Establishment of a Platform for Pathogenic Virus Surveillance and Infection Risk Control Using Sewage Epidemiology in Developing Asian Countries

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年度当初に全参画研究者が仙台に集まって会議を行い、年度計画について話し合い、以下の研究を行った。研究項目１（広域アジアの下水調査に基づく多様な病原ウイルスの検出）：ベトナムのフエ大学（フエ）、スリランカのモラツワ大学（コロンボ）及びペラデニア大学（キャンディ）、バングラデシュのダッカ大学（ダッカ）、フィリピンのデ・ラサール大学（マニラ）、マレーシアのマラヤ大学（クアラルンプール）を現地の生活排水等を採取する共同研究体制を構築した。インドネシア・デンパサールとベトナム・ハノイでは下水の集水データを1時間の解像度で得られるよう依頼すると同時に、既存の降雨データや将来予測データならびにそれを対象地域においてダウンスケールしものを入手した。仙台市内、松山市内の下水処理場の下水流入水を採水した。研究項目２（ヒトに感染する可能性のある未知ウイルスの下水からの検出）：下水から検出された多様なウイルスのゲノム配列情報に基づいて、それぞれのウイルスが感染できる動物を同定する機械学習モデルの開発に着手した。本年度は、まずウイルスと宿主の相互作用を予測するための半教師付き機械学習モデルのアルゴリズムについて検討した。研究項目３（下水疫学データを感染流行モデルに適用した感染対策シナリオの最適化）：都市における感染症と人間の関係を下水によって関知するため、都市における様々なイベントデータ（例えばgoogleの人流データ）と特定サンプリング地点における下水に含まれる病原微生物濃度を関連付けるモデルの構築に取り組んでいる。また、人獣共通感染症（例えば愛玩動物経由）のモデルも併せて開発中である。また、モデル構築のために，ベトナム・フエ市におけるウイルス感染症患者数の時系列データの収集も行った。