Evolution and meanings of genomic wastelands (RCRO)

基因组荒地的演变和意义（RCRO）

• 批准号: 22247037
• 负责人: HIRAI Hirohisa
• 金额: $ 28.45万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22247037/
• 关键词: RCRO; ＲＣＲＯ; 末端ヘテロクロマチン領域; サブターミナルサテライト; ブーケステージ; チンパンジー; テナガザル; ゲノム不毛地帯; subterminal satellite; 染色体; 染色体顕微切断法; ゲノムデータベース解析; 連鎖不平衡; アフリカ類人猿; 霊長類

We focused on constitutive heterochromatin (RCRO) that positively concerns to rearrangements of genome, and performed molecular dissection and estimated biological meaning of RCRO. We developed a new technique to analyze repetitive sequences and analyzed the component and construction of RCRO. Especially, subterminal satellite and alpha satellite DNA were investigated in chimpanzees, gibbons, and owl monkeys. Incredible differentiations were found in them. We found following results: 1) Gibbons have alpha satellite DNA not only at centromeres but also at telomeres. 2) Owl monkeys showed that 3 structures of alpha satellite DNA are related to change of chromosome number and one of them have some concerns with the nocturnal. 3) Chimpanzees allowed us to postulate that RCRO restrains ectopic recombinations from comparisons with results found previously. These outcomes interestingly enable us to be aware some concerns among biological evolution and chromosome reaaramgements.

我们重点研究了与基因组重排密切相关的结构性异染色质(RCRO)，并对RCRO进行了分子解剖和生物学意义的估计。我们开发了一种分析重复序列的新技术，并分析了RCRO的组成和结构。特别是对黑猩猩、长臂猿和猫头猴的亚末端卫星和α卫星DNA进行了研究。在他们身上发现了令人难以置信的差异。我们发现：1)长臂猿不仅在着丝粒上有α卫星DNA，在端粒上也有α卫星DNA。2)猫头猴α卫星DNA的3种结构与染色体数目的变化有关，其中1种与夜间活动有关。3)黑猩猩允许我们假设，RCRO抑制了异位重组，使其不能与先前发现的结果进行比较。有趣的是，这些结果使我们能够意识到生物进化和染色体重组之间的一些问题。

项目成果

Comparative Genetics of the Poly-Q Tract of Ataxin-1 and Its Binding Protein PQBP-1

Ataxin-1及其结合蛋白PQBP-1的Poly-Q束的比较遗传学

• DOI: 10.1007/s10528-011-9473-1
• 发表时间: 2012
• 期刊: Biochem Genet
• 影响因子: 2.4
• 作者: Kurosaki T;Gojobori J;Ueda S
• 通讯作者: Ueda S

セントロメアを構成する反復配列の高次構造はヒト科ではなくヒト上科の特性である

构成着丝粒的重复序列的高阶结构是原始人类超家族的特征，而不是原始人类家族的特征。

• 发表时间: 2013
• 作者: 古賀章彦;平井百合子;寺田祥子;平井啓久
• 通讯作者: 平井啓久

ニホンザルエクソーム解析～実験動物化にむけた遺伝的バックグラウンドの解明～

日本猕猴外显子组分析 - 阐明用作实验动物的遗传背景 -

• 发表时间: 2011
• 作者: 郷康広;ほか
• 通讯作者: ほか

チンパンジー3亜種における苦味受容体遺伝子ファミリーの分子進化

三个黑猩猩亚种苦味受体基因家族的分子进化

• 发表时间: 2011
• 作者: Sato;K.;早川卓志
• 通讯作者: 早川卓志

Mother-offspring overlapping duetting in gibbons

长臂猿母子重叠二重奏

• 发表时间: 2009
• 作者: Koda;H.;et al
• 通讯作者: et al