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哺乳類受精卵で発現するトランスポゾン由来キメラmRNAの新規翻訳領域の網羅的探索

全面寻找哺乳动物受精卵中表达的转座子衍生嵌合 mRNA 的新翻译区域

基本信息

批准号：
22K20612
负责人：
本多慎之介
金额：
$ 1.83万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、哺乳類ゲノムの約40%を占めるトランスポゾンと生命最初の分化である胎盤組織の分化制御の関連を明らかにすることを目的とする。哺乳類受精卵ではトランスポゾンが多く発現し、発生過程における胎盤組織への分化に関与していると考えられている。受精卵においてトランスポゾンは下流にある宿主の遺伝子を巻き込んでキメラmRNAを転写するが、その機能や翻訳領域は未知なものが多い。トランスポゾンはゲノム上に多数存在するため、ショートリードシーケンスを用いた従来のRNA-seqでは転写産物の網羅的解析は難しい。また、キメラmRNAはスプライシングを行うことが知られており、完全長ライブラリーは未だ構築されていない。そこで、ロングリードRNA-seqによってマウスおよびウシ受精卵におけるキメラmRNAの完全長ライブラリー作製を行う。キメラmRNAの多くは5’末端の配列が変化しているため翻訳開始コドンも移動すると考えられるが、キメラmRNAの翻訳領域に関する報告は少ない。そこで、低分子翻訳阻害剤とペアリードシーケンスを用いた新手法であるGTICT-seq（Global Translation Initiation on Chimeric Transcripts sequencing）を開発することでキメラmRNAの翻訳領域を網羅的に同定する。また、マウスとウシで共通の新規翻訳領域を持つキメラmRNAについて、トランスポゾンのみをノックアウトしたマウス受精卵を作成し、発生や着床能への影響を確認する。本研究によって、従来の手法では解析が困難であったキメラmRNAの翻訳領域の解析を可能にすることで、哺乳類受精卵でのトランスポゾンの役割を解明し、家畜繁殖や医療における生殖補助技術の改善を目指す。

The purpose of this study is to clarify the relationship between the development of placenta, which accounts for approximately 40% of mammalian mammals, and the differentiation and control of placental tissue during the initial differentiation of life. Mammalian fertilized eggs are more likely to appear and develop during placental tissue differentiation. The fertilized egg contains a variety of genes, including genes from the downstream, genes from the downstream, and genes from the downstream. Most of them exist in the form of RNA-seq and are difficult to analyze. The gene expression of the mRNA is very similar to that of the gene expression of the mRNA. The complete length of mRNA is regulated by RNA-seq. The 5 'end of the mRNA is aligned with the 5' end of the mRNA and the 5 'end of the mRNA is aligned with the 5' end of the mRNA. GTICT-seq (Global Translation Initiation on Chimeric Transcripts Sequencing) is a new approach to the development of low molecular weight transcription inhibitors and the identification of transcription domains. To identify the effects of gene expression on the production, development and implantation of fertilized eggs. This study is aimed at clarifying the difficulties in analyzing the mRNA translation domain, clarifying the cleavage of mammalian fertilized eggs, and improving reproductive assistance techniques for livestock reproduction and medical treatment.