Analysis of gene expression associated with inflammatory bowel disease using cDNA microarray

使用 cDNA 微阵列分析与炎症性肠病相关的基因表达

• 批准号: 12470249
• 负责人: SASAKI Iwao
• 金额: $ 9.22万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-12470249/
• 关键词: intestinal flora; epithelial cells; inflammatory bowel disease; CRP-ductin; microarray; ulcerative colitis; Crohn's disease; クローン癌

1、腸内細菌導入モデルのマイクロアレイによる解析データ解析にBRB Array ToolsをNCBI Dr. Amy Peng Lamの許可をうけ入手した。有意と思われる遺伝子を40クラスターに分類し解析を行った。その結果、無菌マウスへの腸内細菌導入によって上皮細胞で影響を受ける遺伝子群は、インターフェロン関連遺伝子、細胞骨格遺伝子、アポトーシス関連遺伝子、エネルギー代謝関連遺伝子、細胞増殖関連遺伝子、免疫関係シグナル伝達遺伝子など多岐に及ぶことが明らかになった。2、ヒト大腸上皮細胞を用いたマイクロアレイ解析手術摘出標本より大腸癌症例肉眼的正常部、潰瘍正大腸炎炎症部、クローン病炎症部を各2症例づつ採取し上皮細胞を分離、RNAを抽出してCodeLinkオリゴDNAマイクロアレイを行った。マウスと同様にBRB Array Toolsを用いクラスター解析を行ったところ、マウスの腸内細菌導入における上皮細胞の変化と同様様々な遺伝子群の発現が関与する。特徴的なことは、ヒト炎症性腸疾患では上皮の遺伝子発現からみてもたとえ疾患が同じであってもおそらくは検体採取時の病態によってHeterogeneousであることが証明された。3、個別遺伝子の機能解析炎症性腸疾患で上皮細胞で強発現するdesmoglein2、voltage-dependent anion channel、pleckstrin、deleted malignant brain tumor 1、resistin-like moleculeβ、HIP/PAPなどの遺伝子発現と誘導メカニズムについて件討した。これらの分子は疾患特異的ではないが、定量評価によって対照と異なり病態を反映しているものと考えられた。

1, the intestinal bacteria import モ デ ル の マ イ ク ロ ア レ イ に よ る parsing デ ー タ parsing に BRB Array Tools を NCBI Dr. Amy Peng Lam の licensing を う け of し た. Intentional と thought われる left 伝 child を40 ラスタ ラスタ に に に classification <s:1> analysis を line った. そ の results, sterile マ ウ ス へ の intestinal bacteria import に よ っ て epithelial cells で を by け る heritage 伝 subgroup は, イ ン タ ー フ ェ ロ ン masato even heritage 伝 son, cell skeleton heritage 伝, ア ポ ト ー シ ス masato even heritage 伝, エ ネ ル ギ ー metabolic masato even heritage 伝, masato cells raised colonization even heritage 伝 son, immune masato シ グ ナ ル 伝 of heritage 伝 son な ど toki に and ぶ こ と が Ming Youdaoplaceholder0 になった. 2, ヒ を ト colon epithelial cells with い た マ イ ク ロ ア レ イ parsing operation pick the specimen よ り colon cancer cases of the normal to the naked eye ministry inflammation, ulcer zhengda enteritis, ク ロ ー ン を inflammation disease department each 2 cases づ つ take し を epithelial cell separation, RNA を spare し て CodeLink オ リ ゴ DNA マ イ ク ロ ア レ イ を line っ た. マ ウ ス と with others に BRB Array Tools を with い ク ラ ス タ ー parsing line を っ た と こ ろ, マ ウ ス の intestinal bacteria import に お け る の epithelial cells - the と with others in others in 々 な heritage 伝 subgroup の 発 now が masato and す る. Of 徴 な こ と は, ヒ ト inflammatory bowel disorders で は epithelial の heritage 伝 son 発 now か ら み て も た と が え disease with じ で あ っ て も お そ ら く は 検 body take の morbidly に よ っ て Heterogeneous で あ る こ と が prove さ れ た. 3. In individual cases of 伝 subintestinal function analysis of inflammatory bowel disease, で epithelial cells で strongly develop するdesmoglein2, volvoltage dependent anion channel, pleckstrin, deleted malignant brain tumor 1, resistin - like molecule beta, HIP/PAP な ど の posthumous son 伝 発 now と induced メ カ ニ ズ ム に つ い て welcome し た. こ れ ら の molecular は disease specific で は な い が, quantitative evaluation of 価 に よ っ て polices according to と different な り pathological を reflect し て い る も の と exam え ら れ た.

项目成果

福島浩平: "Inflammatory bowel disease-associated gene expression and display in interfinal epithelial cells by dipperential cDNA screening"Inflammatory Bowel Disease. (in press). (2003)

Kohei Fukushima：“通过二元 cDNA 筛选与炎症性肠病相关的基因在间质上皮细胞中的表达和展示”炎症性肠病（2003 年）。

小川 仁: "Increased expression of HIP/PAP and Reg III in human and experimental inflammatory bowel disease"Inflammatory Bowel disease. (in press). (2003)

Hitoshi Okawa：“人类和实验性炎症性肠病中 HIP/PAP 和 Reg III 的表达增加”炎症性肠病（出版中）。

福島浩平 他: "Decreased expression of syncollin mRNA in colonic epithelial cells of bacteria-challenged germ-free mice and ulcerative colitis"Gastroenterology. 124 Supple 1. A329 (2003)

Kohei Fukushima 等人：“细菌攻击的无菌小鼠和溃疡性结肠炎的结肠上皮细胞中 Syncollin mRNA 的表达降低”Gastroenterology 124 Supple 1. A329 (2003)

福島浩平 他: "Non-pathogenic bacteria modulates colonic epithelial gene expression in germ-free mice."Scand J Gastroenterol.. 38. 626-634 (2003)

Kohei Fukushima 等人：“非致病性细菌调节无菌小鼠的结肠上皮基因表达。”Scand J Gastroenterol.. 38. 626-634 (2003)

Fukushima K., Funayama Y., Ogawa H., Takahashi K., Sasaki I.: "Decreased expression of syncollin mRNA in colonic epithelial cells of bacteria-challenged germ-free mice and ulcerative colitis"Gastroenterology. 124 ; (4) Supple 1. A329 (2003)

Fukushima K.、Funayama Y.、Okawa H.、Takahashi K.、Sasaki I.：“细菌攻击的无菌小鼠和溃疡性结肠炎的结肠上皮细胞中 Syncollin mRNA 的表达降低”胃肠病学。