植物オルガネラゲノム情報を維持するRNA編集機構の解明
植物オルガネラゲノム情報を維持するRNA編集機構の解明
批准号:
23710220
负责人:
奥田 賢治
金额:
$2.91万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012
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英文摘要
植物の細胞内小器官において、独自のゲノムを持つ葉緑体とミトコンドリアでは、RNA上でC塩基をUへと変換するRNA編集が高頻度で行われている。植物オルガネラのRNA編集についての研究では、RNA上に無数に存在するCのうち、特定のCのみが編集を受ける編集サイト認識の分子機構とそこに関わる編集装置の実体解明が課題となっている。前者の疑問はこれまでの研究から、PPR蛋白質が、個々の編集サイト周辺配列を特異的に認識していることで説明がつけられた。RNA編集に関わるPPR蛋白質の多くはそのC末端にDYWドメインと呼ばれる領域を持っている。DYWドメインはヒトRNA編集酵素の触媒部位と相同性を示す配列を含んでいることから、編集活性(CからUへの変換反応を触媒)の正体ではないかと考えられている。しかしながらDYWドメインがRNA編集に重要であるかどうかは明らかになっていない。本年度は、シロイヌナズナゲノム中に存在するDYWドメインのみを持つ蛋白質DYW1について遺伝学的に解析を行った。1)dyw1変異株についてRNA編集の状態を調べた結果、PPR蛋白質CRR4が関与する葉緑体ndhD-1サイトのRNA編集を特異的に欠損していることを明らかにした。2)dyw1変異株はcrr4変異株と同様の表現型を示すことを明らかにした。3)BIFC法により、CRR4とDYW1がin vivoで相互作用することを明らかにした。4)CRR4にDYW1を結合したCRR4-DYW1蛋白質をcrr4dyw1二重変異株で発現させた結果、野生株では40%程度のndhD-1サイトのRNA編集活性が増加回復(約90%)することを明らかにした。この成果により、長年謎となっている植物オルガネラRNA編集装置の本丸である編集酵素の正体の解明が大きく進むと考えられる。
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GCMSによるイシクラゲ(N. Commune)の湿潤に伴う光合成活性の出現過程の解析
利用GCMS分析N. Commune随湿光合活动的出现过程
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[加藤有紗, 諏訪裕一, 奥田賢治, 勝山千恵, 小池裕幸]
通讯作者:
小池裕幸
PPR蛋白質は配列相同性を示さないシス配列を伴った複数のRNA編集サイトを特異的に認識する
PPR 蛋白特异性识别具有无序列同源性的顺式序列的多个 RNA 编辑位点
DOI:
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发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[奥田賢治, 鹿内利治]
通讯作者:
鹿内利治
低温におけるイシクラゲ(Nostoc Commune)の活性回復過程
发菜公社低温活性恢复过程
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[石原征尚, 奥田賢治, 小池裕幸]
通讯作者:
小池裕幸
Nostoc commenの乾燥に伴う光合成活性の不活性化
发菜干燥导致光合活性失活
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[田中翔, 勝山千恵, 奥田賢治, 諏訪裕一, 小池裕幸]
通讯作者:
小池裕幸
人工PPR蛋白質を利用した新規な生細胞内RNAイメージング技術の開発
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批准号:25650054
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2013
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负责人:奥田 賢治
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依托单位:
植物オルガネラ遺伝子発現を統御するPPR蛋白質によるRNA配列認識機構の解明
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批准号:22870029
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$2.01万
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财政年份:2010
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负责人:奥田 賢治
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依托单位:
海外基金