多器官大型化(MOG)突然変異遺伝子の単離
多器官大型化(MOG)突然変異遺伝子の単離
多器官增大 (MOG) 突变基因的分离
批准号：
22880045
负责人：
内藤 健
金额：
$2.01万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2011
中文摘要
翻译
ケツルアズキ多器官大型化遺伝子(multi-organ gigantism : mog)の単離mogはγ線照射によって得られた劣性の突然変異遺伝子であるが,その効果は大きく,葉・茎など複数の器官が大型化し,種子サイズは約2倍に増大する.本年度は,mogをもつ栽培系統BC48に近縁野生種TC2210を3度戻し交配して得られたBC3F2系統1,559個体を用いて連鎖解析を行った.まずリョクトウのゲノムショットガンシーケンス情報と,Vigna/Glycine間のシンテニーを利用してMOG座周辺の領域に9個のSSRマーカーを作製した.マッピング集団におけるこれらのマーカーとmog表現型との連鎖解析を行ったところ,乗換えなしのマーカーが1つ得られた.しかしこのマーカーを用いてケツルアズキゲノムBACライブラリーのスクリーニングを試みたところ,ポジティブなクローンが得られなかったことから,目的の領域がライブラリーに取り込まれていないと考えられた.そこで,ダイズゲノム情報を基に,MOG座周辺のケツルアズキ遺伝子を増幅できるプライマーを設計してPCRとシーケンスを繰り返し,新たに8つのCAPs/dCAPsマーカーを設計した.その結果,候補領域はダイズゲノム上の5つの遺伝子が座乗する,約50kbの領域に相当する領域に絞り込まれた.
英文摘要
ケツルアズキ多器官大型化遺伝子(multi-organ gigantism : mog)の単離mogはγ線照射によって得られた劣性の突然変異遺伝子であるが,その効果は大きく,葉・茎など複数の器官が大型化し,種子サイズは約2倍に増大する.本年度は,mogをもつ栽培系統BC48に近縁野生種TC2210を3度戻し交配して得られたBC3F2系統1,559個体を用いて連鎖解析を行った.まずリョクトウのゲノムショットガンシーケンス情報と,Vigna/Glycine間のシンテニーを利用してMOG座周辺の領域に9個のSSRマーカーを作製した.マッピング集団におけるこれらのマーカーとmog表現型との連鎖解析を行ったところ,乗換えなしのマーカーが1つ得られた.しかしこのマーカーを用いてケツルアズキゲノムBACライブラリーのスクリーニングを試みたところ,ポジティブなクローンが得られなかったことから,目的の領域がライブラリーに取り込まれていないと考えられた.そこで,ダイズゲノム情報を基に,MOG座周辺のケツルアズキ遺伝子を増幅できるプライマーを設計してPCRとシーケンスを繰り返し,新たに8つのCAPs/dCAPsマーカーを設計した.その結果,候補領域はダイズゲノム上の5つの遺伝子が座乗する,約50kbの領域に相当する領域に絞り込まれた.
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会议论文
ケツルアズキ多器官大型化突然変異遺伝子のファインマッピング
红小豆多个器官尺寸增大的突变基因精细定位
红小豆多个器官尺寸增大的突变基因精细定位
DOI：
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发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
--
作者：
[西村崇志, 鐘ケ江倫世, 本同宏成, 奥山正幸, 森春英, 木村淳夫, 松村康生・松宮健太郎・小川晃弘, 松村康生・松宮健太郎・小川晃弘, 内藤健]
通讯作者：
内藤健
Single-cell analysis to understand gene regulatory system in crops
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批准号：23H00335
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额：$30.37万
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财政年份：2023
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负责人：内藤 健
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依托单位：
海外基金
