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植物オルガネラ遺伝子発現を統御するPPR蛋白質によるRNA配列認識機構の解明

阐明控制植物细胞器基因表达的 PPR 蛋白的 RNA 序列识别机制

基本信息

批准号：
22870029
负责人：
奥田賢治
金额：
$ 2.01万
依托单位：
Chuo University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22870029/
关键词：
PPR蛋白質葉緑体遺伝子発現

项目摘要

植物オルガネラにおいて、RNA編集は転写産物中の特定のC塩基をUへと変換する。これまでに同定されたRNA編集の部位特異的因子はすべてpentathco-peptide repeat(PPR)蛋白質である。特定のPPR蛋白質機能の欠損はしばしば複数のサイトの欠損を生じる。多くの場合、これら編集サイトのシス配列は一次配列の保存性が低い。一つのPPR蛋白質が複数の編集サイトに共有される分子機構はまだよくわかっていない。我々は、互いに部分的に保存、または保存されていない標的配列を認識することが予測されるPPR蛋白質OTP82とCRR22に着目した。大腸菌発現系を用いて組み換えOTP82とCRR22を発現、精製した。組み換えOTP82は標的サイトの-15～0領域に特異的に結合した。組み換えCRR22はndhB7およびndhD5サイトの-20～0領域、およびrpoB3サイトの-17～0領域に特異的に結合した。遺伝学的データとあわせて、我々はOTP82とCRR22が葉緑体における複数の編集サイトの部位特異的因子として働くことを結論した。加えて、配列相同性を示さないシス配列へのCRR22の高親和性結合は、シス配列中におけるある特定のヌクレオチドのみがPPR蛋白質の高親和性結合に十分であることを示唆した。それゆえ、シス配列は一次配列上保存性が低くても一つのPPR蛋白質によって認識されることができると考察した。

As plant cells grow, specific C β groups in RNA editing and writing products can be changed. These are the same site-specific factors in RNA programming as the pentathco-peptide repeat(PPR) protein. Deficiencies in specific PPR protein functions arise from multiple protein deficiencies. In many cases, the preservation of the original arrangement is low. A PPR protein is encoded in multiple sets and shared by molecular mechanisms. The PPR protein OTP82 was detected by PCR. E. coli development system is developed and refined by using OTP82 and CRR22. Set up OTP82 to mark the-15 to 0 field specific combination Group CRR22 ndhB 7 ndhD 5-20 ° 0 Domain, rpoB3-17 ° 0 Domain Specific combination The result of the study is that the OPT82 and CRR22 are the most important factors in the synthesis of chloroplasts. The high affinity binding of CRR22 to PPR protein was demonstrated by sequence identity. A study of PPR protein in the primary alignment of PPR protein was conducted.

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The role of plant-specific PPR proteins in chloroplast RNA editing

植物特异性 PPR 蛋白在叶绿体 RNA 编辑中的作用

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
Photosynthesis
影响因子：
0
作者：
中益朗子;末松J信彦;木村成介;奥田賢治(第一著者)
通讯作者：
奥田賢治(第一著者)

Exploring the Molecular Mechanisms of Chloroplast RNA editing

探索叶绿体 RNA 编辑的分子机制

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hammani K;des Francs-Small CC;Takenaka M;Tanz SK;Okuda K;Shikanai T;Brennicke A;Small I.;奥田賢治(第一著者);奥田賢治(代表)
通讯作者：
奥田賢治(代表)

PPR蛋白質による複数のRNA編集サイト認識の分子機構

PPR蛋白识别多个RNA编辑位点的分子机制