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All-Atom Analysis of Cosolvent Effect on Protein Structure through Free-Energy Calculation
通过自由能计算全原子分析共溶剂对蛋白质结构的影响
基本信息
- 批准号：26240045
- 负责人：
- 金额：$ 20.88万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
- 财政年份：2014
- 资助国家：日本
- 起止时间：2014-04-01 至 2018-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
项目成果
期刊论文数量（151）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 denaturation by five systematic urea derivatives that differ in the alkyl chain length.
铜绿假单胞菌细胞色素 c551 被五种烷基链长度不同的系统脲衍生物变性。
- DOI：10.1080/09168451.2017.1303361
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：78.Kobayashi;S.;Fujii;S.;Koga;A.;Wakai;S.,Matubayasi;N.;Sambongi;Y
- 通讯作者：Y
Hydrotropy and scattering: pre-ouzo as an extended near-spinodal region
水溶助长和散射：前茴香酒作为延伸的近旋节线区域
- DOI：10.1039/c7cp04990k
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Shimizu Seishi;Matubayasi Nobuyuki
- 通讯作者：Matubayasi Nobuyuki
Free energy analysis of cosolvent-induced denaturation through molecular dynamics simulation and energy-representation method（ポスター）
通过分子动力学模拟和能量表示方法进行共溶剂诱导变性的自由能分析（海报）
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：S.A. Crichigno;R.S. Hattori;C.A. Strussmann;and V. Cussac;山田太造・野村朋弘・井上聡,;金尾政紀;Yu Yamamori and Nobuyuki Matubayasi
- 通讯作者：Yu Yamamori and Nobuyuki Matubayasi
ナノスケールフラーレンが示す流体力学的挙動の分子シミュレーションによる解析（ポスター）
使用分子模拟分析纳米级富勒烯的流体动力学行为（海报）
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：水田 圭亮;石井 良樹;金 鋼;松林 伸幸
- 通讯作者：松林 伸幸
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Matubayasi Nobuyuki其他文献
Ensemble transformation in the fluctuation theory
涨落理论中的系综变换
- DOI：
10.1016/j.physa.2021.126430 - 发表时间：
2022 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Shimizu Seishi;Matubayasi Nobuyuki - 通讯作者：
Matubayasi Nobuyuki
Consistency of geometrical definitions of hydrogen bonds based on the two-dimensional potential of mean force with respect to the time correlation in liquid water over a wide range of temperatures
基于平均力的二维势相对于宽温度范围内液态水中的时间相关性的氢键几何定义的一致性
- DOI：
10.1016/j.molliq.2019.111603 - 发表时间：
2019 - 期刊：
- 影响因子：6
- 作者：
Kikutsuji Takuma;Kim Kang;Matubayasi Nobuyuki - 通讯作者：
Matubayasi Nobuyuki
MD-DFT Approach to the Electrical Conductivity of Ionic Liquid
离子液体电导率的 MD-DFT 方法
- DOI：
- 发表时间：
2022 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Kawada Ryo;Endo Katsuhiro;Yasuoka Kenji;Kojima Hidekazu;Matubayasi Nobuyuki;Nobuyuki Matubayasi;松林 伸幸;松林 伸幸;Nobuyuki Matubayasi;Nobuyuki Matubayasi - 通讯作者：
Nobuyuki Matubayasi
経皮電気刺激提示による歩行感覚の生成手法に関する研究
经皮电刺激行走感觉产生方法的研究
- DOI：
- 发表时间：
2015 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Shimizu Seishi;Matubayasi Nobuyuki;山田清貴，小林直仁，池井 寧，広田光一，北崎充晃 - 通讯作者：
山田清貴，小林直仁，池井 寧，広田光一，北崎充晃
構造色顔料としての球形コロイド結晶における反射の低角度依存性
作为结构彩色颜料的球形胶体晶体反射的低角度依赖性
- DOI：
- 发表时间：
2020 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Mizuta Keisuke;Ishii Yoshiki;Kim Kang;Matubayasi Nobuyuki;大貫 良輔，坂井 美紀，竹岡 敬和，吉岡 伸也 - 通讯作者：
大貫 良輔，坂井 美紀，竹岡 敬和，吉岡 伸也
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{{ truncateString('Matubayasi Nobuyuki', 18)}}的其他基金
Exploring a Guideline for Inhibiting the Peptide Aggregation through All-Atom Analysis of Cosolvent Effect
通过共溶剂效应的全原子分析探索抑制肽聚集的指导方针
- 批准号：
19H04206 - 财政年份：2019
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Spatial-Decomposition Analysis of Transport Coefficients
传输系数的空间分解分析
- 批准号：
15K13550 - 财政年份：2015
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
相似海外基金
共溶媒効果の全原子モデリングに基づくタンパク質構造安定性の制御指針探索
基于共溶剂效应的全原子模型寻找蛋白质结构稳定性的控制指南
- 批准号：
23K27313 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
共溶媒分子動力学計算を用いた薬剤標的タンパク質の選抜と環状ペプチド設計の同時実行
使用共溶剂分子动力学计算同时执行药物靶蛋白选择和环肽设计
- 批准号：
23K28185 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
分子動力学と分光実験に基づく膜透過現象に対する共溶媒効果の究明
基于分子动力学和光谱实验研究共溶剂对膜渗透现象的影响
- 批准号：
23K26617 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
All-Atom Analysis of Cosolvent Effects in Free Energetics of Proteins
蛋白质自由能中共溶剂效应的全原子分析
- 批准号：
23H02622 - 财政年份：2023
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidating the cosolvent effects on membrane permeability based on molecular dynamics and spectroscopy
基于分子动力学和光谱学阐明共溶剂对膜渗透性的影响
- 批准号：
23H01924 - 财政年份：2023
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
In Situ Remediation of DNAPLs by coupling cosolvent flushing and hydrogen peroxide: contribution of reductive reactions on contaminant transformation
通过耦合共溶剂冲洗和过氧化氢对 DNAPL 进行原位修复：还原反应对污染物转化的贡献
- 批准号：
RGPIN-2015-04850 - 财政年份：2021
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
In Situ Remediation of DNAPLs by coupling cosolvent flushing and hydrogen peroxide: contribution of reductive reactions on contaminant transformation
通过耦合共溶剂冲洗和过氧化氢对 DNAPL 进行原位修复：还原反应对污染物转化的贡献
- 批准号：
RGPIN-2015-04850 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
Verification of the hydrophobic interaction hypothesis in protein structural stability and theoretical/experimental study on cosolvent effects
蛋白质结构稳定性中疏水相互作用假说的验证及共溶剂效应的理论/实验研究
- 批准号：
20K05431 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Improvement of cosolvent MD which enables the systematic search of binding sites and the novel screening way of drug candidates
共溶剂MD的改进使得能够系统地搜索结合位点和候选药物的新颖筛选方式
- 批准号：
19J00878 - 财政年份：2019
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
In Situ Remediation of DNAPLs by coupling cosolvent flushing and hydrogen peroxide: contribution of reductive reactions on contaminant transformation
通过耦合共溶剂冲洗和过氧化氢对 DNAPL 进行原位修复：还原反应对污染物转化的贡献
- 批准号：
RGPIN-2015-04850 - 财政年份：2019
- 资助金额：
$ 20.88万 - 项目类别：
Discovery Grants Program - Individual