多器官大型化(MOG)突然変異遺伝子の単離

多器官增大 (MOG) 突变基因的分离

基本信息

批准号：
22880045
负责人：
内藤健
金额：
$ 2.01万
依托单位：
National Institute of Agrobiological Sciences
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22880045/
关键词：
Vigna属大型化ケツルアズキ QTL 突然変異

项目摘要

ケツルアズキ多器官大型化遺伝子(multi-organ gigantism : mog)の単離mogはγ線照射によって得られた劣性の突然変異遺伝子であるが,その効果は大きく,葉・茎など複数の器官が大型化し,種子サイズは約2倍に増大する.本年度は,mogをもつ栽培系統BC48に近縁野生種TC2210を3度戻し交配して得られたBC3F2系統1,559個体を用いて連鎖解析を行った.まずリョクトウのゲノムショットガンシーケンス情報と,Vigna/Glycine間のシンテニーを利用してMOG座周辺の領域に9個のSSRマーカーを作製した.マッピング集団におけるこれらのマーカーとmog表現型との連鎖解析を行ったところ,乗換えなしのマーカーが1つ得られた.しかしこのマーカーを用いてケツルアズキゲノムBACライブラリーのスクリーニングを試みたところ,ポジティブなクローンが得られなかったことから,目的の領域がライブラリーに取り込まれていないと考えられた.そこで,ダイズゲノム情報を基に,MOG座周辺のケツルアズキ遺伝子を増幅できるプライマーを設計してPCRとシーケンスを繰り返し,新たに8つのCAPs/dCAPsマーカーを設計した.その結果,候補領域はダイズゲノム上の5つの遺伝子が座乗する,約50kbの領域に相当する領域に絞り込まれた.

多器官巨大主义：mog是一种孤立的mog（mog），它是通过伽马射线获得的隐性突变基因，但其作用很大，叶子和茎等多个器官的大小增加，种子大小增加了两倍。在今年，通过将近距离的相对野生物种TC2210反向使用MOG进行了1,559 BC3F2菌株。我们首先使用约克的基因组shot弹枪序列信息和Vigna/甘氨酸之间的同步，在MOG基因座周围的区域创建了9个SSR标记。我们对映射种群中的这些标记和MOG表型进行了连锁分析。但是，在没有切换的情况下获得了一个标记。但是，当我们试图为Azul Azul基因组筛选BAC库时，我们没有获得阳性的克隆，因此，未纳入图书馆的目标区域。因此，基于有关大豆基因组的信息，设计了可以扩增MOG基因座周围BAC基因的底漆，并重复PCR和测序，并设计了八个新的CAP/DCAPS标记。结果，将候选区域缩小到相当于约50 kb的区域，其中大豆基因组上的五个基因被放置。