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Identification of human mitochondrial metabolome proteins

人类线粒体代谢组蛋白的鉴定

基本信息

批准号：
15390106
负责人：
KANG Dongchon
金额：
$ 9.86万
依托单位：
KYUSHU UNIVERSITY
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

(Aim) Mitochondrial DNA (mtDNA) encodes genes essential for the mitochondrial electron transfer system. Recently we proposed that mtDNA takes on a large protein-DNA complex called nucleoid and the nucleoid structure is critical for maintenance of mtDNA. Mitochondrial transcription factor A (TFAM) is a main component of the nucleoid. In this study, I aim to identify protein components of the nucleoid by LC/MS/MS.(Methods) Isolated human mitochondria were treated with a c ross-linker. After solubilization, the nucleoid was immunoprecipitated with anti-TEAM antibody. The precipitated proteins were separated on one dimensional SDS-PAGE, extracted, tripsinized, and and analyzed by LC/MS/MS.(Results)1)Potential DNA- or RNA binding proteins2)Heat shock proteins3)Ribosomal proteins4)TCA cycle related proteins5)Enzymes for β oxidation of fatty acidsAll proteins identified were classified into only 5 groups as above. These results suggest that the mitochondrial nucleoid provides a scaffold for efficient metabolism of translation, TCA cycles, and β oxidation of fatty acids.

（目的）线粒体 DNA (mtDNA) 编码线粒体电子传递系统必需的基因。最近我们提出 mtDNA 呈现出一种称为类核的大型蛋白质-DNA 复合物，类核结构对于 mtDNA 的维持至关重要。线粒体转录因子 A (TFAM) 是类核的主要成分。在这项研究中，我的目标是通过 LC/MS/MS 鉴定类核蛋白的蛋白质成分。（方法）用交联剂处理分离的人线粒体。溶解后，用抗 TEAM 抗体对类核进行免疫沉淀。沉淀的蛋白质在一维 SDS-PAGE 上分离、提取、胰酶消化并通过 LC/MS/MS 进行分析。（结果）1) 潜在的 DNA 或 RNA 结合蛋白 2) 热休克蛋白 3) 核糖体蛋白 4) TCA 循环相关蛋白 5) 脂肪酸 β 氧化酶所有鉴定的蛋白质仅分为上述 5 组。这些结果表明线粒体核仁为翻译、TCA 循环和脂肪酸 β 氧化的有效代谢提供了支架。

项目成果

期刊论文数量（42）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Alam, T.I.et al.: "Human mitochondrial DNA is packaged with TFAM"Nucleic Acids Res. 31. 1640-1645 (2003)

Alam, T.I. 等人：“人类线粒体 DNA 用 TFAM 包装”核酸研究。

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Kang, D., Hamasaki, N.: "Mitochondrial oxidative stress and mitochondrial DNA"CLin.Chem.Lab.Med.. 41. 1281-1288 (2003)

Kang, D., Hamasaki, N.：“线粒体氧化应激和线粒体 DNA”CLin.Chem.Lab.Med.. 41. 1281-1288 (2003)

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32

DOI：
10.1038/sj.cdd.4401418
发表时间：
2004-07-01
期刊：
CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
影响因子：
12.4
作者：
Sunayama, J;Ando, Y;Kitanaka, C
通讯作者：
Kitanaka, C

Architectural role of TFAM in maintenance of human mitochondrial DNA

TFAM 在维持人类线粒体 DNA 中的结构作用

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Mol.Cell.Biol. 24
影响因子：
0
作者：
Kanki;T.
通讯作者：
T.

High-sensitivity detection of the A3243G mutation of mitochondrial DNA by a combination of allele-specific PCR and peptide nucleic acid-directed PCR clamping.

DOI：
10.1373/clinchem.2004.033761
发表时间：
2004-11
期刊：
Clinical chemistry
影响因子：
9.3
作者：
M. Urata;Y. Wada;S. H. Kim;Worawan Chumpia;Y. Kayamori;N. Hamasaki;D. Kang
通讯作者：
M. Urata;Y. Wada;S. H. Kim;Worawan Chumpia;Y. Kayamori;N. Hamasaki;D. Kang