10.1021/ja056585k
• 发表时间: 2006-02-15
• 期刊: JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
• 影响因子: 15
• 作者: Ojida, A;Inoue, M;Hamachi, I
• 通讯作者: Hamachi, I

Ligand-directed tosyl chemistry for protein labeling in vivo

• DOI: 10.1038/nchembio.157
• 发表时间: 2009-05-01
• 期刊: NATURE CHEMICAL BIOLOGY
• 影响因子: 14.8
• 作者: Tsukiji, Shinya;Miyagawa, Masayoshi;Hamachi, Itaru
• 通讯作者: Hamachi, Itaru

タンパク質認識と変換のための有機化学

用于蛋白质识别和转化的有机化学

• 发表时间: 2007
• 作者: A. Saxena;R. Rai;S. -Y. Kim;M. Fujiki;M. Naito;K. Okoshi;千代 智一;三好大輔・中野修一・狩俣寿枝・井上真美子・中村かおり・魚谷有希・岡裕人・Z.-M. Wang・甲元一也・杉本直己;金藤敬一;浜地 格
• 通讯作者: 浜地 格

Molecular recognition, fluorescence sensing, and biological assay of phosphate anion derivatives using artificial Zn(II)-Dpa complexes

• DOI: 10.1039/b812374h
• 发表时间: 2009-01-01
• 期刊: CHEMICAL COMMUNICATIONS
• 影响因子: 4.9
• 作者: Sakamoto, Takashi;Ojida, Akio;Hamachi, Itaru
• 通讯作者: Hamachi, Itaru